395 技能
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histolab

安全 72

處理數位病理學的全切片影像

由 K-Dense-AI

Histolab 自動化從數十億像素的全切片影像中進行組織偵測和 tiles 擷取。它處理 WSI 檔案,為深度學習管線和醫學研究提取資訊豐富的 tiles。

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gwas-database

安全 68

查詢 GWAS 目錄以獲取 SNP 性狀關聯

由 K-Dense-AI

存取來自 NHGRI-EBI GWAS 目錄的全基因組關聯研究資料。透過 rs ID、性狀或基因進行變異搜尋,以檢索遺傳研究所需的 p 值、效應量和摘要統計資料。

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gtars

安全 71

分析基因組區間和覆蓋軌跡

由 K-Dense-AI

處理和分析基因組區間數據以進行生物資訊學研究。Gtars 提供高效能工具,用於重疊檢測、覆蓋分析和基因組序列的機器學習標記化。

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gget

安全 77

查詢基因組資料庫以獲取基因資訊和序列

由 K-Dense-AI

gget 透過簡單的 CLI 或 Python 介面,提供對 20 多個基因組資料庫的統一存取。查詢基因資訊、檢索序列、執行 BLAST 搜尋,以及執行富集分析,無需管理多個 API 連線。

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get-available-resources

低風險 69

偵測科學運算的系統資源

由 K-Dense-AI

科學運算任務需要硬體資訊以選擇最佳計算策略。此技能會自動偵測 CPU 核心數、GPU 可用性、記憶體與磁碟空間,並產生平行處理與 GPU 加速的建議。

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geopandas

安全 71

處理地理空間向量資料

由 K-Dense-AI

GeoPandas 擴展了 pandas 的地理空間操作功能。它可以讀取 shapefile、GeoJSON 和 PostGIS 資料。執行空間連接、緩衝分析、座標轉換,並透過 matplotlib 整合創建分級填色圖。

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flowio

安全 69

讀取和寫入 FCS 流式細胞術檔案

由 K-Dense-AI

流式細胞術資料需要專業的檔案處理。FlowIO 能解析 FCS 檔案、將事件資料擷取為 NumPy 陣列,並可轉換為 CSV 格式以供下游分析管線使用。

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fda-database

安全 75

查詢FDA藥品和醫療器材數據庫

由 K-Dense-AI

透過官方openFDA API存取全面的FDA監管數據,包括藥品不良事件、醫療器材召回和安全資訊。使用Python建立藥物警戒和監管研究工作流程。

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exploratory-data-analysis

安全 80

自動分析科學數據檔案

由 K-Dense-AI

科學數據檔案有數百種格式。此技能可自動偵測檔案類型、提取元數據、評估數據品質,並產生帶有格式特定分析建議的綜合 markdown 報告。

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drugbank-database

安全 77

存取 DrugBank 藥物資料庫資訊

由 K-Dense-AI

DrugBank 是一個包含詳細藥物資訊的綜合生物資訊學資料庫。此技能可程式化地存取藥物特性、交互作用、標靶、路徑和化學結構,用於藥理學研究和藥物發現。

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deeptools

安全 79

使用 deepTools 分析 NGS 資料

由 K-Dense-AI

處理並視覺化下一代定序資料。將 BAM 轉換為 bigWig、產生品質控制圖表,並為 ChIP-seq、RNA-seq 和 ATAC-seq 實驗建立可發表的熱圖。

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deepchem

安全 75

將機器學習應用於化學和藥物發現

由 K-Dense-AI

使用 DeepChem 預測分子的溶解度、毒性和結合親和力等屬性。訓練圖神經網絡或使用預訓練模型(如 ChemBERTa)進行藥物發現和材料科學應用。

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datacommons-client

低風險 70

從 Data Commons 查詢公共統計數據

由 K-Dense-AI

存取來自 Data Commons 的全球統計數據,包括人口、經濟、健康和環境指標。使用 Python 客戶端方法查詢人口數據、GDP、失業率和地理關係。

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dask

安全 71

使用 Dask 分散式運算擴展 pandas 和 NumPy

由 K-Dense-AI

使用平行運算處理超過可用 RAM 的資料集。將單機 pandas 和 NumPy 工作流程轉換為可在多核心或分散式叢集上運行的程式碼,無需重寫程式碼。

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cobrapy

安全 69

使用COBRApy分析代謝模型

由 K-Dense-AI

代謝建模需要約束基礎重建和分析方法的專業知識。COBRApy為系統生物學研究提供了一個全面的Python介面,用於通量平衡分析、基因剔除研究和生產包絡線計算。

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clinicaltrials-database

安全 75

搜尋 ClinicalTrials.gov 以尋找醫學研究

由 K-Dense-AI

搜尋相關的臨床試驗需要查詢大型註冊資料庫。本技能提供 Python 介面來查詢 ClinicalTrials.gov API v2,可依疾病、藥物、地點或贊助者搜尋試驗,並擷取詳細的研究資訊。

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clinical-reports

安全 78

撰寫符合規範的臨床報告

由 K-Dense-AI

臨床文件需要精確性和法規遵循。本技能提供病例報告、診斷報告、臨床試驗文件和患者記錄的範本和驗證工具,符合 HIPAA、FDA 和 ICH-GCP 標準。

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chembl-database

安全 75

查詢 ChEMBL 生物活性分子與藥物發現數據

由 K-Dense-AI

存取 ChEMBL 資料庫以按結構和屬性搜索化合物。檢索生物活性測量數據,尋找抑制劑,並進行結構-活性關係研究以支援藥物發現研究。

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brenda-database

低風險 72

從 BRENDA 資料庫查詢酶數據

由 K-Dense-AI

存取來自全球最大酶資料庫的綜合酶動力學數據。查找 Km 值、反應方程式、生物體特定參數和底物特異性數據,用於生物化學研究和代謝工程。

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bioservices

安全 77

從 Python 存取生物資訊學資料庫

由 K-Dense-AI

用一致的 Python API 查詢 40 多個生物資料庫,包括 UniProt、KEGG 和 ChEMBL。簡化生物資訊學研究中的跨資料庫分析和識別符轉換。

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