Навыки clinpgx-database
D

clinpgx-database

Безопасно ⚙️ Внешние команды🌐 Доступ к сети📁 Доступ к файловой системе

Запрос к базе данных фармакогеномики ClinPGx

Также доступно от: davila7

Получите доступ к ClinPGx для получения данных фармакогеномики, включая взаимодействия генов и лекарств, рекомендации CPIC и информацию о функции аллелей. Этот навык поддерживает персонализированную медицину, предоставляя клиническую поддержку принятия решений для дозирования лекарств на основе генотипа.

Поддерживает: Claude Codex Code(CC)
🥉 73 Бронза
1

Скачать ZIP навыка

2

Загрузить в Claude

Перейдите в Settings → Capabilities → Skills → Upload skill

3

Включите и начните использовать

Протестировать

Использование «clinpgx-database». Получить информацию о гене CYP2C19 и его связи с клопидогрелом

Ожидаемый результат:

  • CYP2C19 - это фермент цитохрома P450, участвующий в метаболизме лекарств
  • Пара CYP2C19-клопидогрел имеет рекомендацию CPIC уровня A
  • Плохим метаболизаторам следует назначать альтернативную антитромбоцитарную терапию
  • Связанные аллели: *2 (отсутствие функции), *3 (отсутствие функции), *17 (повышенная функция)

Использование «clinpgx-database». Каковы рекомендации CPIC по дозированию варфарина в зависимости от генотипа CYP2C9?

Ожидаемый результат:

  • CPIC предоставляет рекомендации по дозированию варфарина с учётом генотипа
  • Аллели CYP2C9*2 и *3 связаны со сниженной активностью фермента
  • Пациентам с аллелями сниженной функции требуются более низкие дозы варфарина
  • Генотип VKORC1 также влияет на требования к дозированию

Использование «clinpgx-database». Найдите все клинически действенные фармакогены с рекомендациями CPIC уровня A

Ожидаемый результат:

  • CYP2D6-кодеин (избегать у сверхбыстрых метаболизаторов)
  • CYP2C19-клопидогрел (альтернативная терапия для плохих метаболизаторов)
  • TPMT-азатиоприн (снижение дозы для промежуточных/плохих метаболизаторов)
  • DPYD-фторпиримидины (корректировка дозы на основе показателя активности)

Аудит безопасности

Безопасно
v4 • 1/17/2026

All 376 static findings are FALSE POSITIVES. The skill is a legitimate pharmacogenomics database API client accessing the public ClinPGx API (api.clinpgx.org). The static analyzer misidentified Markdown code fences (using backticks) as shell command execution, gene function descriptions as cryptographic algorithms, and clinical decision support tool references as system reconnaissance. Network calls are to a known public API, file writes are for caching API results, and there is no malicious code present.

4
Просканировано файлов
3,859
Проанализировано строк
3
находки
4
Всего аудитов

Факторы риска

⚙️ Внешние команды (3)
references/api_reference.md:7-10 SKILL.md:36-38 SKILL.md:522-530
🌐 Доступ к сети (3)
references/api_reference.md:521-527 scripts/query_clinpgx.py:24-36 SKILL.md:66-72
📁 Доступ к файловой системе (2)
scripts/query_clinpgx.py:105-106 SKILL.md:484-485
Проверено: claude Посмотреть историю аудитов →

Оценка качества

64
Архитектура
90
Сопровождаемость
87
Контент
20
Сообщество
100
Безопасность
78
Соответствие спецификации

Что вы можете построить

Просмотр лекарств пациента

Проверьте генотипы пациента по назначенным лекарствам для выявления взаимодействий ген-лекарство, требующих корректировки дозы.

Анализ доказательств ген-лекарство

Запросите клинические аннотации и рекомендации CPIC для поддержки исследований в области фармакогеномики.

Создание приложений PGx

Интегрируйте API ClinPGx в электронные медицинские записи или системы поддержки принятия клинических решений.

Попробуйте эти промпты

Поиск гена 
Используйте навык ClinPGx для поиска информации о гене CYP2D6, включая его функцию и связанные с ним лекарства.
Взаимодействия лекарств 
Запросите в ClinPGx все пары ген-лекарство, связанные с клопидогрелом и CYP2C19, с информацией о рекомендациях CPIC.
Клинические рекомендации 
Получите рекомендации CPIC по назначению кодеина в зависимости от статуса метаболизатора CYP2D6.
Частоты аллелей 
Найдите данные о частоте аллелей CYP2D6 для европейского, африканского и восточноазиатского населения.

Лучшие практики

  • Всегда реализуйте ограничение скорости (задержка 0,5 секунды) при выполнении вызовов API, чтобы соблюдать лимит 2 запроса/сек
  • Кэшируйте часто используемые данные локально для сокращения вызовов API и повышения производительности
  • Проверяйте клинические решения по первичным источникам, таким как рекомендации CPIC и инструкции FDA к лекарствам

Избегать

  • Не принимайте клинические решения, основываясь исключительно на результатах API, без проверки по первичным источникам
  • Не превышайте лимит скорости API, так как это приведёт к ошибкам HTTP 429
  • Не хардкодите конфиденциальные учётные данные в клиентском коде, когда существенное использование API требует аутентификации

Часто задаваемые вопросы

Что такое ClinPGx?
ClinPGx - это комплексная база данных фармакогеномики, которая объединяет данные из PharmGKB, CPIC и PharmCAT для клинического использования.
Требуется ли аутентификация?
Для базового доступа к API аутентификация не требуется. Для существенного использования обращайтесь по адресу api@clinpgx.org.
Какие ограничения скорости применяются?
API допускает максимум 2 запроса в секунду. Реализуйте задержку 500 мс между запросами.
Какие гены охватываются?
Ключевые фармакогены включают ферменты CYP450 (CYP2D6, CYP2C19, CYP2C9), транспортёры (SLCO1B1) и другие, такие как TPMT и DPYD.
Какие уровни доказательности доступны?
Уровни доказательности варьируются от 1A (рекомендации CPIC/FDA) до Уровня 4 (описания случаев), при этом 1A - наивысшее качество.
Можно ли это использовать для клинических решений?
Навык предоставляет данные для исследований и поддержки принятия решений. Всегда проверяйте клинические решения по первичным источникам.

Сведения для разработчиков

Автор

K-Dense-AI

Лицензия

CC-BY-SA-4.0

Репозиторий

https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/clinpgx-database

Ссылка

main

Структура файлов

📁 references/

📄 api_reference.md

📁 scripts/

📄 query_clinpgx.py

📄 SKILL.md