uniprot-database
Rechercher la base de données de protéines UniProt
也可從以下取得: K-Dense-AI
Besoin de trouver des séquences de protéines et des annotations à partir d'UniProt ? Interrogez les bases de données de protéines par nom, gène, numéro d'accession ou organisme. Récupérez des séquences, mappez des identifiants et accédez aux annotations fonctionnelles via l'API REST.
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正在使用「uniprot-database」。 Rechercher des protéines d'hémoglobine humaines avec statut révisé
預期結果:
- 3 protéines d'hémoglobine humaines révisées trouvées :
- • P68871 - HBB (Hemoglobin subunit beta) - Longueur : 147 aa
- • P69905 - HBA1 (Hemoglobin subunit alpha 1) - Longueur : 142 aa
- • P69902 - HBA2 (Hemoglobin subunit alpha 2) - Longueur : 142 aa
正在使用「uniprot-database」。 Obtenir la séquence FASTA pour l'insuline humaine
預期結果:
- Séquence récupérée pour P01308 (INS_HUMAN) :
- >sp|P01308|INS_HUMAN Insulin precursor - Homo sapiens (Human)
- MALWMRLLPLLALLALWGPDPAAAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKT...
安全審計
安全Legitimate bioinformatics tool providing read-only access to the authoritative UniProt protein database via HTTPS. All static analysis findings are false positives: markdown code fences were misidentified as shell commands, HTTPS URLs as weak crypto, and legitimate API calls as reconnaissance. The actual code contains no malicious patterns.
風險因素
⚡ 包含腳本 (1)
🌐 網路存取 (1)
品質評分
你能建構什麼
Rechercher la fonction des protéines
Trouvez des séquences de protéines, des annotations fonctionnelles, des termes GO et des références croisées pour des projets d'analyse génétique.
Récupérer des séquences par lots
Téléchargez de grands ensembles de données de protéines au format FASTA pour la phylogénétique, la prédiction de structure ou l'analyse comparative.
Mapper des identifiants de protéines
Convertissez des identifiants de protéines entre UniProt, PDB et d'autres bases de données pour intégrer des sources de données.
試試這些提示
Search UniProt for insulin proteins in humans using the query: 'insulin AND organism_name:"Homo sapiens"' and return the results in JSON format.
Retrieve the protein sequence for UniProt accession P01308 in FASTA format.
Map the UniProt accessions P01308 and P04637 to their corresponding PDB IDs using the ID mapping service.
Search UniProt for reviewed human kinases that have PDB structures. Use the query: 'protein_name:kinase AND organism_id:9606 AND reviewed:true AND xref:pdb'. Return accession, gene names, and PDB cross-references in JSON format.
最佳實務
- Utilisez reviewed:true dans les requêtes pour obtenir des entrées Swiss-Prot de haute qualité avec des annotations fiables
- Demandez uniquement les champs nécessaires en utilisant le paramètre fields pour réduire la bande passante et améliorer le temps de réponse
- Implémentez une gestion d'erreurs appropriée avec response.raise_for_status() pour détecter rapidement les échecs de l'API
避免
- Ne faites pas d'appels API illimités sans limitation de débit ; UniProt applique des politiques d'utilisation
- Ne supposez pas que toutes les entrées TrEMBL ont une validation expérimentale ; ce sont des prédictions computationnelles
- N'ignorez pas les identifiants échoués dans les résultats de mappage d'identifiants ; vérifiez le champ failedIds pour les mappages incomplets