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Seguro 🌐 Acesso à rede

Pesquisar literatura biomédica no PubMed

Também disponível em: davila7

Pesquisadores precisam de acesso eficiente à literatura biomédica para revisões sistemáticas e pesquisas baseadas em evidências. Esta skill fornece documentação abrangente para consultas no PubMed, incluindo operadores booleanos, termos MeSH e acesso à API E-utilities.

Suporta: Claude Codex Code(CC)
📊 70 Adequado
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A utilizar "pubmed-database". Busque revisões sistemáticas sobre aprendizado de máquina em imagens médicas publicadas em 2023-2024

Resultado esperado:

  • Query: (machine learning[mh] OR deep learning[tiab] OR artificial intelligence[tiab]) AND (medical imaging[mh] OR radiology[tiab] OR diagnostic imaging[tiab]) AND systematic review[pt] AND 2023:2024[dp]
  • Resultado: 247 artigos encontrados
  • Principais correspondências incluem:
  • - Deep learning in radiology: a systematic review (PMID: 38012345)
  • - Machine learning for medical image analysis: systematic review (PMID: 37987654)

A utilizar "pubmed-database". Encontre ensaios clínicos sobre metformina para diabetes tipo 2 com desfechos cardiovasculares

Resultado esperado:

  • Query: (metformin[nm] OR biguanides[mh]) AND diabetes mellitus, type 2[mh] AND cardiovascular diseases[mh] AND randomized controlled trial[pt] AND hasabstract[text]
  • Resultado: 89 artigos encontrados
  • Estudos principais:
  • - Metformin and cardiovascular outcomes in type 2 diabetes (PMID: 36543210)
  • - Long-term cardiovascular effects of metformin (PMID: 36123456)

Auditoria de Segurança

Seguro
v5 • 1/21/2026

All static findings are false positives. This is a documentation-only skill providing reference materials for PubMed queries. The detected patterns (backticks, API key placeholders, URLs) are markdown documentation elements, not executable code. The skill contains no executable code, no network calls, and no credential access.

5
Arquivos analisados
5,088
Linhas analisadas
1
achados
5
Total de auditorias

Fatores de risco

🌐 Acesso à rede (5)
references/api_reference.md:8 references/api_reference.md:295 SKILL.md:128 SKILL.md:453 SKILL.md:454
Auditado por: claude Ver Histórico de Auditoria →

Pontuação de qualidade

45
Arquitetura
90
Manutenibilidade
87
Conteúdo
23
Comunidade
100
Segurança
91
Conformidade com especificações

O Que Você Pode Construir

Revisão Sistemática da Literatura

Construir estratégias de busca abrangentes usando operadores booleanos, termos MeSH e filtros para encontrar todos os estudos relevantes para revisões sistemáticas e meta-análises.

Consultas de Pesquisa Biomédica

Buscar artigos sobre doenças específicas, tratamentos ou interações medicamentosas usando tags de campo precisas e vocabulário controlado.

Extração Programática de Dados

Construir fluxos de trabalho automatizados para pesquisar no PubMed e extrair metadados de artigos usando a API E-utilities para projetos de pesquisa em larga escala.

Tente Estes Prompts

Busca Básica de Artigos 
Encontre artigos recentes sobre {topic} publicados em 2024. Use termos MeSH apropriados e tags de campo para limitar os resultados a artigos de pesquisa em inglês.
Busca de Ensaios Clínicos 
Busque ensaios clínicos randomizados comparando {treatment_a} versus {treatment_b} para {condition} de 2020 a 2024. Inclua apenas artigos com texto completo gratuito.
Consulta para Revisão Sistemática 
Use o framework PICO para construir uma estratégia de busca abrangente para {clinical_question}. Inclua todos os sinônimos relevantes e termos MeSH.
Busca em Lote via API 
Escreva um script Python usando a API E-utilities para buscar artigos que correspondam a {criteria}, recuperar até 500 PMIDs usando o servidor de histórico e exportar os resultados para um arquivo CSV com PMID, título e resumo.

Melhores Práticas

  • Comece com buscas amplas usando termos MeSH, depois refine com tags de campo e filtros para precisão
  • Inclua sinônimos e termos alternativos para capturar toda a literatura relevante
  • Use o servidor de histórico (usehistory=y) para conjuntos de resultados grandes que excedam 500 artigos
  • Obtenha uma chave de API do NCBI para limites de taxa mais altos (10 requisições/segundo vs 3)

Evitar

  • Usar apenas termos de texto livre sem termos MeSH perde artigos indexados
  • Executar muitas requisições pequenas de API em vez de operações em lote desperdiça limites de taxa
  • Não armazenar resultados em cache leva a chamadas de API redundantes e fluxos de trabalho mais lentos
  • Ignorar o mapeamento automático de termos pode produzir resultados de busca inesperados

Perguntas Frequentes

Qual é a diferença entre termos MeSH e buscas por palavras de texto?
Termos MeSH buscam no índice de vocabulário controlado onde todos os artigos são marcados manualmente. Buscas por palavras de texto apenas correspondem a termos que aparecem nos títulos e resumos. Combinar ambos fornece cobertura abrangente.
Como obtenho uma chave de API para o PubMed E-utilities?
Registre-se para uma conta gratuita do NCBI em ncbi.nlm.nih.gov, depois visite as configurações da sua conta para gerar uma chave de API. Inclua-a nas requisições com o parâmetro api_key para limites de taxa mais altos.
Quais são os limites de taxa do PubMed?
Sem chave de API: 3 requisições por segundo. Com chave de API: 10 requisições por segundo. Sempre inclua um cabeçalho User-Agent descritivo em suas requisições.
Como lidar com conjuntos de resultados grandes com milhares de artigos?
Use o servidor de histórico: primeiro chame ESearch com usehistory=y para armazenar resultados, depois use os parâmetros WebEnv e QueryKey com ESummary ou EFetch para recuperar dados em lotes de até 500 registros por requisição.
Quais formatos de exportação estão disponíveis para resultados do PubMed?
Formatos comuns incluem MEDLINE (texto), XML (dados estruturados), RIS (gerenciadores de referência) e NBIB (EndNote). Use os parâmetros rettype e retmode para especificar o formato desejado.
Como encontro artigos que citam um artigo específico?
Use o utilitário ELink com dbfrom=pubmed, db=pubmed e cmd=cite. Isso retorna PMIDs de artigos que citam o artigo de entrada. Note que os dados de citação podem não estar completos para publicações muito recentes.

Detalhes do Desenvolvedor

Licença

Unknown

Repositório

https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/pubmed-database

Referência

main

Estrutura de arquivos

📁 references/

📄 api_reference.md

📄 common_queries.md

📄 search_syntax.md

📄 SKILL.md