torchdrug
TorchDrugで創薬モデルを構築
創薬チームには、分子データセット、グラフモデル、評価ワークフローを選択するための明確な指針が必要です。このスキルは、分子、タンパク質、知識グラフ、生成、逆合成に関するTorchDrugのパターンを提供します。
自分のエージェントでインストール
このリクエストをエージェントにコピーしてください。正規の Skill ページとマニフェストが含まれています。
Review the Skillstore skill "torchdrug" from https://skillstore.io/skills/davila7-torchdrug.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/davila7-torchdrug/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.エージェントは引き続き計画を提示し、セキュリティポリシーで必要な確認を求める必要があります。
エージェントが読めるリソース
AI エージェント、クローラー、スクリプトがページ全体ではなく整理されたコンテキストを必要とする場合は、これらのリンクを使ってください。
テストする
「torchdrug」を使用しています。 血液脳関門透過性を予測するためのワークフローを選択してください。
期待される結果:
- 構造的な汎化性能を測定するため、BBBPをスキャフォールド分割で使用します。
- GINと二値特性予測から始めます。
- AUROCとAUPRCを報告し、その後、スキャフォールド固有の誤差を調査します。
「torchdrug」を使用しています。 酵素機能予測についてESMとGearNetを比較してください。
期待される結果:
ESMは配列のみのデータに適しており、事前学習の恩恵を受けます。GearNetは構造的関係を利用し、信頼性の高い三次元構造を利用できる場合に優れています。
「torchdrug」を使用しています。 生成された分子の検証計画を作成してください。
期待される結果:
- 化学的妥当性、一意性、新規性、内部多様性を確認します。
- 医薬品らしさ、合成可能性、望ましくない部分構造に基づいてフィルタリングします。
- 合成または生物学的試験の前に、メディシナルケミストリーの専門家によるレビューを必須とします。
セキュリティ監査
安全All 85 static findings were adjudicated as false positives. The alerts represent a PyTorch evaluation-mode call, scientific prose, Markdown formatting, fixed examples, and official resource links.
リスク要因
⚡ スクリプトを含む (1)
⚙️ 外部コマンド (50)
🌐 ネットワークアクセス (2)
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<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/davila7-torchdrug.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>学術引用 (APA · BibTeX · CFF)
APA形式の引用
davila7. (2026). torchdrug security audit report (audit version 9) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/davila7-torchdrug/audits/9BibTeX形式の引用
@techreport{davila7-davila7-torchdrug-2026,
author = {davila7},
title = {torchdrug security audit report (audit version 9)},
institution = {Skillstore},
year = {2026},
number = {9},
url = {https://skillstore.io/skills/davila7-torchdrug/audits/9},
note = {Author version unspecified}
}CITATION.cff
cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "torchdrug security audit report (audit version 9)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
- name: "davila7"
date-released: "2026-07-23"
url: "https://skillstore.io/skills/davila7-torchdrug/audits/9"
identifiers:
- type: other
value: "skillstore:davila7-torchdrug:audit:9"
description: "Skillstore immutable audit report identifier"
バリアントを比較
インストール可能なバリアント 2 件各作者のスキルは個別のインストール項目として維持されます。推奨バリアントは Skillstore の証拠で順位付けされます。
このバリアントが首位の理由
Skillstore スコア
このスコアの理由 証拠の信頼度: 高作成できるもの
分子特性をスクリーニング
ADMET予測実験向けに、データセット、グラフモデル、分割戦略、評価指標を選択します。
タンパク質機能をモデル化
酵素機能、安定性、局在、相互作用の予測に用いる配列モデルと構造モデルを比較します。
生成化学ワークフローを計画
制約、ランキング、専門家レビューを含む、検証済みの分子生成または逆合成ワークフローを設計します。
これらのプロンプトを試す
初心者向けにTorchDrugのデータ構造とタスクインターフェースを説明してください。分子、タンパク質、モデル、予測タスクがどのようにつながるかを示してください。
[dataset]から[property]を予測するためのTorchDrugワークフローを推奨してください。データ分割、モデル選択、タスク設定、評価指標、データ漏洩チェックを含めてください。
[protein task]についてESM、GearNet、SchNetを比較してください。利用可能な配列データ、構造、計算資源の制限、事前学習、評価指標を考慮してください。
[goal]向けのエンドツーエンドのTorchDrugパイプラインを設計してください。データキュレーション、アーキテクチャ、学習、不確実性、化学的検証、ランキング、専門家レビューを網羅してください。
ベストプラクティス
- モデルを選択する前に、タスク、データモダリティ、予測対象、利用可能な計算資源を明確にします。
- ランダム分割によって性能が過大評価される可能性がある場合は、スキャフォールドまたは構造を考慮した分割を使用します。
- 生成された分子と合成経路を、化学ツールと分野の専門家によって検証します。
回避
- 予測された活性を、実験的または臨床的な証拠として扱わないでください。
- スキャフォールドに対する汎化が真の目的である場合、ランダム分割を使用しないでください。
- 妥当性、選択性、合成可能性を無視して、単一のスコアだけを最適化しないでください。
よくある質問
このスキルはTorchDrugの実験を実行しますか?
どのような科学的タスクが対象ですか?
データセットとモデルを推奨できますか?
化学的に妥当な結果を保証しますか?
GPUは必要ですか?
予測を臨床判断に使用できますか?
開発者情報
作成者
davila7ライセンス
MIT
Skillstore リビジョン
r2
バージョンに関する注意
作者はバージョンを宣言していません。
参照
c43861a65bb95efcae259cd161c9d6f4dc7eec6f
メンテナンスの新しさ
2026/7/25
利用状況
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