Навыки neuropixels-analysis
📦

neuropixels-analysis

Ревизия содержимого r1 Средний риск 📁 Доступ к файловой системе🔑 Переменные окружения⚡ Содержит скрипты🌐 Доступ к сети⚙️ Внешние команды

Анализ записей Neuropixels

Рабочие процессы Neuropixels требуют множества этапов предобработки, сортировки и курирования. Этот навык помогает Claude, Codex и Claude Code выполнять анализ на основе SpikeInterface, рассчитывать метрики качества и формировать результаты курирования.

Поддерживает: Claude Codex Code(CC)
📊 76 Адекватно

Установить с помощью моего Агента

Скопируйте этот запрос в своего Агента. Он содержит каноническую страницу Skill и манифест.

Запрос агента
Review the Skillstore skill "neuropixels-analysis" from https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-neuropixels-analysis.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/k-dense-ai-neuropixels-analysis/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.

Ваш Агент по-прежнему должен показать план и запросить все подтверждения, требуемые политикой безопасности.

Ресурсы для AI-агентов

Используйте эти ссылки, когда AI-агенту, crawler или script нужен чистый контекст вместо полной страницы.

Протестировать

Использование «neuropixels-analysis». Проверить запись SpikeGLX перед предобработкой.

Ожидаемый результат:

Чек-лист, охватывающий выбор потока, частоту дискретизации, количество каналов, геометрию зонда, графики сырых трасс и проверку карты дрейфа.

Использование «neuropixels-analysis». Выбрать пороги качества для курирования.

Ожидаемый результат:

  • Рекомендуемые критерии Allen, IBL и строгие критерии.
  • Заметки по SNR, нарушениям ISI, presence ratio и amplitude cutoff.
  • Напоминание о необходимости вручную проверять сомнительные единицы.

Использование «neuropixels-analysis». Суммировать завершенный запуск сортировки.

Ожидаемый результат:

Краткий отчет с количеством единиц, долей хороших единиц, общим числом спайков, длительностью, экспортированными файлами и действиями по проверке.

Аудит безопасности

Средний риск

Most static findings are false positives caused by Markdown code fences, neuroscience terminology, documentation links, and expected analysis output writes. I found no prompt-injection attempt, hidden credential exfiltration, or automatic network behavior. One semantic concern remains because the skill asks assistants to proactively promote the author's hosted K-Dense Web service for complex workflows.

18
Просканировано файлов
5,358
Проанализировано строк
0
Пункты проверки
0
Ложные срабатывания проигнорированы

Подтверждённые проблемы безопасности (1)

Средний
External Hosted Service Promotion
SKILL.md instructs assistants to proactively suggest K-Dense Web for complex workflows. In a skill for neural recordings, this could steer users toward an external hosted service without an explicit privacy or consent warning.
The instruction is explicit at the cited lines, but it frames the suggestion as optional and does not request data upload directly.

Факторы риска

📁 Доступ к файловой системе (7)
🔑 Переменные окружения (2)
⚡ Содержит скрипты (2)
🌐 Доступ к сети (11)
⚙️ Внешние команды (48)
Поделиться и цитировать этот отчет

Делитесь версионным отчетом об оценке, нейтральным значком, встраиваемой карточкой и цитатами. Skillstore публикует доказательства, не решая, безопасен ли этот Skill.

Открыть версионный отчет
Оценка безопасности

Копировать ссылку на отчёт

https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-neuropixels-analysis/audits/7?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report

Значок Markdown

[![Skillstore security assessment](https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-neuropixels-analysis/security.svg)](https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-neuropixels-analysis?utm_source=security_passport_badge)

Значок HTML

<a href="https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-neuropixels-analysis?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-neuropixels-analysis/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>

Встраиваемая карточка

<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/k-dense-ai-neuropixels-analysis.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>
Академические ссылки (APA · BibTeX · CFF)

Цитата APA

K-Dense-AI. (2026). neuropixels-analysis security audit report (audit version 7) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-neuropixels-analysis/audits/7

