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esm

Name: esm
Author: davila7

Inhaltsrevision r2 Mittleres Risiko ⚡ Enthält Skripte🌐 Netzwerkzugriff📁 Dateisystemzugriff⚙️ Externe Befehle

Proteine mit ESM-Modellen entwerfen

Workflows für das Proteindesign können über Sequenz, Struktur, Funktion und Embeddings hinweg schwer zu planen sein. Diese Skill bietet praktische Anleitung zu ESM3, ESM C und der Forge API.

Unterstützt: Claude Codex Code(CC)

📊 67 Angemessen

Mit meinem Agent installieren

Kopieren Sie diese Anfrage in Ihren Agent. Sie enthält die maßgebliche Skill-Seite und das Manifest.

Agent-Anfrage

Review the Skillstore skill "esm" from https://skillstore.io/skills/davila7-esm.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/davila7-esm/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.

Ihr Agent sollte weiterhin seinen Plan anzeigen und alle von der Sicherheitsrichtlinie verlangten Bestätigungen anfordern.

Agent-lesbare Ressourcen

Verwenden Sie diese Links, wenn ein KI-Agent, Crawler oder Skript sauberen Kontext benötigt, statt die vollständige Seite zu lesen.

Markdown-Detailseite GET /skills/davila7-esm.md Signiertes manifest GET /api/skills/davila7-esm/manifest Signiertes lockfile GET /api/skills/davila7-esm/lockfile

Testen

„esm“ wird verwendet. Ich benötige Kandidatensequenzen für eine Familie fluoreszierender Proteine.

Erwartetes Ergebnis:

Empfohlene ESM3-Modellauswahl mit Begründung.
Prompting-Strategie für maskierte Sequenz- und Funktionskonditionierung.
Validierungscheckliste für Struktur-, Funktions- und Biosicherheitsprüfung.

„esm“ wird verwendet. Ich habe 5.000 Proteinsequenzen für das Clustering.

Erwartetes Ergebnis:

ESM C-Embedding-Workflow mit Anleitung zum Batching.
Ähnlichkeits- und Clustering-Plan für die Auswahl repräsentativer Sequenzen.
Speicherempfehlungen für Ausgaben und vertrauenswürdige Cache-Dateien.

„esm“ wird verwendet. Ich möchte Forge für Produktionsinferenz verwenden.

Erwartetes Ergebnis:

Forge-Modellauswahlhilfe für Kosten und Qualität.
Wiederholungs- und Rate-Limit-Strategie für Batch-Jobs.
Checkliste für Token-Handhabung und Datenschutz.

Sicherheitsaudit

Mittleres Risiko

v9 • 23.7.2026 Versionsbericht öffnen

Eighty-four of 85 static findings are false positives caused by documentation syntax, scientific terms, fixed output examples, or expected Forge API references. One shortened community link is a low-risk redirect concern, and the protein generation workflows create a separate medium-severity dual-use biosafety risk.

Gescannte Dateien

2,682

Analysierte Zeilen

Prüfelemente

Falschmeldungen ignoriert

Bestätigte Sicherheitsbedenken (1)

Mittel

SKILL.md:14-22 SKILL.md:133-155 SKILL.md:298-300

Dual-use protein design capability

The skill provides actionable novel-sequence, inverse-folding, and function-conditioned generation workflows. Its general responsible-use note does not define safeguards for harmful biological functions.

The cited sections explicitly enable novel and function-conditioned protein generation, while the only biosafety control is a broad responsible-use statement.

Elemente der Fähigkeitsprüfung (1)

Dies sind echte lokale Fähigkeiten, die für diese Fähigkeit erwartet werden können; daher müssen sie überprüft werden, werden jedoch nicht als bestätigtes bösartiges Verhalten gezählt.

Niedrig

SKILL.md:295

Hardcoded URL

- **Community:** Slack community at https://bit.ly/3FKwcWd

The shortened bit.ly community URL conceals its final destination and can redirect users if the link ownership or target changes.

Risikofaktoren

⚡ Enthält Skripte (1)

references/esm-c-api.md:338

🌐 Netzwerkzugriff (14)

references/esm-c-api.md:575 references/forge-api.md:186 references/forge-api.md:368 references/forge-api.md:38 references/forge-api.md:80 SKILL.md:48 SKILL.md:245 SKILL.md:289 SKILL.md:290 SKILL.md:291 SKILL.md:293 SKILL.md:294 SKILL.md:295 SKILL.md:300

📁 Dateisystemzugriff (13)

references/esm-c-api.md:462 references/esm3-api.md:55 references/esm3-api.md:191 references/forge-api.md:328 references/forge-api.md:463 references/forge-api.md:438 references/workflows.md:515 references/workflows.md:92 references/workflows.md:95 references/workflows.md:278 references/workflows.md:283 references/workflows.md:436 references/workflows.md:634

⚙️ Externe Befehle (41)

Geprüft von: codex Audit-Verlauf anzeigen →

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Teile den versionierten Bewertungsbericht, das neutrale Badge, die Einbettungskarte und Zitate. Skillstore berichtet Nachweise, ohne zu entscheiden, ob dieser Skill sicher ist.

