gget
آمن 77查詢基因組資料庫並分析序列
بواسطة davila7
需要快速存取基因資訊、蛋白質結構或表現數據?此技能提供透過單一介面統一存取20多個生物資訊學資料庫的功能。搜尋基因、檢索序列、預測結構並分析疾病關聯,無需切換工具。
geo-database
آمن 68從 NCBI GEO 搜尋及下載基因表現資料
بواسطة davila7
尋找及處理基因表現資料集需要導航複雜的資料庫結構和檔案格式。這個技能提供可立即使用的程式碼模式,用於搜尋、下載及分析 GEO 微陣列和 RNA-seq 資料。
geniml
آمن 71使用機器學習分析基因組區域
بواسطة davila7
處理基因組區間資料進行機器學習任務需要專門的工具。Geniml 提供無監督方法來學習基因組區域、單細胞和元資料標籤的嵌入,用於相似性搜索、聚類和下游分析。
gene-database
مخاطر منخفضة 73查詢 NCBI Gene 資料庫
بواسطة davila7
從 NCBI Gene 資料庫搜尋和檢索基因資訊。取得基因符號、RefSeq 序列、GO 註釋、染色體位置和表型關聯,用於研究和分析。
esm
آمن 73使用 ESM 生成和設計蛋白質
بواسطة davila7
蛋白質工程需要專門的 AI 模型來分析序列-結構-功能關係。ESM 提供最先進的蛋白質語言模型,用於生成新序列、預測結構,以及通過多模態 AI 設計功能性蛋白質。
ensembl-database
آمن 77查詢超過 250 個物種的 Ensembl 基因組資料庫
بواسطة davila7
基因組研究人員需要存取跨物種的基因序列、變異和比較數據。此技能查詢 Ensembl 資料庫 REST API 以檢索超過 250 個脊椎動物物種的基因資訊、DNA 序列、變異預測、直系同源基因和調控特徵。
ena-database
آمن 69搜尋 ENA 核苷酸檔案庫
بواسطة davila7
尋找和下載核苷酸序列需要了解複雜的 API 語法和多個端點模式。此技能提供查詢歐洲核苷酸檔案庫的完整文檔,以便通過登錄號檢索 DNA/RNA 序列、基因組組裝和原始測序讀數。
denario
آمن 73自動化科學研究工作流程
بواسطة davila7
Denario 自動化從資料分析到發表的完整研究流程。它使用 AI 代理生成假設、開發方法論、執行實驗並產生符合期刊格式的論文。
cosmic-database
آمن 75從 COSMIC 資料庫下載癌症突變資料
بواسطة davila7
癌症研究人員需要以程式化方式存取全球最大的體細胞突變資料庫。此技能可透過驗證下載 COSMIC 癌症基因體資料,包括突變、基因註釋和臨床變異,用於研究和精準腫瘤學。
clinicaltrials-database
مخاطر منخفضة 73搜尋 ClinicalTrials.gov 臨床試驗資料庫
بواسطة davila7
為患者、研究或藥物開發尋找臨床試驗需要 navigat一個複雜的註冊系統。此技能提供 Python 介面來查詢官方 ClinicalTrials.gov 資料庫。可依據病症、藥物、地點或贊助者搜尋,尋找正在招募的試驗、檢索詳細的研究資訊,並匯出資料進行分析。
citation-management
آمن 79使用 BibTeX 管理學術引用
بواسطة davila7
手動管理引用既耗時又容易出錯。此技能可自動搜尋學術資料庫、從 DOI 和 PMID 提取元數據、驗證引用,並生成可供發表的 BibTeX 條目。
chembl-database
مخاطر منخفضة 74查詢 ChEMBL 生物活性分子資料庫
بواسطة davila7
搜尋藥物發現資料需要查詢多個資料庫並理解複雜的 API 查詢。此技能提供現成可用的功能,用於查詢 ChEMBL 超過 200 萬種生物活性化合物、1900 萬筆生物活性測量數據及核准藥物的資料庫。
cellxgene-census
آمن 69查詢 6100 萬+ 單細胞基因組數據集
بواسطة davila7
研究人員需要高效存取群體規模的單細胞數據以進行基因組學研究。此技能提供 AI 驅動的 CZ CELLxGENE Census 存取功能,具備優化的查詢模式和下游分析整合指南。
brenda-database
مخاطر منخفضة 73查詢 BRENDA 酶資料庫的動力學數據
بواسطة davila7
從文獻中尋找酶動力學參數需要大量搜尋工作。此技能透過簡單介面直接存取 BRENDA 資料庫,用於檢索 Km 值、反應方程式以及特定生物體的酶數據,適用於生化研究。
bioservices
مخاطر منخفضة 76存取生物資訊學資料庫
بواسطة davila7
研究人員需要從多個資料庫檢索生物資料。此技能提供對40多項生物資訊學服務的統一存取,包括UniProt、KEGG、ChEMBL和Reactome,可用於蛋白質序列、代謝途徑、化合物和交互作用分析。
biorxiv-database
مخاطر منخفضة 74搜尋 bioRxiv 預印本
بواسطة davila7
尋找生命科學預印本需要手動瀏覽 bioRxiv 或使用多種工具。此技能提供統一的 Python 介面,可依關鍵字、作者、類別和日期範圍進行搜尋,然後以結構化 JSON 格式下載論文和元資料。
biomni
مخاطر متوسطة 69使用 AI 執行自主生物醫學研究
بواسطة davila7
複雜的生物醫學研究任務需要專業知識和重複性的分析步驟。Biomni 利用 LLM 驅動的推理和整合的生物醫學資料庫,自動化跨基因組學、藥物發現和臨床基因組學的多步驟研究工作流程。
astropy
آمن 73處理天文數據和計算
بواسطة davila7
天文研究需要精確處理天球座標、物理單位和專門的數據格式。此技能提供使用 astropy 進行座標轉換、FITS 檔案操作、宇宙學計算和時間尺度轉換的專業指導。
alphafold-database
آمن 70透過 UniProt ID 存取 AlphaFold 蛋白質結構
بواسطة davila7
AlphaFold DB 提供超過 2 億個 AI 預測的蛋白質結構。此技能協助研究人員檢索結構檔案、分析信賴度分數,並將預測整合到藥物發現和結構生物學的運算流程中。
adaptyv
آمن 71透過雲端實驗室實驗驗證蛋白質設計
بواسطة davila7
設計蛋白質但缺乏濕式實驗室設備?直接將序列提交至 Adaptyv 的自動化雲端實驗室進行結合測定、表達測試、熱穩定性測量和酶活性分析。約 21 天內收到實驗結果。