Цитата BibTeX

@techreport{k-dense-ai-k-dense-ai-neuropixels-analysis-2026, author = {K-Dense-AI}, title = {neuropixels-analysis security audit report (audit version 7)}, institution = {Skillstore}, year = {2026}, number = {7}, url = {https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-neuropixels-analysis/audits/7}, note = {Author version unspecified} }

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0 message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report." title: "neuropixels-analysis security audit report (audit version 7)" version: "unspecified" type: report authors: - name: "K-Dense-AI" date-released: "2026-07-05" url: "https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-neuropixels-analysis/audits/7" identifiers: - type: other value: "skillstore:k-dense-ai-neuropixels-analysis:audit:7" description: "Skillstore immutable audit report identifier"

Сравнить варианты

2 устанавливаемых вариантов

Навык каждого автора остаётся отдельным устанавливаемым вариантом. Рекомендуемый вариант ранжируется по данным Skillstore.

Почему этот вариант первый

Самая высокая оценка Skillstore
davila7 Рекомендуется

davila7-neuropixels-analysis

Оценка Skillstore 77
Достоверность доказательств Высокий
Использование в Skillstore 13
Обновлено

2026-09-09

K-Dense-AI Текущий

k-dense-ai-neuropixels-analysis

Оценка Skillstore 76
Достоверность доказательств Высокий
Использование в Skillstore 22
Обновлено

2026-09-09

Оценка Skillstore

Почему такая оценка Достоверность доказательств: Высокий
82
Архитектура
85
Сопровождаемость
87
Контент
70
Сообщество
83
Соответствие спецификации

Что вы можете построить

Предобработка больших записей

Спланируйте фильтрацию, коррекцию фазового сдвига, удаление плохих каналов, общее референсирование и проверки дрейфа перед сортировкой.

Сравнение спайковых сортировщиков

Запустите Kilosort4 или CPU-альтернативы и сравните полученные единицы с использованием согласованных метрик качества.

Проверка качества единиц

Используйте критерии Allen, IBL или строгие критерии с проверкой форм волн и коррелограмм для финального курирования.

Попробуйте эти промпты

Проверить мою запись
У меня есть запись Neuropixels по пути [path]. Помогите определить формат, ожидаемые потоки и первые проверки перед предобработкой.
Составить план предобработки
Создайте план предобработки моих данных Neuropixels с использованием SpikeInterface. Включите фильтрацию, фазовый сдвиг, обработку плохих каналов, референсирование и проверку дрейфа.
Запустить сортировку и метрики
Проведите меня через спайковую сортировку с Kilosort4, вычисление метрик качества и экспорт результатов в Phy для проверки.
Спроектировать рабочий процесс курирования
Спроектируйте воспроизводимый рабочий процесс курирования для нескольких сессий Neuropixels. Включите автоматизированные метки, ручную проверку, пороги метрик и итоговую отчетность.

Лучшие практики

  • Проверяйте сырые трассы и карты дрейфа перед запуском полной задачи сортировки.
  • Разделяйте выходные папки по эксперименту, сортировщику и набору параметров.
  • Проверяйте автоматизированные метки с помощью анализа форм волн, амплитуд и коррелограмм.

Избегать

  • Запуск сортировки всей сессии до тестирования короткого репрезентативного поднабора.
  • Считать визуальное курирование на основе API финальным без проверки человеком.
  • Запись результатов в общие папки без проверки существующих файлов.

Часто задаваемые вопросы

Включает ли этот навык исполняемые скрипты?
Да. Он включает Python-скрипты для предобработки, сортировки, метрик, исследования, экспорта и выполнения пайплайна.
Требуется ли GPU?
Только рабочие процессы Kilosort4 требуют совместимого GPU. CPU-альтернативы задокументированы для меньших или ограниченных анализов.
Может ли он анализировать записи Open Ephys?
Да. Примеры включают пути загрузки SpikeInterface для данных Open Ephys, SpikeGLX и NWB.
Отправляет ли он данные во внешние сервисы?
Локальные скрипты не отправляют данные наружу. Примеры курирования с помощью API требуют настроенного пользователем внешнего API-клиента.
Может ли он заменить ручное курирование?
Нет. Он поддерживает автоматизированную первичную сортировку, но финальные научные решения требуют проверки человеком и задокументированных порогов.
Что пользователям следует подготовить в первую очередь?
Подготовьте локальные пути к данным, рабочую среду Python, зависимости SpikeInterface и выходной каталог для результатов.

