스킬 uniprot-database
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uniprot-database

안전 🌐 네트워크 접근📁 파일 시스템 액세스

REST API를 통해 UniProt 단백질 데이터베이스 검색

또한 다음에서 사용할 수 있습니다: davila7

단백질 데이터베이스를 검색하고, 서열을 검색하며, 생물학적 데이터베이스 간 식별자를 매핑합니다. 이 스킬은 포괄적인 단백질 서열 및 기능 정보 리소스인 UniProt에 대한 직접적인 액세스를 제공합니다.

지원: Claude Codex Code(CC)
🥈 77 실버
1

스킬 ZIP 다운로드

2

Claude에서 업로드

설정 → 기능 → 스킬 → 스킬 업로드로 이동

3

토글을 켜고 사용 시작

테스트해 보기

"uniprot-database" 사용 중입니다. 인간 헤모글로빈 단백질 검색

예상 결과:

  • 검토된 인간 헤모글로빈 항목 3개 발견:
  • - P69905 - 헤모글로빈 서브유닛 알파 (HBA1) - 142 aa
  • - P68871 - 헤모글로빈 서브유닛 베타 (HBB) - 147 aa
  • - P02100 - 헤모글로빈 서브유닛 엡실론 (HBE1) - 147 aa

"uniprot-database" 사용 중입니다. BRCA1 단백질 서열 얻기

예상 결과:

  • P38398 - 유방암 유형 1 감수성 단백질 (BRCA1)
  • 유기체: Homo sapiens (인간)
  • 길이: 1863 아미노산
  • 하류 분석을 위해 FASTA 형식으로 검색됨

"uniprot-database" 사용 중입니다. UniProt를 RefSeq로 매핑

예상 결과:

  • UniProt 접근 번호 2개를 RefSeq 단백질 ID로 매핑:
  • P01308 -> NP_000198.1
  • P04637 -> NP_000537.3

보안 감사

안전
v4 • 1/17/2026

Legitimate bioinformatics skill providing access to UniProt, the trusted public protein database. All 616 static findings are false positives. The scanner misinterpreted markdown code block delimiters as shell commands and flagged standard HTTP requests to rest.uniprot.org as network activity. No malicious patterns, data exfiltration, or security threats exist in the codebase.

8
스캔된 파일
7,974
분석된 줄 수
2
발견 사항
4
총 감사 수

위험 요인

🌐 네트워크 접근 (6)
scripts/uniprot_client.py:31 scripts/uniprot_client.py:61 scripts/uniprot_client.py:83 references/api_examples.md:12 references/api_examples.md:32 SKILL.md:54
📁 파일 시스템 액세스 (2)
references/api_examples.md:105 references/api_examples.md:395
감사자: claude 감사 이력 보기 →

품질 점수

68
아키텍처
100
유지보수성
85
콘텐츠
21
커뮤니티
100
보안
91
사양 준수

만들 수 있는 것

단백질 서열 검색

하류 분석을 위해 유전자 이름 또는 접근 번호로 단백질 서열 조회

데이터베이스 식별자 매핑

UniProt, PDB, RefSeq, Ensembl 형식 간에 단백질 식별자 변환

단백질 주석 탐색

교육을 위해 GO 용어, 기능 설명 및 도메인 정보에 접근

이 프롬프트를 사용해 보세요

기본 단백질 검색 
UniProt에서 인간 인슐린 단백질을 찾아 접근 번호와 서열을 FASTA 형식으로 반환
유전자별 쿼리 
검토된 인간 BRCA1 단백질을 검색하고 유전자 이름, 유기체, 길이 표시
ID 매핑 
이 UniProt 접근 번호 P01308와 P04637을 해당 PDB 항목으로 매핑
복잡한 쿼리 
PDB 구조를 가진 키나제 활성도가 있는 모든 검토된 인간 막 단백질 찾기

모범 사례

  • 데이터 품질을 보장하려면 Swiss-Prot 항목에 reviewed:true 필터 사용
  • 대역폭과 처리 시간 줄이기 위해 필요한 필드만 요청
  • API 속도 제한을 존중하기 위해 배치 요청 사이에 지연 구현

피하기

  • 대규모 쿼리에 모든 필드를 요청하지 마세요; 필요한 필드만 지정
  • 속도 제한을 무시하지 마세요; 배치 작업에 적절한 지연 구현
  • 큐레이션 차이를 이해하지 않고 Swiss-Prot와 TrEMBL을 혼합하지 마세요

자주 묻는 질문

UniProt란 무엇입니까?
UniProt는 유럽생물정보학연구소에서 유지 관리하는 주요 포괄적인 단백질 서열 및 기능 정보 데이터베이스입니다.
어떤 형식이 지원됨니까?
FASTA, JSON, TSV, XML, Excel, RDF, TXT, GFF 형식이 다양한 사용 사례에 따라 지원됩니다.
Swiss-Prot와 TrEMBL의 차이점은 무엇입니까?
Swiss-Prot 항목은 수동으로 큐레이션되고 검토됩니다; TrEMBL 항목은 계산적으로 예측된 주석입니다.
한 번에 얼마나 많은 단백질을 검색할 수 있습니까?
검색 쿼리는 요청당 최대 500개의 결과를 반환합니다; 더 큰 데이터 세트의 경우 스트리밍이나 페이지 매김을 사용하세요.
ID 매핑 결과는 얼마나 오래 제공됩니까?
ID 매핑 작업 결과는 7일 동안 저장된 후 자동으로 삭제됩니다.
API 키가 필요합니까?
기본 UniProt API 사용에는 API 키가 필요하지 않습니다; 이 서비스는 학술 및 상업적 사용에 무료입니다.

개발자 세부 정보

작성자

K-Dense-AI

라이선스

MIT

리포지토리

https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/uniprot-database

참조

main

파일 구조

📁 references/

📄 api_examples.md

📄 api_fields.md

📄 id_mapping_databases.md

📄 query_syntax.md

📁 scripts/

📄 uniprot_client.py

📄 EVALUATION_OUTPUT.json

📄 SKILL.md