gwas-database
آمن 69查詢 GWAS 目錄以獲取 SNP 性狀關聯
بواسطة K-Dense-AI
存取來自 NHGRI-EBI GWAS 目錄的全基因組關聯研究資料。透過 rs ID、性狀或基因進行變異搜尋,以檢索遺傳研究所需的 p 值、效應量和摘要統計資料。
gtars
آمن 71分析基因組區間和覆蓋軌跡
بواسطة K-Dense-AI
處理和分析基因組區間數據以進行生物資訊學研究。Gtars 提供高效能工具,用於重疊檢測、覆蓋分析和基因組序列的機器學習標記化。
gget
آمن 78查詢基因組資料庫以獲取基因資訊和序列
بواسطة K-Dense-AI
gget 透過簡單的 CLI 或 Python 介面,提供對 20 多個基因組資料庫的統一存取。查詢基因資訊、檢索序列、執行 BLAST 搜尋,以及執行富集分析,無需管理多個 API 連線。
get-available-resources
مخاطر منخفضة 69偵測科學運算的系統資源
بواسطة K-Dense-AI
科學運算任務需要硬體資訊以選擇最佳計算策略。此技能會自動偵測 CPU 核心數、GPU 可用性、記憶體與磁碟空間,並產生平行處理與 GPU 加速的建議。
geopandas
آمن 71處理地理空間向量資料
بواسطة K-Dense-AI
GeoPandas 擴展了 pandas 的地理空間操作功能。它可以讀取 shapefile、GeoJSON 和 PostGIS 資料。執行空間連接、緩衝分析、座標轉換,並透過 matplotlib 整合創建分級填色圖。
geo-database
مخاطر منخفضة 67存取 NCBI GEO 基因表現資料
بواسطة K-Dense-AI
研究人員需要有效率地存取基因表現資料集以進行分析。此技能可查詢、下載及分析來自 NCBI GEO 資料庫的資料,該資料庫包含數百萬筆基因體學樣本。
geniml
آمن 71使用機器學習分析基因組區間
بواسطة K-Dense-AI
Geniml 將 BED 文件轉換為機器學習嵌入,用於基因組區域分析。訓練模型以尋找染色質可及性模式,建立共識峰值集,並分析單細胞 ATAC-seq 數據。
generate-image
آمن 71使用 FLUX 和 Gemini 生成 AI 圖片
بواسطة K-Dense-AI
使用 AI 模型為簡報、文件和出版物建立高品質圖片。使用簡單的文字提示產生原創作品或編輯現有圖片。透過 OpenRouter API 存取 FLUX 和 Gemini 模型。
gene-database
مخاطر منخفضة 73查詢 NCBI 基因資料庫
بواسطة K-Dense-AI
存取來自 NCBI 的全面基因數據,包括序列、註釋和功能資訊。可透過基因符號、ID 或生物背景進行搜尋,以檢索 RefSeq、基因本體論、染色體位置和表型資訊,用於生物資訊學研究。
fluidsim
آمن 71使用 Python 流體模擬工具 FluidSim 執行 CFD 模擬
بواسطة K-Dense-AI
FluidSim 將高效能計算流體動力學帶入 Python。透過簡單的 Python 指令執行 Navier-Stokes 模擬、分析紊流並視覺化結果。無需複雜的 Fortran 或 C++ 設定。
flowio
آمن 69讀取和寫入 FCS 流式細胞術檔案
بواسطة K-Dense-AI
流式細胞術資料需要專業的檔案處理。FlowIO 能解析 FCS 檔案、將事件資料擷取為 NumPy 陣列,並可轉換為 CSV 格式以供下游分析管線使用。
fda-database
آمن 76查詢FDA藥品和醫療器材數據庫
بواسطة K-Dense-AI
透過官方openFDA API存取全面的FDA監管數據,包括藥品不良事件、醫療器材召回和安全資訊。使用Python建立藥物警戒和監管研究工作流程。
exploratory-data-analysis
آمن 80自動分析科學數據檔案
بواسطة K-Dense-AI
科學數據檔案有數百種格式。此技能可自動偵測檔案類型、提取元數據、評估數據品質,並產生帶有格式特定分析建議的綜合 markdown 報告。
etetoolkit
آمن 76使用 ETE 工具包分析系統發育樹
بواسطة K-Dense-AI
ETE 工具包簡化進化生物學研究的系統發育分析。處理樹數據、檢測進化事件並創建可發表的視覺化。
esm
آمن 71使用 ESM 生成和設計蛋白質
بواسطة K-Dense-AI
蛋白質工程需要分析和設計新穎的蛋白質序列。ESM 提供最先進的蛋白質語言模型,用於生成序列、預測結構,並為下游分析創建嵌入向量。使用 ESM3 進行跨序列、結構和功能的生成任務,或使用 ESM C 進行高效的表示學習。
ensembl-database
آمن 75查詢 Ensembl 基因組數據庫
بواسطة K-Dense-AI
查詢 Ensembl 基因組數據庫 REST API 以獲取脊椎動物基因組數據。查找基因、檢索序列、使用 VEP 分析變異,並在 250 多個物種中進行比較基因組學。
ena-database
مخاطر منخفضة 66查詢歐洲核苷酸資料庫
بواسطة K-Dense-AI
研究人員需要高效存取基因組數據以進行分析。此技能透過 REST API 和 FTP 提供對 ENA 的程式化存取,可依登錄號檢索 DNA/RNA 序列、FASTQ 檔案和基因組組裝。
drugbank-database
آمن 77存取 DrugBank 藥物資料庫資訊
بواسطة K-Dense-AI
DrugBank 是一個包含詳細藥物資訊的綜合生物資訊學資料庫。此技能可程式化地存取藥物特性、交互作用、標靶、路徑和化學結構,用於藥理學研究和藥物發現。
docx
آمن 71建立和編輯 Word 文件
بواسطة K-Dense-AI
此技能提供完整的 Word 文件操作工具包。可以使用 JavaScript 從頭建立新文件,使用 Python 編輯現有文件,並透過適當的 OOXML 合規性管理追蹤修訂和註釋。
dnanexus-integration
آمن 72整合 DNAnexus 基因組學平台工作流程
بواسطة K-Dense-AI
DNAnexus 提供基於雲端的基因組學分析,但需要平台特定的知識。本技能提供完整的文件,用於建構應用程式、管理資料以及執行生物資訊學工作流程。