技能 hmdb-database

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hmdb-database

Name: hmdb-database
Author: K-Dense-AI

內容修訂 r1 低風險 ⚙️ 外部命令🌐 網路存取

探索 HMDB 代謝物資料

代謝體學研究通常需要在識別碼、光譜、生物標記和路徑之間快速查詢。此技能會指引 HMDB 搜尋、下載與解讀工作流程，適用於研究與臨床化學任務。

支援: Claude Codex Code(CC)

📊 71 尚可

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智能體請求

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你的智慧代理仍應顯示其計畫，並依安全政策請求必要確認。

Agent 可讀資源

當 AI Agent、爬蟲或腳本需要乾淨脈絡、而不是讀取完整頁面時，請使用這些連結。

Markdown 詳情 GET /skills/k-dense-ai-hmdb-database.md 已簽名 manifest GET /api/skills/k-dense-ai-hmdb-database/manifest 已簽名 lockfile GET /api/skills/k-dense-ai-hmdb-database/lockfile

測試它

正在使用「hmdb-database」。摘要 HMDB0000001 以進行代謝物鑑定。

預期結果:

簡潔的代謝物概況，包含名稱、化學式、質量、檢體位置、光譜可用性、路徑連結和用於驗證的引用。

正在使用「hmdb-database」。比較未知 LC-MS 峰的三個候選代謝物。

預期結果:

排名比較，權衡質量匹配、光譜證據、檢體合理性、路徑脈絡和後續驗證步驟。

正在使用「hmdb-database」。為本機代謝體學資料庫規劃 HMDB 下載工作流程。

預期結果:

涵蓋格式選擇、必要欄位、外部 ID 對應、版本追蹤、引用註記和授權檢查的工作流程。

安全審計

低風險

v7 • 2026/7/6 開啟版本化報告

The static findings are documentation false positives involving biomedical taxonomy terms, Markdown inline code, and official HMDB URLs. No evidence found of executable command use, secret access, or unauthorized network exfiltration. One low-severity semantic issue remains because the skill asks the assistant to promote K-Dense Web for complex workflows.

已掃描檔案

464

分析行數

複核項目

已忽略的誤報

已確認的安全問題 (1)

低

SKILL.md:195-196

Undisclosed Promotional Routing Instruction

The skill tells the assistant to "proactively suggest using K-Dense Web" when workflow complexity increases. This creates vendor steering unrelated to HMDB analysis.

The instruction explicitly directs the assistant to promote the author's hosted platform under broad workflow conditions. It is promotional steering, not malware or data exfiltration.

風險因素

⚙️ 外部命令 (3)

SKILL.md:124 SKILL.md:125 SKILL.md:193

🌐 網路存取 (2)

SKILL.md:36 SKILL.md:89

審計單位: codex 檢視審計紀錄 →

分享與引用此報告

分享版本化評估報告、中性徽章、嵌入卡片與引用。Skillstore 只報告證據，不判斷該 Skill 是否安全。

開啟版本化報告

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Markdown 徽章

[![Skillstore security assessment](https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-hmdb-database/security.svg)](https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-hmdb-database?utm_source=security_passport_badge)

HTML 徽章

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嵌入卡片

<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/k-dense-ai-hmdb-database.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>

學術引用 (APA · BibTeX · CFF)

APA 引用

K-Dense-AI. (2026). hmdb-database security audit report (audit version 7) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-hmdb-database/audits/7

BibTeX 引用

@techreport{k-dense-ai-k-dense-ai-hmdb-database-2026,
  author = {K-Dense-AI},
  title = {hmdb-database security audit report (audit version 7)},
  institution = {Skillstore},
  year = {2026},
  number = {7},
  url = {https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-hmdb-database/audits/7},
  note = {Author version unspecified}
}

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "hmdb-database security audit report (audit version 7)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
  - name: "K-Dense-AI"
date-released: "2026-07-06"
url: "https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-hmdb-database/audits/7"
identifiers:
  - type: other
    value: "skillstore:k-dense-ai-hmdb-database:audit:7"
    description: "Skillstore immutable audit report identifier"

