uniprot-database
البحث في قاعدة بيانات البروتينات UniProt
También disponible en: K-Dense-AI
هل تحتاج إلى العثور على تسلسلات البروتينات والتعليقات التوضيحية من UniProt؟ استعلم عن قواعد بيانات البروتينات بالاسم أو الجين أو رقم الانضمام أو الكائن الحي. استرجع التسلسلات، وقم بتعيين المعرفات، واحصل على التعليقات التوضيحية الوظيفية عبر REST API.
Descargar el ZIP de la skill
Subir en Claude
Ve a Configuración → Capacidades → Skills → Subir skill
Activa y empieza a usar
Pruébalo
Usando "uniprot-database". البحث عن بروتينات الهيموجلوبين البشرية ذات الحالة المراجعة
Resultado esperado:
- تم العثور على 3 بروتينات هيموجلوبين بشرية مراجعة:
- • P68871 - HBB (Hemoglobin subunit beta) - Length: 147 aa
- • P69905 - HBA1 (Hemoglobin subunit alpha 1) - Length: 142 aa
- • P69902 - HBA2 (Hemoglobin subunit alpha 2) - Length: 142 aa
Usando "uniprot-database". الحصول على تسلسل FASTA للأنسولين البشري
Resultado esperado:
- تم استرجاع التسلسل لـ P01308 (INS_HUMAN):
- >sp|P01308|INS_HUMAN Insulin precursor - Homo sapiens (Human)
- MALWMRLLPLLALLALWGPDPAAAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKT...
Auditoría de seguridad
SeguroLegitimate bioinformatics tool providing read-only access to the authoritative UniProt protein database via HTTPS. All static analysis findings are false positives: markdown code fences were misidentified as shell commands, HTTPS URLs as weak crypto, and legitimate API calls as reconnaissance. The actual code contains no malicious patterns.
Factores de riesgo
⚡ Contiene scripts (1)
🌐 Acceso a red (1)
Puntuación de calidad
Lo que puedes crear
البحث عن وظيفة البروتين
العثور على تسلسلات البروتينات والتعليقات التوضيحية الوظيفية ومصطلحات GO والمراجع المتقاطعة لمشاريع تحليل الجينات.
استرجاع التسلسلات دفعة واحدة
تنزيل مجموعات بيانات بروتينية كبيرة بتنسيق FASTA لعلم الوراثة العرقي أو التنبؤ بالبنية أو التحليل المقارن.
تعيين معرفات البروتينات
تحويل معرفات البروتينات بين UniProt وPDB وقواعد البيانات الأخرى لدمج مصادر البيانات.
Prueba estos prompts
Search UniProt for insulin proteins in humans using the query: 'insulin AND organism_name:"Homo sapiens"' and return the results in JSON format.
Retrieve the protein sequence for UniProt accession P01308 in FASTA format.
Map the UniProt accessions P01308 and P04637 to their corresponding PDB IDs using the ID mapping service.
Search UniProt for reviewed human kinases that have PDB structures. Use the query: 'protein_name:kinase AND organism_id:9606 AND reviewed:true AND xref:pdb'. Return accession, gene names, and PDB cross-references in JSON format.
Mejores prácticas
- استخدم reviewed:true في الاستعلامات للحصول على إدخالات Swiss-Prot عالية الجودة للتعليقات التوضيحية الموثوقة
- اطلب الحقول الضرورية فقط باستخدام معامل fields لتقليل النطاق الترددي وتحسين وقت الاستجابة
- قم بتطبيق معالجة الأخطاء المناسبة باستخدام response.raise_for_status() لاكتشاف فشل API مبكراً
Evitar
- لا تقم بإجراء استدعاءات API غير محدودة دون تحديد المعدل؛ يفرض UniProt سياسات الاستخدام
- لا تفترض أن جميع إدخالات TrEMBL لديها تحقق تجريبي؛ فهي تنبؤات حسابية
- لا تتجاهل المعرفات الفاشلة في نتائج تعيين المعرفات؛ تحقق من حقل failedIds للتعيينات غير المكتملة