hmdb-database
Human Metabolome Database 검색
Auch verfügbar von: davila7
이 스킬은 220,000개 이상의 대사체 항목을 포함하는 Human Metabolome Database에 대한 접근을 제공합니다. 연구자들은 화학명, 구조 또는 ID로 검색하여 대사체학 연구를 위한 특성, 스펙트럼 및 바이오마커 데이터를 검색할 수 있습니다.
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Teste es
Verwendung von "hmdb-database". 카페인의 HMDB ID, 분자량을 포함한 정보를 찾고, 알려진 바이오마커인지 확인하세요.
Erwartetes Ergebnis:
- HMDB ID: HMDB0001854 (카페인)
- 화학식: C8H10N4O2
- 분자량: 194.19 g/mol
- SMILES: CN1C=NC2=C1C(=O)N(C(=O)N2C)C
- 상태: 혈액, 타액, 요에서 검출됨
- 바이오마커 상태: 아니오 - 현재 질환 바이오마커로 등재되지 않음
- 생체표본 위치: 혈액, 요, 타액, 모유
- 요 중 농도: 일반적으로 0.1-10 mg/L (카페인 섭취에 따라 다름)
Verwendung von "hmdb-database". 당뇨병의 바이오마커인 대사체를 검색하고 혈액中的 정상 및 비정상 농도 범위를 표시하세요.
Erwartetes Ergebnis:
- 여러 HMDB 대사체가 당뇨병 바이오마커 상태와 연관되어 있습니다:
- 1. 글루코스 (HMDB0000122) - 당뇨병 상태에서 상승
- 2. HbA1c (HMDB0000741) - 주요 당뇨병 모니터링 바이오마커
- 3. 프럭토사민 (HMDB0002044) - 단기 혈당 조절 지표
- 나이 및 상태 고려사항과 함께 일반적인 혈액 농도 범위가 표시됩니다.
Verwendung von "hmdb-database". 콜레스테롤이 관여하는 대사 경로는 무엇이며 관련 SMPDB 경로 ID는 무엇입니까?
Erwartetes Ergebnis:
- 콜레스테롤 (HMDB0000067)은 여러 경로에 관여합니다:
- 1. 스테로이드 생합성 (SMP0000001)
- 2. 담즙산 생합성 (SMP0000012)
- 3. 지질 대사 (SMP0000035)
- 각 경로는 관련 효소, 반응 및 KEGG 상호 참조를 표시합니다.
Sicherheitsaudit
SicherThis is a pure documentation skill with no executable code. All 129 static findings are FALSE POSITIVES caused by markdown formatting patterns being misidentified as security issues. The backticks detected are markdown inline code spans (e.g., `accession`, `smiles`, `inchi`), not Ruby/shell command execution. The 'weak cryptographic algorithm' detections are chemical identifiers (InChI/InChIKey), not encryption. The hardcoded URLs are legitimate HMDB database endpoints essential to the skill's function. No code, network calls, file system access, or command execution exists.
Risikofaktoren
⚡ Enthält Skripte
🌐 Netzwerkzugriff
📁 Dateisystemzugriff
🔑 Umgebungsvariablen
⚙️ Externe Befehle
Qualitätsbewertung
Was du bauen kannst
알려지지 않은 대사체 식별
실험적 MS 또는 NMR 스펙트럼을 HMDB 참조 라이브러리와 매칭하여 샘플中的 미지 화합물을 식별합니다.
바이오마커 연관성 찾기
특정 질환과 연관된 대사체를 검색하고 진단 적용을 위한 농도 범위를 검토합니다.
화학 ID 상호 참조
통합 경로 분석을 위해 KEGG, PubChem, ChEBI와 같은 외부 데이터베이스에 HMDB 항목을 매핑합니다.
Probiere diese Prompts
HMDB에서 {metabolite_name}에 대한 정보를 찾으세요. 화학식, 분자량 및 SMILES 문자열을 포함합니다.{disease_name}의 바이오마커로 작용하는 대사체를 HMDB에서 검색하세요. 관련 생체액에서의 농도 범위를 나열합니다.600 MHz 프로톤 NMR과 일치하는 NMR 스펙트럼을 가진 HMDB 대사체를 찾으세요. 어떤 화합물이 7-8 ppm 방향족 영역에 피크를 가집니까?
{pathway_name} 경로에 있는 대사체에 대한 SMPDB 경로 ID를 찾으세요. KEGG 경로 식별자와 상호 참조합니다.Bewährte Verfahren
- HMDB 문서에서 권장하는 형식을 사용하여 출판물에서 HMDB를 항상 인용하세요
- 재현성을 위해 연구에서 HMDB 버전(현재 v5.0)을 기록하세요
- 대규모 분석을 위해 반복적인 웹 쿼리 대신 전체 데이터셋을 다운로드하세요
Vermeiden
- HMDB에 대한 웹 스크래핑을 시도하지 마세요 - 대신 API 접근을 연락하세요
- 모든 대사체에 모든 필드가 채워져 있다고 가정하지 마세요 (농도 데이터는 드뭅니다)
- 품질 지표를 확인하지 않고 예측된 스펙트럼 데이터를 실험 데이터와 혼동하지 마세요
Häufig gestellte Fragen
프로그래밍적으로 HMDB에 어떻게 접근합니까?
어떤 파일 형식을 다운로드할 수 있습니까?
HMDB에 대사체가 얼마나 있습니까?
상업적 목적으로 HMDB를 사용할 수 있습니까?
어떤 식별자로 검색할 수 있습니까?
HMDB에 스펙트럼 데이터가 포함되어 있습니까?
Entwicklerdetails
Autor
K-Dense-AILizenz
HMDB is offered to the public as a freely available resource. Use and re-distribution of the data, in whole or in part, for commercial purposes requires explicit permission of the authors and explicit acknowledgment of the source material (HMDB) and the original publication (see the HMDB citing page). We ask that users who download significant portions of the database cite the HMDB paper in any resulting publications.
Repository
https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/hmdb-databaseRef
main
Dateistruktur