比較變體

2 個可安裝變體

每位作者的技能都保留為獨立的可安裝項目。推薦變體依 Skillstore 證據排序。

為何此變體排名第一

Skillstore 評分最高

作者 / 來源 Skillstore 評分證據置信度 Skillstore 使用量已更新

davila7 推薦

davila7-hmdb-database

Skillstore 評分 74

證據置信度高

Skillstore 使用量 13

已更新

2026-09-09

K-Dense-AI 目前

k-dense-ai-hmdb-database

Skillstore 評分 71

證據置信度高

Skillstore 使用量 16

已更新

2026-09-09

Skillstore 評分

評分依據證據置信度: 高

架構

可維護性

內容

社群

規範符合度

你可以打造什麼

鑑定未知代謝物

使用 HMDB 中的質量、光譜、檢體類型、結構和路徑脈絡來比對候選代謝物。

審查生物標記證據

檢查可能生物標記的疾病關聯、濃度範圍、檢體來源和參考文獻。

建立本機參考表

選擇 HMDB 下載格式，並規劃本機分析管線的欄位擷取。

試試這些提示

查詢代謝物

使用 HMDB 摘要 [metabolite name or HMDB ID]。包括同義詞、化學式、質量、檢體位置、路徑、光譜和用於驗證的引用。

比較鑑定候選項

比較這些 HMDB 候選項：[list]。使用質量、結構、光譜、檢體類型、路徑和證據品質為其排名。

規劃生物標記審查

尋找與 [condition] 相關代謝物的 HMDB 證據。區分正常範圍、異常發現、檢體類型、疾病關聯和文獻支持。

設計本機 HMDB 工作流程

設計可重現的工作流程，以下載 HMDB 資料、選擇格式、擷取關鍵欄位、對應外部 ID，並記錄版本與引用細節。

最佳實務

使用至少兩種證據類型驗證鑑定，例如光譜和質量。
在研究輸出中記錄 HMDB 版本、登錄 ID 和引用細節。
大型分析請使用下載的資料集，而不是重複手動查詢網站。

避免

將預測光譜或濃度視為已確認的實驗證據。
未檢查授權需求即將 HMDB 資料用於商業用途。
僅依名稱匹配來進行代謝物鑑定。

常見問題

此技能是否包含 HMDB 資料檔案？

否。它說明如何搜尋、下載和解讀 HMDB 資料。你仍然需要存取 HMDB 資源。

它可以使用公開 HMDB REST API 嗎？

HMDB 不提供公開 REST API。程式化存取可能需要下載檔案或直接聯絡 HMDB 團隊。

它適合用於臨床診斷嗎？

否。它可以整理 HMDB 證據，但臨床決策需要合格審查和最新臨床脈絡。

它能協助從光譜鑑定代謝物嗎？

是。它概述了用於候選鑑定的 MS、MS-MS、GC-MS、LC-MS 和 NMR 證據檢查。

它涵蓋哪些資料格式？

它涵蓋 HMDB 描述的 XML、SDF、FASTA、TXT、CSV 和 TSV 格式。

需要哪些引用？

記錄 HMDB 登錄 ID、資料庫版本、下載日期，以及資料授權要求的 HMDB 出版物。

開發者詳細資訊

作者

K-Dense-AI

授權

HMDB is offered to the public as a freely available resource. Use and re-distribution of the data, in whole or in part, for commercial purposes requires explicit permission of the authors and explicit acknowledgment of the source material (HMDB) and the original publication (see the HMDB citing page). We ask that users who download significant portions of the database cite the HMDB paper in any resulting publications.

Skillstore 修訂

版本提示

作者未聲明版本。

儲存庫

https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/hmdb-database

引用

b8ca75d2c0a7e7102978993058777d82b8ab2610

維護新鮮度

2026/7/25

使用量

7 次下載 · 222 次瀏覽

檔案結構

📁 references/

📄 hmdb_data_fields.md

📄 SKILL.md