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https://skillstore.io/skills/davila7-esm/audits/9?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report

Markdown-Badge

[![Skillstore security assessment](https://skillstore.io/badges/skills/davila7-esm/security.svg)](https://skillstore.io/skills/davila7-esm?utm_source=security_passport_badge)

HTML-Badge

<a href="https://skillstore.io/skills/davila7-esm?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/davila7-esm/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>

Einbettungskarte

<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/davila7-esm.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>

Wissenschaftliche Zitate (APA · BibTeX · CFF)

APA-Zitat

davila7. (2026). esm security audit report (audit version 9) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/davila7-esm/audits/9

BibTeX-Zitat

@techreport{davila7-davila7-esm-2026,
  author = {davila7},
  title = {esm security audit report (audit version 9)},
  institution = {Skillstore},
  year = {2026},
  number = {9},
  url = {https://skillstore.io/skills/davila7-esm/audits/9},
  note = {Author version unspecified}
}

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "esm security audit report (audit version 9)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
  - name: "davila7"
date-released: "2026-07-23"
url: "https://skillstore.io/skills/davila7-esm/audits/9"
identifiers:
  - type: other
    value: "skillstore:davila7-esm:audit:9"
    description: "Skillstore immutable audit report identifier"

Varianten vergleichen

2 installierbare Varianten

Jeder Autor bleibt ein eigener installierbarer Skill. Die empfohlene Variante wird nach Skillstore-Nachweisen bewertet.

Warum diese Variante zuerst steht

Höchster Skillstore-Score

Autor / Quelle Skillstore-Score Evidenzvertrauen Skillstore-Nutzung Aktualisiert

K-Dense-AI Empfohlen

k-dense-ai-esm

Skillstore-Score 68

Evidenzvertrauen Hoch

Skillstore-Nutzung 12

Aktualisiert

2026-09-09

davila7 Aktuell

davila7-esm

Skillstore-Score 67

Evidenzvertrauen Hoch

Skillstore-Nutzung 8

Aktualisiert

2026-09-09

Skillstore-Score

Warum dieser Score Evidenzvertrauen: Hoch

Architektur

Wartbarkeit

Inhalt

Gemeinschaft

Spezifikationskonformität

Was Sie erstellen können

Generative Proteindesigns planen

Nutze ESM3-Anleitung, um maskierte Sequenz-Prompts zu erstellen, Kandidaten zu generieren und Validierungsschritte zu planen.

Embedding-Pipelines erstellen

Nutze ESM C-Beispiele, um Repräsentationen für Klassifizierungs-, Clustering- oder Ähnlichkeitsaufgaben zu extrahieren.

Skalierbare Forge-Jobs ausführen

Nutze Forge API-Muster für Batch-Inferenz, Wiederholungen, Rate Limits und Caching.

Diese Prompts ausprobieren

Modellauswahl erklären

Ich bin neu bei ESM. Vergleiche ESM3 und ESM C für meine Proteinaufgabe und empfehle einen Modellpfad.

Sequenzkandidaten generieren

Hilf mir, einen ESM3-Workflow für diese Zielfunktion, Sequenzlänge, Einschränkungen und diesen Validierungsplan zu entwerfen: [details].

Embedding-Analyse erstellen

Plane eine ESM C-Embedding-Pipeline für diese Sequenzen, einschließlich Batching, Caching, Clustering und Evaluierungsausgaben: [details].

Forge-Batch-Workflow entwerfen

Erstelle einen Forge API-Batch-Inferenzplan mit Wiederholungsstrategie, Rate Limits, Token-Handhabung und Datenschutzkontrollen für: [project].

Bewährte Praktiken

Bewahre Forge API-Tokens in Umgebungs-Secrets auf und platziere echte Tokens niemals in Prompts oder Dateien.
Beginne mit kleineren Modellen und begrenzten Batches, bevor du teure Inferenz skalierst.
Validiere generierte Designs mit unabhängigen Prüfungen zu Struktur, Funktion und Biosicherheit.

Vermeiden

Behandle generierte Proteine nicht als experimentell validierte Ergebnisse.
Sende keine proprietären oder sensiblen Sequenzen ohne Genehmigung an Cloud-Inferenzdienste.
Lade keine pickle-Cache-Dateien aus nicht vertrauenswürdigen Speicherorten.