brenda-database
استعلام بيانات الإنزيم من قاعدة بيانات BRENDA
متاح أيضًا من: davila7
الوصول إلى بيانات حركية الإنزيم الشاملة من أكبر قاعدة بيانات للإنزيمات في العالم. ابحث عن قيم Km ومعادلات التفاعل ومعايير الكائنات المحددة وبيانات خصوصية الركيزة للبحث البيوكيميائي وهندسة الأيض.
تنزيل ZIP المهارة
رفع في Claude
اذهب إلى Settings → Capabilities → Skills → Upload skill
فعّل وابدأ الاستخدام
اختبرها
استخدام "brenda-database". Get Km values for alcohol dehydrogenase (EC 1.1.1.1) for human and yeast
النتيجة المتوقعة:
- بيانات حركية كحول ديهدروجيناز (EC 1.1.1.1):
- البشر:
- - متوسط Km: 0.34 ميلي مول (إيثانول)
- - الرقم الهيدروجيني الأمثل: 8.0-9.0
- - درجة الحرارة: 25 درجة مئوية (نقاط البيانات: 15)
- خميرة الخبز:
- - متوسط Km: 1.2 ميلي مول (إيثانول)
- - الرقم الهيدروجيني الأمثل: 7.0-8.0
- - درجة الحرارة: 30 درجة مئوية (نقاط البيانات: 8)
- العوامل المساعدة: NAD+ مطلوب لكلا الكائنين
التدقيق الأمني
مخاطر منخفضةThe brenda-database skill is a legitimate scientific tool for accessing enzyme data from the BRENDA database. All 436 static findings are false positives triggered by documentation formatting (backtick characters for code blocks), legitimate BRENDA API authentication (SHA-256 password hashing), and biochemical terminology (NAD+, ATP as cofactors, not C2 commands). The codebase performs authorized SOAP API queries to a public scientific database and exports research data. No malicious behavior, data exfiltration, or unauthorized access patterns were found.
عوامل الخطر
🌐 الوصول إلى الشبكة (1)
📁 الوصول إلى نظام الملفات (1)
⚡ يحتوي على سكربتات (1)
درجة الجودة
ماذا يمكنك بناءه
تحليل حركية الإنزيم
استرجاع قيم Km و kcat لتوصيف سلوك الإنزيم والمقارنة عبر الكائنات الحية.
تصميم المسار
العثور على إنزيمات لتفاعلات محددة وتحسين الظروف لبناء مسار الأيض.
استخراج بيانات الأدبيات
استخراج معايير الإنزيم من بيانات BRENDA المنشورة للنمذجة الحسابية والتحليل.
جرّب هذه الموجهات
احصل على قيم Km لإنزيم كحول ديهدروجيناز (EC 1.1.1.1) من BRENDA.
ابحث عن قيم Km لـ EC 1.1.1.1 في الإشريكية القولونية والبشر.
اعثر على جميع التفاعلات التي تشمل الغلوكوز وأرقام EC للإنزيمات الخاصة بها.
اعثر على المسار الأنزيمي لإنتاج اللاكتات من البيروفات بما في ذلك جميع العوامل المساعدة المطلوبة.
أفضل الممارسات
- تخزين بيانات اعتماد BRENDA في متغيرات البيئة للمصادقة الآمنة
- إضافة تأخيرات تحديد المعدل (0.5-1 ثانية) بين استدعاءات API لتجنب حدود المعدل
- استخدام أرقام EC محددة ومرشحات الكائنات الحية لتقليل حجم البيانات وتحسين أوقات الاستجابة
تجنب
- إجراء طلبات API متزامنة بدون تأخيرات سيؤدي إلى تفعيل تحديد المعدل
- استخدام أحرف البدل للبحث الواسع دون تحديد النتائج يمكن أن يُرجع مجموعات بيانات ضخمة
- عدم تخزين النتائج مؤقتاً للاستعلامات المتكررة يهدر حصة API ويبطئ الأداء
الأسئلة المتكررة
هل أحتاج إلى حساب BRENDA؟
ما هو رقم EC؟
ماذا يمثل Km؟
كم عدد الطلبات التي يمكنني إجراؤها؟
ما التنسيقات المدعومة للبيانات؟
هل يمكنني البحث حسب الكائن الحي؟
تفاصيل المطور
المؤلف
K-Dense-AIالترخيص
MIT
المستودع
https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/brenda-databaseمرجع
main
بنية الملفات