المهارات pubmed-database
📦

pubmed-database

آمن 🌐 الوصول إلى الشبكة

البحث في الأدبيات الطبية الحيوية في PubMed

متاح أيضًا من: davila7

يحتاج الباحثون إلى وصول فعال للأدبيات الطبية الحيوية للمراجعات المنهجية والبحث القائم على الأدلة. توفر هذه المهارة توثيقًا شاملًا لاستعلامات PubMed بما في ذلك العمليات المنطية ومصطلحات MeSH والوصول إلى واجهة برمجة تطبيقات E-utilities.

يدعم: Claude Codex Code(CC)
📊 70 كافٍ
1

تنزيل ZIP المهارة

2

رفع في Claude

اذهب إلى Settings → Capabilities → Skills → Upload skill

3

فعّل وابدأ الاستخدام

اختبرها

استخدام "pubmed-database". البحث عن مراجعات منهجية حول التعلم الآلي في التصوير الطبي نُشرت 2023-2024

النتيجة المتوقعة:

  • Query: (machine learning[mh] OR deep learning[tiab] OR artificial intelligence[tiab]) AND (medical imaging[mh] OR radiology[tiab] OR diagnostic imaging[tiab]) AND systematic review[pt] AND 2023:2024[dp]
  • Result: 247 articles found
  • Top matches include:
  • - Deep learning in radiology: a systematic review (PMID: 38012345)
  • - Machine learning for medical image analysis: systematic review (PMID: 37987654)

استخدام "pubmed-database". العثور على تجارب سريرية حول الميتفورمين لمرض السكري من النوع 2 مع النتائج القلبية الوعائية

النتيجة المتوقعة:

  • Query: (metformin[nm] OR biguanides[mh]) AND diabetes mellitus, type 2[mh] AND cardiovascular diseases[mh] AND randomized controlled trial[pt] AND hasabstract[text]
  • Result: 89 articles found
  • Key studies:
  • - Metformin and cardiovascular outcomes in type 2 diabetes (PMID: 36543210)
  • - Long-term cardiovascular effects of metformin (PMID: 36123456)

التدقيق الأمني

آمن
v5 • 1/21/2026

All static findings are false positives. This is a documentation-only skill providing reference materials for PubMed queries. The detected patterns (backticks, API key placeholders, URLs) are markdown documentation elements, not executable code. The skill contains no executable code, no network calls, and no credential access.

5
الملفات التي تم فحصها
5,088
الأسطر التي تم تحليلها
1
النتائج
5
إجمالي عمليات التدقيق

عوامل الخطر

🌐 الوصول إلى الشبكة (5)
references/api_reference.md:8 references/api_reference.md:295 SKILL.md:128 SKILL.md:453 SKILL.md:454
تم تدقيقه بواسطة: claude عرض سجل التدقيق →

درجة الجودة

45
الهندسة المعمارية
90
قابلية الصيانة
87
المحتوى
23
المجتمع
100
الأمان
91
الامتثال للمواصفات

ماذا يمكنك بناءه

المراجعة المنهجية للأدبيات

بناء استراتيجيات شاملة للبحث باستخدام العمليات المنطية ومصطلحات MeSH والمرشحات للعثور على جميع الدراسات ذات الصلة بالمراجعات المنهجية والتحليلات الوصفية.

استعلامات البحث الطبي الحيوي

البحث عن مقالات حول أمراض أو علاجات أو تفاعلات دوائية محددة باستخدام علامات الحقول الدقيقة والمفردات الخاضعة للرقابة.

استخراج البيانات برمجيًا

بناء سير عمل آلي للبحث في PubMed واستخراج بيانات المقالات الوصفية باستخدام واجهة برمجة تطبيقات E-utilities لمشاريع البحث واسعة النطاق.

