196 مهارات
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gget

آمن 77

查詢基因組資料庫並分析序列

بواسطة davila7

需要快速存取基因資訊、蛋白質結構或表現數據?此技能提供透過單一介面統一存取20多個生物資訊學資料庫的功能。搜尋基因、檢索序列、預測結構並分析疾病關聯,無需切換工具。

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geo-database

آمن 68

從 NCBI GEO 搜尋及下載基因表現資料

بواسطة davila7

尋找及處理基因表現資料集需要導航複雜的資料庫結構和檔案格式。這個技能提供可立即使用的程式碼模式,用於搜尋、下載及分析 GEO 微陣列和 RNA-seq 資料。

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geniml

آمن 71

使用機器學習分析基因組區域

بواسطة davila7

處理基因組區間資料進行機器學習任務需要專門的工具。Geniml 提供無監督方法來學習基因組區域、單細胞和元資料標籤的嵌入,用於相似性搜索、聚類和下游分析。

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gene-database

مخاطر منخفضة 73

查詢 NCBI Gene 資料庫

بواسطة davila7

從 NCBI Gene 資料庫搜尋和檢索基因資訊。取得基因符號、RefSeq 序列、GO 註釋、染色體位置和表型關聯,用於研究和分析。

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esm

آمن 73

使用 ESM 生成和設計蛋白質

بواسطة davila7

蛋白質工程需要專門的 AI 模型來分析序列-結構-功能關係。ESM 提供最先進的蛋白質語言模型,用於生成新序列、預測結構,以及通過多模態 AI 設計功能性蛋白質。

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ensembl-database

آمن 77

查詢超過 250 個物種的 Ensembl 基因組資料庫

بواسطة davila7

基因組研究人員需要存取跨物種的基因序列、變異和比較數據。此技能查詢 Ensembl 資料庫 REST API 以檢索超過 250 個脊椎動物物種的基因資訊、DNA 序列、變異預測、直系同源基因和調控特徵。

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ena-database

آمن 69

搜尋 ENA 核苷酸檔案庫

بواسطة davila7

尋找和下載核苷酸序列需要了解複雜的 API 語法和多個端點模式。此技能提供查詢歐洲核苷酸檔案庫的完整文檔,以便通過登錄號檢索 DNA/RNA 序列、基因組組裝和原始測序讀數。

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denario

آمن 73

自動化科學研究工作流程

بواسطة davila7

Denario 自動化從資料分析到發表的完整研究流程。它使用 AI 代理生成假設、開發方法論、執行實驗並產生符合期刊格式的論文。

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cosmic-database

آمن 75

從 COSMIC 資料庫下載癌症突變資料

بواسطة davila7

癌症研究人員需要以程式化方式存取全球最大的體細胞突變資料庫。此技能可透過驗證下載 COSMIC 癌症基因體資料,包括突變、基因註釋和臨床變異,用於研究和精準腫瘤學。

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clinicaltrials-database

مخاطر منخفضة 73

搜尋 ClinicalTrials.gov 臨床試驗資料庫

بواسطة davila7

為患者、研究或藥物開發尋找臨床試驗需要 navigat一個複雜的註冊系統。此技能提供 Python 介面來查詢官方 ClinicalTrials.gov 資料庫。可依據病症、藥物、地點或贊助者搜尋,尋找正在招募的試驗、檢索詳細的研究資訊,並匯出資料進行分析。

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citation-management

آمن 79

使用 BibTeX 管理學術引用

بواسطة davila7

手動管理引用既耗時又容易出錯。此技能可自動搜尋學術資料庫、從 DOI 和 PMID 提取元數據、驗證引用,並生成可供發表的 BibTeX 條目。

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chembl-database

مخاطر منخفضة 74

查詢 ChEMBL 生物活性分子資料庫

بواسطة davila7

搜尋藥物發現資料需要查詢多個資料庫並理解複雜的 API 查詢。此技能提供現成可用的功能,用於查詢 ChEMBL 超過 200 萬種生物活性化合物、1900 萬筆生物活性測量數據及核准藥物的資料庫。

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cellxgene-census

آمن 69

查詢 6100 萬+ 單細胞基因組數據集

بواسطة davila7

研究人員需要高效存取群體規模的單細胞數據以進行基因組學研究。此技能提供 AI 驅動的 CZ CELLxGENE Census 存取功能,具備優化的查詢模式和下游分析整合指南。

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brenda-database

مخاطر منخفضة 73

查詢 BRENDA 酶資料庫的動力學數據

بواسطة davila7

從文獻中尋找酶動力學參數需要大量搜尋工作。此技能透過簡單介面直接存取 BRENDA 資料庫,用於檢索 Km 值、反應方程式以及特定生物體的酶數據,適用於生化研究。

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bioservices

مخاطر منخفضة 76

存取生物資訊學資料庫

بواسطة davila7

研究人員需要從多個資料庫檢索生物資料。此技能提供對40多項生物資訊學服務的統一存取,包括UniProt、KEGG、ChEMBL和Reactome,可用於蛋白質序列、代謝途徑、化合物和交互作用分析。

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biorxiv-database

مخاطر منخفضة 74

搜尋 bioRxiv 預印本

بواسطة davila7

尋找生命科學預印本需要手動瀏覽 bioRxiv 或使用多種工具。此技能提供統一的 Python 介面,可依關鍵字、作者、類別和日期範圍進行搜尋,然後以結構化 JSON 格式下載論文和元資料。

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biomni

مخاطر متوسطة 69

使用 AI 執行自主生物醫學研究

بواسطة davila7

複雜的生物醫學研究任務需要專業知識和重複性的分析步驟。Biomni 利用 LLM 驅動的推理和整合的生物醫學資料庫,自動化跨基因組學、藥物發現和臨床基因組學的多步驟研究工作流程。

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astropy

آمن 73

處理天文數據和計算

بواسطة davila7

天文研究需要精確處理天球座標、物理單位和專門的數據格式。此技能提供使用 astropy 進行座標轉換、FITS 檔案操作、宇宙學計算和時間尺度轉換的專業指導。

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alphafold-database

آمن 70

透過 UniProt ID 存取 AlphaFold 蛋白質結構

بواسطة davila7

AlphaFold DB 提供超過 2 億個 AI 預測的蛋白質結構。此技能協助研究人員檢索結構檔案、分析信賴度分數,並將預測整合到藥物發現和結構生物學的運算流程中。

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adaptyv

آمن 71

透過雲端實驗室實驗驗證蛋白質設計

بواسطة davila7

設計蛋白質但缺乏濕式實驗室設備?直接將序列提交至 Adaptyv 的自動化雲端實驗室進行結合測定、表達測試、熱穩定性測量和酶活性分析。約 21 天內收到實驗結果。

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