Habilidades adaptyv
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adaptyv

Baixo Risco ⚡ Contém scripts🌐 Acesso à rede🔑 Variáveis de ambiente

Submeter sequências de proteínas para validação em laboratório em nuvem

Também disponível em: davila7

O design de proteínas requer validação experimental. A Adaptyv oferece acesso a uma API para um laboratório em nuvem para testes automatizados de afinidade de ligação, níveis de expressão, estabilidade térmica e atividade enzimática. Obtenha resultados experimentais em aproximadamente 21 dias.

Suporta: Claude Codex Code(CC)
📊 69 Adequado
1

Baixar o ZIP da skill

2

Upload no Claude

Vá em Configurações → Capacidades → Skills → Upload skill

3

Ative e comece a usar

Testar

A utilizar "adaptyv". Submit two antibody sequences for binding assays against PD-L1

Resultado esperado:

  • Experiment submitted successfully
  • Experiment ID: exp_new123xyz
  • Status: submitted
  • Estimated completion: 2025-02-07
  • Target: Human PD-L1

A utilizar "adaptyv". What is the status of my binding experiment?

Resultado esperado:

  • Experiment: exp_abc123xyz
  • Status: processing
  • Progress: 65%
  • Current stage: assay
  • Updated: 2025-01-25T14:30:00Z

A utilizar "adaptyv". Download and summarize the binding results

Resultado esperado:

  • Results downloaded: exp_abc123xyz_results.json
  • Sequences tested: 12
  • Top binder: variant_7 (KD: 0.8 nM)
  • Confidence: high (R-squared: 0.98)

Auditoria de Segurança

Baixo Risco
v4 • 1/17/2026

All 304 static findings are FALSE POSITIVES. The skill is legitimate scientific software for protein research. Scanner patterns triggered on: FASTA format headers (protein sequences in markdown code blocks), API calls to official platform endpoints, environment variable usage for API keys (recommended practice), and scientific notation (e.g., binding affinity values like 1.2e-9). No malicious behavior confirmed.

6
Arquivos analisados
3,608
Linhas analisadas
3
achados
4
Total de auditorias

Fatores de risco

⚡ Contém scripts (3)
SKILL.md:1-113 reference/api_reference.md:1-309 reference/examples.md:1-914
🌐 Acesso à rede (2)
SKILL.md:52-69 reference/examples.md:79-83
🔑 Variáveis de ambiente (2)
SKILL.md:22-25 reference/examples.md:13-16
Auditado por: claude Ver Histórico de Auditoria →

Pontuação de qualidade

38
Arquitetura
100
Manutenibilidade
87
Conteúdo
29
Comunidade
90
Segurança
91
Conformidade com especificações

O Que Você Pode Construir

Teste de afinidade de anticorpos

Submeter variantes de anticorpos para medir afinidade de ligação contra antígenos alvos e identificar candidatos de alta afinidade.

Validação de otimização de sequências

Usar ferramentas computacionais para projetar variantes de proteínas, então validar experimentalmente as previsões de expressão e estabilidade.

Triagem de atividade catalítica

Triar variantes de enzimas para melhorar turnover, afinidade por substrato e sensibilidade a inibidores.

Tente Estes Prompts

Submeter ensaio de ligação 
Submeter minhas sequências de anticorpos à Adaptyv para ensaios de ligação contra PD-L1 humano. As sequências estão em formato FASTA e quero medir valores de KD.
Verificar status do experimento 
Verificar o status do experimento exp_abc123xyz e me informar o estágio atual e data estimada de conclusão.
Baixar resultados 
Baixar os resultados do experimento exp_abc123xyz e analisar as medições de ligação em uma tabela mostrando sequências, KD, kon e valores de koff.
Executar pipeline de otimização 
Otimizar minhas sequências de proteínas usando NetSolP e SolubleMPNN, então submeter os 50 melhores candidatos à Adaptyv para teste de expressão com notificação de webhook.

Melhores Práticas

  • Pré-triar sequências com ferramentas computacionais (NetSolP, ESM) antes da submissão experimental para reduzir custos
  • Usar webhooks em vez de polling para notificações de conclusão de experimento
  • Incluir sequências selvagem ou de referência como controles em toda submissão em lote

Evitar

  • Submeter sequências sem validação - sempre executar triagem computacional primeiro
  • Fazer polling de status em vez de usar webhooks - desperdiça quota da API e adiciona atraso
  • Ignorar requisitos de formato FASTA - validar sequências localmente antes da submissão

Perguntas Frequentes

Quanto tempo leva para obter resultados?
A maioria dos experimentos entrega resultados em aproximadamente 21 dias a partir da submissão.
Como obtenho acesso à API?
Contate support@adaptyvbio.com para solicitar acesso durante o período alfa/beta.
Quais tipos de experimentos são suportados?
Ensaios de ligação (BLI), teste de expressão, estabilidade térmica (DSF) e ensaios de atividade enzimática.
Posso testar ligação contra alvos personalizados?
Sim, use o endpoint POST /targets/request para solicitar antígenos personalizados que não estão no catálogo.
Quantas sequências posso submeter?
Até 1000 experimentos por dia por organização com submissões em lote recomendadas.
Como os resultados são entregues?
Resultados disponíveis via download da API com URLs de dados brutos e métricas de qualidade incluindo pontuações de confiança.

Detalhes do Desenvolvedor

Licença

MIT

Repositório

https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/adaptyv

Referência

main

Estrutura de arquivos

📁 reference/

📄 api_reference.md

📄 examples.md

📄 experiments.md

📄 protein_optimization.md

📄 SKILL.md