Fähigkeiten pubchem-database
🧪

pubchem-database

Sicher 🌐 Netzwerkzugriff📁 Dateisystemzugriff

استعلام قاعدة بيانات بابكيم الكيميائية

Auch verfügbar von: davila7

يحتاج الباحثون إلى وصول سريع إلى الخصائص الجزيئية والهياكل الكيميائية. تتصل هذه الأداة بقاعدة بيانات بابكيم التي تضم أكثر من 110 مليون مركب للاستعلامات الكيميائية الحيوية الفورية.

Unterstützt: Claude Codex Code(CC)
🥉 74 Bronze
1

Die Skill-ZIP herunterladen

2

In Claude hochladen

Gehe zu Einstellungen → Fähigkeiten → Skills → Skill hochladen

3

Einschalten und loslegen

Teste es

Verwendung von "pubchem-database". ابحث عن الكافيين واعرض خصائصه الرئيسية

Erwartetes Ergebnis:

  • المركب: الكافيين (CID: 2519)
  • الصيغة الجزيئية: C8H10N4O2
  • الوزن الجزيئي: 194.19 جم/مول
  • SMILES: CN1C=NC2=C1C(=O)N(C(=O)N2C)C
  • LogP: -0.07
  • TPSA: 58.44 Ų

Verwendung von "pubchem-database". اعثر على مركبات مشابهة للأسبرين

Erwartetes Ergebnis:

  • تم العثور على 12 مركب مشابه بعتبة 85%:
  • • CID 2244: الأسبرين (مرجع)
  • • CID 3312: حمض الساليسيليك (MW: 138.12، 89% تشابه)
  • • CID 3037: حمض أسيتيل الساليسيليك (91% تشابه)
  • • CID 1983: حمض 4-أمينوساليسيليك (87% تشابه)

Verwendung von "pubchem-database". احصل على بيانات النشاط البيولوجي للأسبرين

Erwartetes Ergebnis:

  • ملخص النشاط البيولوجي لـ CID 2244:
  • إجمالي الفحوصات: 1567
  • نشط: 234 مركب إيجابي
  • غير نشط: 1189 مركب سلبي
  • غير حاسم: 144 نتائج معلقة

Sicherheitsaudit

Sicher
v4 • 1/17/2026

This is a legitimate scientific tool for querying the PubChem chemical database. Static analysis findings are false positives: the 'external commands' are Python code examples in markdown documentation, 'network' calls go to official NIH/NCBI servers, and 'weak cryptographic algorithm' detections are keyword false positives in a non-cryptographic context. No actual cryptographic code, command injection risks, or malicious behavior exists.

5
Gescannte Dateien
1,926
Analysierte Zeilen
2
befunde
4
Gesamtzahl Audits

Risikofaktoren

🌐 Netzwerkzugriff (2)
scripts/bioactivity_query.py:21-22 scripts/bioactivity_query.py:28-50
📁 Dateisystemzugriff (1)
SKILL.md:203-204
Auditiert von: claude Audit-Verlauf anzeigen →

Qualitätsbewertung

64
Architektur
100
Wartbarkeit
85
Inhalt
21
Community
100
Sicherheit
78
Spezifikationskonformität

Was du bauen kannst

فحص المرشحين للأدوية

فحص المركبات بحثاً عن خصائص شبيهة بالأدوية باستخدام قاعدة ليبينسكي الخمسة

تحليل العلاقة بين البنية والنشاط

العثور على مركبات متشابهة هيكلياً ومقارنة أنشطتها البيولوجية

تحويل المعرفات الكيميائية

التحويل بين SMILES و InChI وأسماء المركبات للنشر

Probiere diese Prompts

بحث أساسي عن مركب 
ابحث في بابكيم عن الأسبرين واعرض صيغته الجزيئية ووزنه و SMILES
مقارنة الخصائص 
احصل على الخصائص الجزيئية للأسبرين والإيبوبروفين والنابروكسين. قارن قيم LogP الخاصة بها
بحث بالتشابه 
ابحث عن مركبات مشابهة للإيماتينيب بعتبة تشابه 85%، ثم قم بتصفية MW 200-600
فحص البنية الفرعية 
اعثر على جميع المركبات التي تحتوي على حلقة البنزين واحسب متوسط وزنها الجزيئي

Bewährte Verfahren

  • استخدم CID بدلاً من الأسماء للاستعلامات المتكررة لتحسين الأداء
  • قم بتنفيذ تأخير من 0.2 إلى 0.3 ثانية بين الطلبات لاحترام حدود المعدل
  • قم بتخزين النتائج مؤقتاً محلياً للمركبات التي يتم الوصول إليها بشكل متكرر

Vermeiden

  • لا تقدم أكثر من 5 طلبات في الثانية لتجنب حدود المعدل
  • تجنب البحث بالأسماء الشائعة دون التحقق من المرادفات أولاً
  • لا تتجاهل معالجة الأخطاء للمركبات التي قد لا توجد

Häufig gestellte Fragen

ما هو بابكيم؟
بابكيم هي أكبر قاعدة بيانات كيميائية متاحة مجاناً في العالم مع أكثر من 110 مليون مركب، والتي تتم صيانتها بواسطة NCBI/NIH.
كيف أبحث بالبنية الكيميائية؟
استخدم سلاسل SMILES أو تدوين InChI. مثال: 'CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O' للأسبرين.
ما الخصائص التي يمكنني استرجاعها؟
الوزن الجزيئي، LogP، TPSA، عدد الروابط الهيدروجينية، وأكثر من 50 مؤشراً جزيئياً آخر.
لماذا أحصل على أخطاء انتهاء المهلة؟
عمليات البحث بالتشابه والبنية الفرعية غير متزامنة وقد تستغرق من 15 إلى 30 ثانية. قم بتقليل MaxRecords إذا لزم الأمر.
هل يمكنني تحميل الهياكل الجزيئية؟
نعم، يمكنك التحميل كصور PNG أو ملفات SDF أو تنسيق JSON باستخدام وظائف التحميل.
هل هناك حد للمعدل؟
نعم، حد أقصى 5 طلبات في الثانية و 400 طلب في الدقيقة لضمان الاستخدام العادل.

Entwicklerdetails

Lizenz

MIT

Repository

https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/pubchem-database

Ref

main

Dateistruktur

📁 references/

📄 api_reference.md

📁 scripts/

📄 bioactivity_query.py

📄 compound_search.py

📄 SKILL.md