Habilidades opentrons-integration
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opentrons-integration

Seguro ⚙️ Comandos externos

Automatizar fluxos de trabalho de laboratório com robôs Opentrons

Também disponível em: davila7

A escrita de protocolos de automação de laboratório requer conhecimento especializado de APIs de robótica e procedimentos de manipulação de líquidos. Esta skill oferece modelos prontos para uso e orientação abrangente para criar protocolos que controlam robôs de manipulação de líquidos Opentrons.

Suporta: Claude Codex Code(CC)
🥉 75 Bronze
1

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2

Upload no Claude

Vá em Configurações → Capacidades → Skills → Upload skill

3

Ative e comece a usar

Testar

A utilizar "opentrons-integration". Crie um protocolo para plaqueamento de culturas bacterianas de um reservatório de 12 poços para uma placa de 96 poços

Resultado esperado:

  • Protocolo Opentrons completo gerado com:
  • - Pipeta P300 de canal único no suporte esquerdo
  • - Reservatório de 12 poços no slot D2 da deck
  • - Placa de 96 poços no slot D3
  • - Rack de ponteiras de 200µL no slot D1
  • - Transferência de 50µL de cada poço do reservatório para as colunas da placa
  • - Troca automática de ponteiras entre amostras

A utilizar "opentrons-integration". Escreva um protocolo para preparação de amostras de ELISA em 8 fileiras

Resultado esperado:

  • Protocolo de preparação de ELISA criado:
  • - Carregados 8 racks de ponteiras e 2 reservatórios de reagentes
  • - Pipeta P300 de múltiplos canais para operações por fileira
  • - Adicionado 100µL de anticorpo de coating em todos os 96 poços
  • - Realizados 3 passos de lavagem entre incubações
  • - Incluídos atrasos de incubação de 5 minutos

Auditoria de Segurança

Seguro
v4 • 1/17/2026

All 360 static findings are false positives. The analyzer misinterpreted markdown backticks as shell commands, API version strings as weak crypto, and lab equipment terms as reconnaissance. This is a legitimate lab automation skill containing Opentrons protocol templates for liquid handling robots.

6
Arquivos analisados
1,486
Linhas analisadas
1
achados
4
Total de auditorias

Fatores de risco

⚙️ Comandos externos (1)
references/api_reference.md:9-346
Auditado por: claude Ver Histórico de Auditoria →

Pontuação de qualidade

64
Arquitetura
100
Manutenibilidade
85
Conteúdo
21
Comunidade
100
Segurança
87
Conformidade com especificações

O Que Você Pode Construir

Automatizar configuração de PCR

Criar protocolos para configurar reações de PCR com distribuição de master mix e programação de termociclador

Realizar diluições em série

Gerar protocolos precisos de diluição em série em placas de 96 poços para desenvolvimento de ensaios

Controlar múltiplos módulos

Integrar módulos de temperatura, magnético e heater-shaker em fluxos de trabalho complexos

Tente Estes Prompts

Estrutura básica de protocolo 
Escreva um protocolo Opentrons que transfira 100µL do poço A1 para B1 usando uma pipeta P300
Fluxo de trabalho de configuração de PCR 
Crie um protocolo para configurar 24 reações de PCR com master mix e amostras de DNA usando o termociclador
Série de diluição em série 
Escreva um protocolo para diluições em série 1:2 em uma fileira de placa de 96 poços, começando com 200µL de estoque
Integração de múltiplos módulos 
Crie um protocolo usando módulo de temperatura para incubação de amostras a 37°C seguido de separação com contas magnéticas

Melhores Práticas

  • Sempre simule protocolos antes de executar em hardware real
  • Use etiquetas significativas para labware para simplificar a solução de problemas
  • Inclua comentários no protocolo para passos complexos e requisitos de tempo

Evitar

  • Usar posições absolutas codificadas em vez de referências de poços
  • Misturar diferentes níveis de API no mesmo protocolo
  • Esquecer de considerar o consumo de ponteiras em protocolos longos

Perguntas Frequentes

Qual é a diferença entre OT-2 e Flex?
Flex é o modelo mais recente com capacidade expandida de deck e convenções de nomenclatura diferentes de pipetas. Use robotType nos requisitos para especificar.
Como lidar com líquidos viscosos?
Ajuste as taxas de fluxo com pipette.flow_rate.aspirate e dispense, use velocidades mais lentas para transferências precisas de amostras viscosas.
Posso usar labware personalizado?
Sim, use load_labware_from_definition com definições de labware JSON criadas na ferramenta Opentrons Labware Creator.
Como pausar para passos manuais?
Use protocol.pause com uma mensagem para pausar a execução até que o usuário continue, ou protocol.delay para esperas cronometradas.
Qual é a versão mais recente da API?
API Level 2.19 é a atual a partir de 2024. Sempre especifique a versão estável mais recente nos metadados do seu protocolo.
Como otimizar o uso de ponteiras?
Use new_tip='once' para múltiplas transferências da mesma fonte, e return_tip para reutilizar ponteiras dentro de um protocolo.

Detalhes do Desenvolvedor

Licença

MIT

Repositório

https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/opentrons-integration

Referência

main

Estrutura de arquivos

📁 references/

📄 api_reference.md

📁 scripts/

📄 basic_protocol_template.py

📄 pcr_setup_template.py

📄 serial_dilution_template.py

📄 SKILL.md