연구자들은 분자 특성과 화학 구조에 대한 빠른 접근이 필요합니다. 이 기술은 1억 1천만 개 이상의 화합물 데이터베이스인 PubChem에 연결하여 즉각적인 chemoinformatics 조회를 제공합니다.
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"pubchem-database" 사용 중입니다. 카페인을 검색하고 주요 특성 표시
예상 결과:
- 화합물: 카페인 (CID: 2519)
- 분자식: C8H10N4O2
- 분자량: 194.19 g/mol
- SMILES: CN1C=NC2=C1C(=O)N(C(=O)N2C)C
- LogP: -0.07
- TPSA: 58.44 Ų
"pubchem-database" 사용 중입니다. 아스피린과 유사한 화합물 찾기
예상 결과:
- 85% 임계값으로 12개의 유사 화합물 발견:
- • CID 2244: 아스피린 (참조)
- • CID 3312: 살리실산 (MW: 138.12, 89% 유사)
- • CID 3037: 아세틸살리실산 (91% 유사)
- • CID 1983: 4-아미노살리실산 (87% 유사)
"pubchem-database" 사용 중입니다. 아스피린의 생물활성 데이터 조회
예상 결과:
- CID 2244의 생물활성 요약:
- 총 분석수: 1567
- 활성: 234개 화합물 양성
- 비활성: 1189개 화합물 음성
- 결론 없음: 144개 결과 보류 중
보안 감사
안전This is a legitimate scientific tool for querying the PubChem chemical database. Static analysis findings are false positives: the 'external commands' are Python code examples in markdown documentation, 'network' calls go to official NIH/NCBI servers, and 'weak cryptographic algorithm' detections are keyword false positives in a non-cryptographic context. No actual cryptographic code, command injection risks, or malicious behavior exists.
위험 요인
📁 파일 시스템 액세스 (1)
품질 점수
만들 수 있는 것
약물 후보 스크리닝
Lipinski의 5가지 법칙을 사용하여 약물 유사 특성을 가진 화합물 스크리닝
구조-활성 분석
구조적으로 유사한 화합물을 찾아 생물활성 비교
화학 식별자 변환
출판물을 위해 SMILES, InChI, 화합물 이름 간 변환
이 프롬프트를 사용해 보세요
PubChem에서 아스피린을 검색하고 분자식, 분자량, SMILES를 표시
아스피린, 이부프로펜, 나프록센의 분자 특성을 조회하고 LogP 값 비교
85% 유사성 임계값으로 이미atinib과 유사한 화합물을 검색한 후 MW 200-600으로 필터링
벤젠 고리를 포함하는 모든 화합물을 찾아 평균 분자량 계산
모범 사례
- 반복 조회에서 성능 향상을 위해 이름 대신 CID 사용
- 속도 제한을 존중하기 위해 요청 사이에 0.2~0.3초 지연 구현
- 자주 접근하는 화합물에 대해 로컬에 결과 캐시
피하기
- 초당 5회 이상 요청하여 속도 제한에 걸리지 않도록 하기
- 먼저 동义词를 확인하지 않고 일반 이름으로 검색하지 않기
- 존재하지 않을 수 있는 화합물에 대한 오류 처리를 무시하지 않기
자주 묻는 질문
PubChem은 무엇입니까?
화학 구조로 어떻게 검색합니까?
어떤 특성을 검색할 수 있습니까?
タイムアウトエラーが表示されるのはなぜですか?
분자 구조를 다운로드할 수 있습니까?
속도 제한이 있습니까?
개발자 세부 정보
작성자
K-Dense-AI라이선스
MIT
리포지토리
https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/pubchem-database참조
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