このスキルはNeuropixels高密度神経記録の包括的な解析を提供します。SpikeInterfaceとKilosort4アルゴリズムを使用して、生データの読み込みから出版-readyなキュレート済みユニットまで、完全なワークフローを処理します。

グラフやネットワークデータの操作には、構造の作成、アルゴリズムの計算、可視化の生成に特化したツールが必要です。このスキルは、ソーシャルネットワーク分析、生物学的パスウェイマッピング、輸送最適化、および関係性モデリングのためのNetworkX機能への包括的なアクセスを提供します。

創薬では、大きな化合物ライブラリからDrug-likeness特性を持つ化合物をフィルタリングする必要があります。このスキルは、Rule of Five、Veber、PAINSフィルターなど確立された医薬化学ルールを適用し、化合物を効率的に優先化し、構造的アラートを特定します。

Modalは、クラウドでPythonコードを実行するためのサーバーレスプラットフォームです。GPUへの即時アクセス、自動スケーリング、従量課金制を提供します。インフラを管理することなく、MLモデルをデプロイし、バッチ処理ジョブを実行し、APIを提供できます。

Matplotlibは、出版品質の図を作成するためにあらゆる視覚要素を完全に制御できます。pyplotとオブジェクト指向の両方のインターフェースを習得することで、シンプルな折れ線グラフから複雑なマルチパネルの科学的な可視化まで、あらゆる種類のチャートを構築できます。

MATLABの構文やベストプラクティスに悩む科学者や技術者は少なくありません。このスキルは行列入出力、可視化、数値解析に関する包括的なリファレンスドキュメントを提供します。

インフラ管理なしで本番対応のバイオインフォマティクス・ワークフローをデプロイ。Pythonデコレーターでサーバーレスのパイプラインを作成し、自動コンテナ化、GPU対応、統合クラウドストレージを利用できます。

生物学的 연구는 추적, 쿼리 및 재현이 어려운 복잡한 데이터세트를 생성합니다. LaminDB는 자동 계보 추적, 온톨로지 기반 주석 및 워크플로우 관리자와의 원활한 통합을 통해 생물학적 데이터를 관리하기 위한 통합 프레임워크를 제공합니다.

このスキルは、220,000以上の代謝物エントリを含むヒューマンメタボロームデータベースへのアクセスを提供します。研究者は、化学名、構造、またはIDで検索することで、メタボローム研究のための特性、スペクトル、およびバイオマーカーデータを取得できます。

Histolabは、超高解像度全スライド画像から組織の検出とタイル抽出を自動化します。WSIファイルを処理して、深層学習パイプラインや医学研究のために有益なタイルを抽出します。

NHGRI-EBI GWASカタログから包括的なゲノムワイド関連研究データにアクセスします。rs ID、性状、または遺伝子別にバリアントを検索し、遺伝研究のためのp値、効果量、サマリー統計を取得できます。

バイオインフォマティクス研究向けにゲノム区間データを処理・解析します。Gtarsは、オーバーラップ検出、カバレッジ解析、ゲノム配列のMLトークナイゼーション向けの高性能ツールを提供します。

gget は、シンプルな CLI または Python インターフェースを通じて 20 以上のゲノムデータベースに統一的にアクセスできます。複数の API 接続を管理することなく、遺伝子情報の検索、配列の取得、BLAST 検索、エンリッチメント解析を実行できます。

科学技術計算のタスクでは、最適な計算戦略を選ぶためにハードウェア情報が必要です。このスキルはCPUコア数、GPUの有無、メモリ、ディスク容量を自動検出し、並列処理とGPUアクセラレーションの推奨事項を生成します。

GeoPandasはpandasを拡張して地理空間操作を可能にします。シェープファイル、GeoJSON、PostGISデータの読み込みに対応。空間結合、バッファ解析、座標変換、matplotlibとの連携によるコロプレス地図の作成が可能です。

フローサイトメトリーデータには特殊なファイルHandlingが必要です。FlowIOはFCSファイルを解析し、イベントデータをNumPy配列として抽出 downstream分析パイプラインへのCSV形式への変換を可能にします。

公式のopenFDA APIを通じて、医薬品の有害事象、医療機器のリコール、安全性情報を含む包括的なFDA規制データにアクセス。Pythonでファーマコビジランスと規制研究のワークフローを構築。

科学データファイルは何百もの形式があります。このスキルはファイルタイプを自動的に検出し、メタデータを抽出し、データ品質を評価し、形式固有の分析推奨事項を含む包括的なマークダウンレポートを生成します。

DrugBankは詳細な医薬品情報を含む包括的なバイオインフォマティクスデータベースです。このスキルは、薬理学研究や創薬のために、医薬品の特性、相互作用、ターゲット、経路、および化学構造へのプログラムによるアクセスを可能にします。

次世代シーケンシングデータを処理・可視化。BAMからbigWigへの変換、品質管理プロットの生成、ChIP-seq、RNA-seq、ATAC-seq実験のための出版品質ヒートマップの作成。