metabolomics-workbench-database
대사체학 워크벤치 데이터베이스 쿼리
또한 다음에서 사용할 수 있습니다: davila7
4,200개 이상의 연구를 포함한 NIH 대사체학 워크벤치 데이터베이스에서 대사체학 데이터를 검색하고 검색합니다. 대사체 구조, 연구 메타데이터, RefMet 명명법을 접근하고 질량 스펙트럼 검색을 수행합니다.
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테스트해 보기
"metabolomics-workbench-database" 사용 중입니다. tyrosine를 포함하는 모든 연구 찾기
예상 결과:
- tyrosine을 포함하는 47개 연구 발견:
- ST000001 - 아미노산 대사의 포괄적 대사체학 분석
- ST000015 - 간 조직에서 티로신 대사 경로
- ST000042 - 대사 질환에서 혈청 아미노산 프로파일링
- 요약: 대사체학 워크벤치에는 다양한 조직, 종, 질환 상태에서 티로신을 측정하는 47개 연구가 포함되어 있습니다.
"metabolomics-workbench-database" 사용 중입니다. M+H 추가물을 사용하여 m/z 180.06으로 화합물 검색
예상 결과:
- m/z 180.06의 상위 일치 항목 (M+H, 0.5 Da 공차):
- Registry 11: 포도당 (C6H12O6) - 정확한 질량 179.058
- Registry 156: 과당 (C6H12O6) - 정확한 질량 179.058
- Registry 203: 만노스 (C6H12O6) - 정확한 질량 179.058
- 참고: 이러한 단당류는 동일한 분자식을 공유합니다
보안 감사
안전All 344 static findings are FALSE POSITIVES. The analyzer misidentified markdown documentation code blocks as shell commands, mass spectrometry ion adduct notation (M+H, M-H) as weak cryptographic algorithms, and legitimate database API calls as suspicious network activity. This is a documentation-only skill for the NIH Metabolomics Workbench - a legitimate scientific research database. No executable code exists.
위험 요인
🌐 네트워크 접근 (2)
⚙️ 외부 명령어 (2)
📁 파일 시스템 액세스 (1)
품질 점수
만들 수 있는 것
대사체에 대한 연구 찾기
포도당이나 시트르산과 같은 특정 대사체의 측정을 포함한 모든 대사체학 연구를 검색합니다.
MS 데이터에서 화합물 식별
질량 스펙트럼의 m/z 값을 입력하여 데이터와 일치하는 잠재적 대사체 후보를 식별합니다.
질환별 연구 필터링
당뇨병이나 암과 같은 특정 질환에 대해 특정 분석 플랫폼을 사용하여 대사체학 연구를 찾습니다.
이 프롬프트를 사용해 보세요
[metabolite_name]의 측정을 포함하는 대사체학 워크벤치의 모든 연구를 찾으세요. 연구 ID와 간단한 설명을 반환합니다.
[M+H] 추가물과 0.5 Da 공차로 m/z [value]와 일치하는 화합물을 대사체학 워크벤치에서 검색합니다. 상위 일치 항목을 나열합니다.
RefMet을 사용하여 [common_name] 대사체 이름을 표준화합니다. 표준화된 이름과 분류 계층을 반환합니다.
[LCMS 또는 GCMS 또는 NMR] 분석 방법을 사용하여 [disease_name]에 대한 인간 혈액 대사체학 연구를 찾습니다.
모범 사례
- 일관된 결과를 위해 연구 검색 전에 RefMet을 사용하여 대사체 이름을 표준화하세요
- 장치 분해능에 따라 적절한 질량 공차를 설정하세요 (저해상도 MS의 경우 0.5 Da, 고해상도 MS의 경우 0.01 Da)
- API 호출을 줄이기 위해 대량 쿼리 시 MGP 데이터베이스를 로컬로 캐시하세요
피하기
- RefMet 표준화를 사용하지 않고 대사체를 검색하면 관련 연구를 놓칠 수 있습니다
- 과도한 질량 공차를 사용하면 너무 많은 위양성 일치가 반환됩니다
- 지연 없이rapid 연속 요청을 하면 비율 제한이 발생할 수 있습니다