Fähigkeiten gene-database
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gene-database

Niedriges Risiko 🌐 Netzwerkzugriff⚙️ Externe Befehle🔑 Umgebungsvariablen📁 Dateisystemzugriff

NCBI Gene 데이터베이스 조회

Auch verfügbar von: davila7

시퀀스, 주석 및 기능 정보를 포함하여 NCBI의 포괄적인 유전자 데이터에 접근하세요. 유전자 기호, ID 또는 생물학적 컨텍스트로 검색하여 생물정보학 연구를 위해 RefSeq, Gene Ontology, 염색체 위치 및 형질을 검색합니다.

Unterstützt: Claude Codex Code(CC)
🥉 73 Bronze
1

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Einschalten und loslegen

Teste es

Verwendung von "gene-database". BRCA1에 대한 정보를 인간에서 찾아주세요

Erwartetes Ergebnis:

  • 유전자 ID: 672
  • 기호: BRCA1
  • 설명: BRCA1 DNA 수리 연관
  • 생물종: Homo sapiens
  • 염색체: 17
  • 위치: 17q21.31

Verwendung von "gene-database". 인간에서 당뇨와 관련된 유전자를 찾아주세요

Erwartetes Ergebnis:

  • 당뇨 관련 유전자의 기호, 설명 및 염색체가 포함된 유전자 ID 목록
  • 검색 쿼리: diabetes[disease] AND human[organism]

Verwendung von "gene-database". TP53, EGFR, KRAS에 대한 배치 유전자 데이터를 가져주세요

Erwartetes Ergebnis:

  • 각 유전자의 유전자 ID, 기호, 설명, 생물종, 염색체 및 지도 위치를 포함한 배치 결과

Sicherheitsaudit

Niedriges Risiko
v4 • 1/17/2026

This is a legitimate bioinformatics tool for querying NCBI Gene database. All 374 static findings are false positives: markdown backticks in documentation are code formatting (not shell execution), API keys are user-provided CLI arguments (not hardcoded secrets), hardcoded URLs are official NCBI API endpoints, and the network+credential+file pattern is standard API client behavior. No data exfiltration or malicious patterns detected.

8
Gescannte Dateien
2,293
Analysierte Zeilen
4
befunde
4
Gesamtzahl Audits

Risikofaktoren

🌐 Netzwerkzugriff (4)
scripts/query_gene.py:19 scripts/fetch_gene_data.py:17 scripts/batch_gene_lookup.py:53 references/api_reference.md:20-22
⚙️ Externe Befehle (3)
SKILL.md:34-175 references/api_reference.md:20-356 references/common_workflows.md:26-398
🔑 Umgebungsvariablen (3)
scripts/query_gene.py:23-43 scripts/fetch_gene_data.py:56-71 scripts/batch_gene_lookup.py:41-48
📁 Dateisystemzugriff (1)
scripts/batch_gene_lookup.py:287
Auditiert von: claude Audit-Verlauf anzeigen →

Qualitätsbewertung

64
Architektur
100
Wartbarkeit
87
Inhalt
21
Community
90
Sicherheit
83
Spezifikationskonformität

Was du bauen kannst

유전자 주석 워크플로우

기능 분석을 위해 시퀀스, GO 용어 및 형질을 포함하여 포괄적인 유전자 데이터를 검색합니다.

배치 유전자 데이터 수집

대규모 유전체 연구를 위해 레이트 제한으로 효율적으로 유전자 목록을 처리합니다.

유전자 정보 조회

교육 목적으로 유전자 기호를 조회하고 상세 정보를 검색합니다.

Probiere diese Prompts

유전자 기호 찾기 
{organism}에서 {gene_symbol} 유전자에 대한 정보와 그 염색체 위치 및 기능을 포함하여 찾아주세요.
시퀀스 데이터 가져오기 
{gene_id}에 대한 RefSeq 접근 번호 및 유전자 시퀀스 데이터를 JSON 형식으로 검색해주세요.
배치 유전자 조회 
{organism}에서 다음 유전자들의 정보를 조회해주세요: {gene_list}. 결과를 JSON으로 반환해주세요.
유전자 기능 검색 
{organism}에서 Gene Ontology 용어를 사용하여 {biological_process}과 관련된 유전자를 찾아주세요.

Bewährte Verfahren

  • 여러 종에 존재하는 모호한 결과를 피하기 위해 쿼리에 생물종을 포함하세요
  • 정밀도가 필요한 경우 Gene ID를 기호 대신 사용하세요. 유전자 기호는 시간에 따라 변경될 수 있습니다
  • 더 빠른 배치 처리를 위해 NCBI API 키를 포함하세요 (초당 최대 10개 요청)

Vermeiden

  • 레이트 제한 없이 루프에서 개별 요청을 생성하지 마세요.这样的话会触发NCBI的速率限制
  • 영구 저장소에 유전자 기호만 의존하지 마세요. 공식 명명법이 변경될 수 있습니다
  • 검증 없이 모든 유전자 기호가 생물종 내에서 고유하다고 가정하지 마세요

Häufig gestellte Fragen

NCBI API 키를 어떻게 얻나요?
무료 API 키를 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/account 에 등록하여速率限制을 초당 3개에서 10개로 늘리세요.
어떤 유전자 형식이 지원되나요?
공식 유전자 기호(BRCA1), Gene ID(672) 또는 GO 용어 및 질병 키워드로 복잡한 쿼리를 사용할 수 있습니다.
단백질 시퀀스를 검색할 수 있나요?
네, 이 기술은 유전자와 관련된 전사체 및 단백질에 대한 RefSeq 접근 번호를 검색합니다.
한 번에 얼마나 많은 유전자를 조회할 수 있나요?
배치 스크립트는 자동 레이트 제한과 함께 수백 개의 유전자를 지원합니다. ESummary는 요청당 최대 500개의 ID를 허용합니다.
어떤 출력 형식이 지원되나요?
데이터는 프로그래밍적 사용을 위한 JSON, 상세 메타데이터를 위한 XML 또는 사람이 읽을 수 있는 텍스트 요약으로 반환될 수 있습니다.
이 기술은 데이터를 저장하나요?
아니요, 이 기술은 실시간으로만 NCBI API를 조회합니다. 모든 데이터는 사용자에게 직접 반환되거나 사용자가 지정한 출력 파일에 기록됩니다.

Entwicklerdetails

Lizenz

MIT

Repository

https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/gene-database

Ref

main

Dateistruktur

📁 references/

📄 api_reference.md

📄 common_workflows.md

📁 scripts/

📄 batch_gene_lookup.py

📄 fetch_gene_data.py

📄 query_gene.py

📄 evaluation.json

📄 SKILL.md