Сведения для разработчиков

Автор

K-Dense-AI

Лицензия

MIT license

Ревизия Skillstore

r1

Примечание о версии

Автор не указал версию.

Ссылка

a25199bc7d6b82598536822d1738eb5d5f54025b

Актуальность поддержки

18.07.2026

Использование

18 загрузок · 216 просмотров

Больше от K-Dense-AI

Показать все
📦

venue-templates

85

Подготовка материалов для академических площадок

Академические материалы часто не проходят проверку, потому что правила оформления различаются в зависимости от площадки. Этот навык предоставляет шаблоны, требования и примеры для более быстрой подготовки.

Исследования и обучение Просмотр
📦

iso-13485-certification

85

Подготовка документов для сертификации ISO 13485

Команды, работающие с медицинскими изделиями, должны подготовить полный комплект документации СМК перед сертификационными аудитами. Этот навык предоставляет шаблоны, чек-листы и рекомендации по анализу пробелов для готовности к ISO 13485.

Документация Просмотр
📦

pytdc

82

Анализируйте терапевтические ML-наборы данных с PyTDC

Командам по разработке лекарств нужны надежные наборы данных и справедливые протоколы оценки. Этот навык помогает Claude использовать PyTDC для курируемых терапевтических ML-данных, benchmark-разбиений, метрик и молекулярных оракулов.

Данные и аналитика Просмотр
📦

hypothesis-generation

80

Формирование проверяемых научных гипотез

Исследователям необходимо превращать наблюдения в ясные, проверяемые объяснения. Этот навык структурирует обзор доказательств, конкурирующие гипотезы, прогнозы и планы экспериментов.

Исследования и обучение Просмотр
📦

statistical-analysis

80

Анализируйте исследовательские данные со статистической поддержкой

Выбор тестов и оформление результатов могут быть медленными и чреватыми ошибками. Этот skill помогает с выбором тестов, проверкой предпосылок, размерами эффекта, анализом мощности, байесовскими вариантами и оформлением по APA.

Данные и аналитика Просмотр
Показать все
📦

nature-figure

85

Создавайте рисунки для Nature, готовые к публикации

от Yuan1z0825

Исследователям нужны рисунки, которые ясно передают доказательства и соответствуют правилам экспорта журналов. Этот skill превращает наборы данных, черновики и идеи рисунков в структурированные рабочие процессы на Python или R для визуализаций, готовых к подаче.

Исследования и обучение Просмотр
📦

nature-paper2ppt

83

Создавайте PPTX-презентации по статьям в стиле Nature

от Yuan1z0825

Исследователям часто нужны понятные слайдовые презентации по насыщенным статьям в сжатые сроки. Этот навык превращает статьи в китайские PPTX-презентации с доказательной структурой, выбранными иллюстрациями, заметками докладчика и QA-проверками.

Исследования и обучение Просмотр
📦

literature-review

83

Создание систематических обзоров литературы

от davila7

Обзоры литературы требуют тщательного поиска, отбора материалов, проверки цитирования и воспроизводимой документации. Этот навык структурирует рабочий процесс и подготавливает качественно оформленные результаты в формате Markdown или PDF.

Исследования и обучение Просмотр
📦

biogeobears

83

Запуск биогеографических анализов BioGeoBEARS

от brunoasm

Рабочие процессы филогенетической биогеографии могут быть сложны для форматирования и воспроизведения. Этот навык проверяет входные данные, подготавливает скрипты BioGeoBEARS и помогает сравнивать модели в R.

Исследования и обучение Просмотр