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Seguro 🌐 Acceso a red

Buscar literatura biomédica en PubMed

También disponible en: davila7

Los investigadores necesitan acceso eficiente a la literatura biomédica para revisiones sistemáticas e investigación basada en evidencia. Esta skill proporciona documentación completa para consultas en PubMed, incluyendo operadores booleanos, términos MeSH y acceso a la API de E-utilities.

Soporta: Claude Codex Code(CC)
📊 70 Adecuado
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Usando "pubmed-database". Buscar revisiones sistemáticas sobre aprendizaje automático en imágenes médicas publicadas 2023-2024

Resultado esperado:

  • Consulta: (machine learning[mh] OR deep learning[tiab] OR artificial intelligence[tiab]) AND (medical imaging[mh] OR radiology[tiab] OR diagnostic imaging[tiab]) AND systematic review[pt] AND 2023:2024[dp]
  • Resultado: 247 artículos encontrados
  • Principales coincidencias incluyen:
  • - Deep learning in radiology: a systematic review (PMID: 38012345)
  • - Machine learning for medical image analysis: systematic review (PMID: 37987654)

Usando "pubmed-database". Buscar ensayos clínicos sobre metformina para diabetes tipo 2 con resultados cardiovasculares

Resultado esperado:

  • Consulta: (metformin[nm] OR biguanides[mh]) AND diabetes mellitus, type 2[mh] AND cardiovascular diseases[mh] AND randomized controlled trial[pt] AND hasabstract[text]
  • Resultado: 89 artículos encontrados
  • Estudios clave:
  • - Metformin and cardiovascular outcomes in type 2 diabetes (PMID: 36543210)
  • - Long-term cardiovascular effects of metformin (PMID: 36123456)

Auditoría de seguridad

Seguro
v5 • 1/21/2026

All static findings are false positives. This is a documentation-only skill providing reference materials for PubMed queries. The detected patterns (backticks, API key placeholders, URLs) are markdown documentation elements, not executable code. The skill contains no executable code, no network calls, and no credential access.

5
Archivos escaneados
5,088
Líneas analizadas
1
hallazgos
5
Auditorías totales

Factores de riesgo

🌐 Acceso a red (5)
references/api_reference.md:8 references/api_reference.md:295 SKILL.md:128 SKILL.md:453 SKILL.md:454
Auditado por: claude Ver historial de auditorías →

Puntuación de calidad

45
Arquitectura
90
Mantenibilidad
87
Contenido
23
Comunidad
100
Seguridad
91
Cumplimiento de la especificación

Lo que puedes crear

Revisión Sistemática de Literatura

Construir estrategias de búsqueda comprehensivas usando operadores booleanos, términos MeSH y filtros para encontrar todos los estudios relevantes para revisiones sistemáticas y metaanálisis.

Consultas de Investigación Biomédica

Buscar artículos sobre enfermedades específicas, tratamientos o interacciones farmacológicas usando etiquetas de campo precisas y vocabulario controlado.

Extracción Programática de Datos

Construir flujos de trabajo automatizados para buscar en PubMed y extraer metadatos de artículos usando la API de E-utilities para proyectos de investigación a gran escala.

Prueba estos prompts

Búsqueda Básica de Artículos 
Buscar artículos recientes sobre {topic} publicados en 2024. Usar términos MeSH apropiados y etiquetas de campo para limitar resultados a artículos de investigación en inglés.
Búsqueda de Ensayos Clínicos 
Buscar ensayos controlados aleatorizados que comparen {treatment_a} versus {treatment_b} para {condition} desde 2020 hasta 2024. Incluir solo artículos con texto completo gratuito.
Consulta para Revisión Sistemática 
Usar el marco PICO para construir una estrategia de búsqueda comprehensiva para {clinical_question}. Incluir todos los sinónimos y términos MeSH relevantes.
Búsqueda por Lotes Basada en API 
Escribir un script de Python usando la API de E-utilities para buscar artículos que coincidan con {criteria}, recuperar hasta 500 PMIDs usando el servidor de historial, y exportar resultados a un archivo CSV con PMID, título y resumen.

Mejores prácticas

  • Comenzar con búsquedas amplias usando términos MeSH, luego reducir con etiquetas de campo y filtros para mayor precisión
  • Incluir sinónimos y términos alternativos para capturar toda la literatura relevante
  • Usar el servidor de historial (usehistory=y) para conjuntos de resultados grandes que superen 500 artículos
  • Obtener una clave API de NCBI para límites de tasa más altos (10 solicitudes/segundo vs 3)

Evitar

  • Usar solo términos de texto sin términos MeSH pierde artículos indexados
  • Ejecutar muchas solicitudes pequeñas de API en lugar de operaciones por lotes desperdicia límites de tasa
  • No almacenar en caché resultados lleva a llamadas redundantes a la API y flujos de trabajo más lentos
  • Ignorar el mapeo automático de términos puede producir resultados de búsqueda inesperados

Preguntas frecuentes

¿Cuál es la diferencia entre términos MeSH y búsquedas por palabras de texto?
Las búsquedas por términos MeSH buscan en el índice de vocabulario controlado donde todos los artículos son etiquetados manualmente. Las búsquedas por palabras de texto solo coinciden con términos que aparecen en títulos y resúmenes. Combinar ambas proporciona cobertura comprehensiva.
¿Cómo obtengo una clave API para PubMed E-utilities?
Regístrese para obtener una cuenta gratuita de NCBI en ncbi.nlm.nih.gov, luego visite la configuración de su cuenta para generar una clave API. Inclúyala en las solicitudes con el parámetro api_key para límites de tasa más altos.
¿Cuáles son los límites de tasa de PubMed?
Sin clave API: 3 solicitudes por segundo. Con clave API: 10 solicitudes por segundo. Siempre incluya un encabezado User-Agent descriptivo en sus solicitudes.
¿Cómo manejo grandes conjuntos de resultados con miles de artículos?
Use el servidor de historial: primero llame a ESearch con usehistory=y para almacenar resultados, luego use los parámetros WebEnv y QueryKey con ESummary o EFetch para recuperar datos en lotes de hasta 500 registros por solicitud.
¿Qué formatos de exportación están disponibles para resultados de PubMed?
Los formatos comunes incluyen MEDLINE (texto), XML (datos estructurados), RIS (gestores de referencias) y NBIB (EndNote). Use los parámetros rettype y retmode para especificar el formato deseado.
¿Cómo encuentro artículos que citan un artículo específico?
Use la utilidad ELink con dbfrom=pubmed, db=pubmed y cmd=cite. Esto devuelve PMIDs de artículos que citan el artículo de entrada. Tenga en cuenta que los datos de citas pueden no estar completos para publicaciones muy recientes.

Detalles del desarrollador

Licencia

Unknown

Repositorio

https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/pubmed-database

Ref.

main

Estructura de archivos

📁 references/

📄 api_reference.md

📄 common_queries.md

📄 search_syntax.md

📄 SKILL.md