スキル biogeobears

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biogeobears

Name: biogeobears
Author: brunoasm

コンテンツリビジョン r2 安全 📁 ファイルシステムへのアクセス⚙️ 外部コマンド🌐 ネットワークアクセス

執行 BioGeoBEARS 生物地理學分析

系統發育生物地理學工作流程可能難以格式化與重現。此技能會驗證輸入、準備 BioGeoBEARS 指令碼，並在 R 中引導模型比較。

対応: Claude Codex Code(CC)

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自分のエージェントでインストール

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エージェントリクエスト

Review the Skillstore skill "biogeobears" from https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/brunoasm-biogeobears/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.

エージェントは引き続き計画を提示し、セキュリティポリシーで必要な確認を求める必要があります。

エージェントが読めるリソース

AI エージェント、クローラー、スクリプトがページ全体ではなく整理されたコンテキストを必要とする場合は、これらのリンクを使ってください。

Markdown詳細 GET /skills/brunoasm-biogeobears.md 署名済み manifest GET /api/skills/brunoasm-biogeobears/manifest 署名済み lockfile GET /api/skills/brunoasm-biogeobears/lockfile

テストする

「biogeobears」を使用しています。研究人員提供一棵已定根的樹，以及一份物種對區域的分布表。

期待される結果:

此技能會驗證物種名稱與地理編碼。
它會準備專案資料夾，包含輸入、RMarkdown 分析、結果路徑和 README。
它會說明如何執行分析並檢閱 HTML 報告。

「biogeobears」を使用しています。使用者詢問哪個模型最能解釋島嶼鳥類分布。

期待される結果:

此技能會建議比較 DEC、DIVALIKE、BAYAREALIKE 和 +J 變體。
它會使用 AIC、AICc 和概似比檢定準備模型比較表。
它會說明如何解讀擴散、滅絕與奠基者事件估計值。

セキュリティ監査

安全

v8 • 2026/7/23 バージョン別レポートを開く

All 110 static findings were adjudicated as false positives. Most detections are Markdown or RMarkdown backticks and intentional relative paths within the generated analysis directory. The explicit file write uses a user-selected output path, with no hidden network access, reconnaissance, or untrusted command evaluation.

スキャンされたファイル

1,868

解析済み行数

レビュー項目

誤検知を無視

リスク要因

📁 ファイルシステムへのアクセス (12)

README.md:222 scripts/validate_geography_file.py:180 SKILL.md:181 SKILL.md:182 SKILL.md:185 SKILL.md:187 SKILL.md:199 SKILL.md:200 SKILL.md:203 SKILL.md:204 SKILL.md:243 SKILL.md:332

⚙️ 外部コマンド (50)

🌐 ネットワークアクセス (1)

SKILL.md:557

最新の完了済み静的・セマンティック監査では、確認済みのセキュリティ検出事項は見つかりませんでした。これは、スキルに副作用がないことを証明するものではありません。

監査者: codex 監査履歴を表示 →

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https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears/audits/8?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report

Markdownバッジ

[![Skillstore security assessment](https://skillstore.io/badges/skills/brunoasm-biogeobears/security.svg)](https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears?utm_source=security_passport_badge)

HTMLバッジ

<a href="https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/brunoasm-biogeobears/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>

埋め込みカード

<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/brunoasm-biogeobears.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>

学術引用 (APA · BibTeX · CFF)

APA形式の引用

brunoasm. (2026). biogeobears security audit report (audit version 8) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears/audits/8

BibTeX形式の引用

@techreport{brunoasm-brunoasm-biogeobears-2026,
  author = {brunoasm},
  title = {biogeobears security audit report (audit version 8)},
  institution = {Skillstore},
  year = {2026},
  number = {8},
  url = {https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears/audits/8},
  note = {Author version unspecified}
}

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "biogeobears security audit report (audit version 8)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
  - name: "brunoasm"
date-released: "2026-07-23"
url: "https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears/audits/8"
identifiers:
  - type: other
    value: "skillstore:brunoasm-biogeobears:audit:8"
    description: "Skillstore immutable audit report identifier"

Skillstore スコア

このスコアの理由証拠の信頼度: 高

アーキテクチャ

保守性

コンテンツ

コミュニティ

仕様準拠

作成できるもの

準備祖先分布範圍研究

為系統發育生物地理學分析設定已驗證的輸入、指令碼與文件。

教授可重現的 BioGeoBEARS 工作流程

為學習歷史生物地理學的學生建立清楚的資料夾結構與引導式分析步驟。

在模型擬合前檢查資料

在執行耗時的 BioGeoBEARS 最佳化工作前，找出樹與地理資料之間的不匹配。

これらのプロンプトを試す

開始基本分析

Help me prepare a BioGeoBEARS analysis. My tree file is [tree path], my distribution file is [data path], and I have [number] areas.

驗證地理資料

Validate my geography file against this phylogenetic tree. Reformat it for BioGeoBEARS if needed, and explain any species mismatches.

選擇模型與參數

Recommend BioGeoBEARS models and maximum range size for [taxon group] across [area list]. Explain the tradeoffs before generating scripts.

建立發表用工作流程

Create a reproducible BioGeoBEARS workflow with validation, model comparison, ancestral range plots, README notes, and interpretation guidance for publication.