جرّب هذه الموجهات

بحث أساسي عن المقالات 
البحث عن مقالات حديثة حول {topic} نُشرت في 2024. استخدام مصطلحات MeSH المناسبة وعلامات الحقول لتقييد النتائج إلى أوراق البحث باللغة الإنجليزية.
بحث التجارب السريرية 
البحث عن التجارب العشوائية المضادة التي تقيح بين {treatment_a} مقابل {treatment_b} لـ {condition} من 2020 إلى 2024. تضمين فقط مقالات النص الكامل المجانية.
استعلام المراجعة المنهجية 
استخدام إطار PICO لبناء استراتيجية بحث شاملة لـ {clinical_question}. تضمين جميع المرادفات ذات الصلة ومصطلحات MeSH.
بحث دفعة قائم على واجهة برمجة التطبيقات 
كتابة برنامج Python باستخدام واجهة برمجة تطبيقات E-utilities للبحث عن مقالات تطابق {criteria}، واسترداد ما يصل إلى 500 PMID باستخدام خادم السجل، وتصدير النتائج إلى ملف CSV مع PMID والعنوان والملخص.

أفضل الممارسات

  • ابدأ بعمليات بحث واسعة باستخدام مصطلحات MeSH، ثم قم بتضييقها باستخدام علامات الحقول والمرشحات للدقة
  • تضمين المرادفات والعبارات البديلة لالتقاط جميع الأدبيات ذات الصلة
  • استخدم خادم السجل (usehistory=y) لمجموعات النتائج الكبيرة التي تتجاوز 500 مقالة
  • احصل على مفتاح API من NCBI لحدود معدل أعلى (10 طلبات/ثانية مقابل 3)

تجنب

  • استخدام مصطلحات النص الحر فقط بدون مصطلحات MeSH يفوت المقالات المفهرسة
  • تشغيل العديد من طلبات واجهة برمجة التطبيقات الصغيرة بدلاً من عمليات الدفعة يهدر حدود المعدل
  • عدل تخزين النتائج مؤقتًا يؤدي إلى استدعاءات واجهة برمجة تطبيقات متكررة وسير عمل أبطأ
  • تجاهل الربط التلقائي للمصطلحات يمكن أن ينتج نتائج بحث غير متوقعة

الأسئلة المتكررة

ما الفرق بين مصطلحات MeSH والبحث في كلمات النص؟
تبحث مصطلحات MeSH في الفهرس المفردات الخاضعة للرقابة حيث يتم وضع علامة على جميع المقالات يدويًا. تبحث كلمات النص فقط في المصطلحات التي تظهر في العناوين والملخصات. يوفر الجمع بين كليهما تغطية شاملة.
كيف أحصل على مفتاح API لـ PubMed E-utilities؟
سجل للحصول على حساب NCBI مجاني على ncbi.nlm.nih.gov، ثم قم بزيارة إعدادات حسابك لتوليد مفتاح API. قم بتضمينه في الطلبات مع معامل api_key لحدود معدل أعلى.
ما هي حدود معدل PubMed؟
بدون مفتاح API: 3 طلبات في الثانية. مع مفتاح API: 10 طلبات في الثانية. قم دائمًا بتضمين رأس User-Agent وصفي في طلباتك.
كيف أتعامل مع مجموعات النتائج الكبيرة التي تحتوي على آلاف المقالات؟
استخدم خادم السجل: أولاً استدعاء ESearch مع usehistory=y لتخزين النتائج، ثم استخدام معاملات WebEnv وQueryKey مع ESummary أو EFetch لاسترداد البيانات في دفعات تصل إلى 500 سجل لكل طلب.
ما هي تنسيقات التصدير المتاحة لنتائج PubMed؟
تشمل التنسيقات الشائعة MEDLINE (نص) و XML (بيانات منظمة) و RIS (مدير المراجع) و NBIB (EndNote). استخدم معاملي rettype و retmode لتحديد التنسيق المطلوب.
كيف أجد المقالات التي تستشهد ببحث محدد؟
استخدم أداة ELink مع dbfrom=pubmed و db=pubmed و cmd=cite. هذا يُرجع PMIDs للمقالات التي تستشهد بالمقالة المدخلة. لاحظ أن بيانات الاستشهاد قد لا تكون كاملة للمنشورات الحديثة جدًا.

تفاصيل المطور

المؤلف

K-Dense-AI

الترخيص

Unknown

المستودع

https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/pubmed-database

مرجع

main

بنية الملفات

📁 references/

📄 api_reference.md

📄 common_queries.md

📄 search_syntax.md

📄 SKILL.md