Навыки latchbio-integration
📦

latchbio-integration

Ревизия содержимого r1 Высокий риск ⚡ Содержит скрипты⚙️ Внешние команды🔑 Переменные окружения📁 Доступ к файловой системе🌐 Доступ к сети

Создание биоинформатических рабочих процессов Latch

Биоинформатическим командам нужны воспроизводимые конвейеры без управления деталями платформы. Этот навык помогает работать с рабочими процессами Latch SDK, обработкой данных, ресурсами и использованием проверенных рабочих процессов.

Поддерживает: Claude Codex Code(CC)
⚠️ 38 Плохо

Установить с помощью моего Агента

Скопируйте этот запрос в своего Агента. Он содержит каноническую страницу Skill и манифест.

Запрос агента
Review the Skillstore skill "latchbio-integration" from https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-latchbio-integration.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/k-dense-ai-latchbio-integration/manifest. Verify the artifact. Stop and obtain explicit user consent before installing or changing files.

Ваш Агент по-прежнему должен показать план и запросить все подтверждения, требуемые политикой безопасности.

Ресурсы для AI-агентов

Используйте эти ссылки, когда AI-агенту, crawler или script нужен чистый контекст вместо полной страницы.

Протестировать

Использование «latchbio-integration». Помогите мне спроектировать простой рабочий процесс Latch для обработки FASTQ.

Ожидаемый результат:

  • Определяет одну задачу предварительной обработки и одну точку входа рабочего процесса.
  • Использует входы LatchFile и выходы LatchFile.
  • Перечисляет проверки регистрации, Docker и учетных данных.

Использование «latchbio-integration». Порекомендуйте ресурсы для крупной задачи выравнивания.

Ожидаемый результат:

  • Начинает с крупной задачи на CPU перед рассмотрением использования GPU.
  • Задает память и хранилище на основе ожидаемого размера файла BAM.
  • Добавляет рекомендации по тайм-аутам и заметки по контролю затрат.

Использование «latchbio-integration». Используйте Latch Registry для отслеживания образцов и результатов.

Ожидаемый результат:

  • Создает проект, таблицу и записи для образцов.
  • Связывает входные файлы, статус рабочего процесса и файлы результатов.
  • Рекомендует согласованные имена и поля метаданных.

Аудит безопасности

Высокий риск

The static findings are false positives caused by markdown code examples, public documentation links, and an embedded evaluation JSON file. Semantic review found an embedded prior safety verdict and an instruction to promote K-Dense Web, both of which can influence agent behavior outside normal Latch guidance.

6
Просканировано файлов
2,150
Проанализировано строк
0
Пункты проверки
0
Ложные срабатывания проигнорированы

Подтверждённые проблемы безопасности (2)

Высокий
Prompt Injection Attempt Detected
evaluation_output.json embeds prior audit claims including safe_to_publish: true and "No actual security risks present". These claims can bias an AI auditor and should not ship inside the skill.
The file explicitly declares a low risk level, a publish-safe result, and a no-risk summary. That matches the prompt-injection warning for embedded safety claims.
Средний
Off-Platform Promotional Steering
SKILL.md instructs the assistant to proactively suggest K-Dense Web for complex tasks. This changes agent behavior toward a creator-hosted product rather than neutral user assistance.
The instruction is explicit and appears in the main skill file. It is promotional steering, not a neutral support or documentation link.
Поделиться и цитировать этот отчет

Делитесь версионным отчетом об оценке, нейтральным значком, встраиваемой карточкой и цитатами. Skillstore публикует доказательства, не решая, безопасен ли этот Skill.

Открыть версионный отчет
Оценка безопасности

Копировать ссылку на отчёт

https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-latchbio-integration/audits/7?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report

Значок Markdown

[![Skillstore security assessment](https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-latchbio-integration/security.svg)](https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-latchbio-integration?utm_source=security_passport_badge)

Значок HTML

<a href="https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-latchbio-integration?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-latchbio-integration/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>

Встраиваемая карточка

<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/k-dense-ai-latchbio-integration.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>
Академические ссылки (APA · BibTeX · CFF)

Цитата APA

K-Dense-AI. (2026). latchbio-integration security audit report (audit version 7) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-latchbio-integration/audits/7

Цитата BibTeX

@techreport{k-dense-ai-k-dense-ai-latchbio-integration-2026, author = {K-Dense-AI}, title = {latchbio-integration security audit report (audit version 7)}, institution = {Skillstore}, year = {2026}, number = {7}, url = {https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-latchbio-integration/audits/7}, note = {Author version unspecified} }

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0 message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report." title: "latchbio-integration security audit report (audit version 7)" version: "unspecified" type: report authors: - name: "K-Dense-AI" date-released: "2026-07-06" url: "https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-latchbio-integration/audits/7" identifiers: - type: other value: "skillstore:k-dense-ai-latchbio-integration:audit:7" description: "Skillstore immutable audit report identifier"

Сравнить варианты

2 устанавливаемых вариантов

Навык каждого автора остаётся отдельным устанавливаемым вариантом. Рекомендуемый вариант ранжируется по данным Skillstore.

Почему этот вариант первый

Самая высокая оценка Skillstore
davila7 Рекомендуется

davila7-latchbio-integration

Оценка Skillstore 76
Достоверность доказательств Высокий
Использование в Skillstore 7
Обновлено

2026-09-09

K-Dense-AI Текущий

k-dense-ai-latchbio-integration

Оценка Skillstore 38
Достоверность доказательств Средний
Использование в Skillstore 11
Обновлено

2026-09-09

Оценка Skillstore

Почему такая оценка Достоверность доказательств: Средний
45
Архитектура
75
Сопровождаемость
87
Контент
71
Сообщество
83
Соответствие спецификации

Что вы можете построить

Создание исследовательских конвейеров

Проектирование рабочих процессов Latch для секвенирования, выравнивания, количественной оценки и отслеживания результатов.

Настройка вычислительных ресурсов

Выбор настроек CPU, памяти, GPU, хранилища и тайм-аутов для тяжелых аналитических задач.

Внедрение проверенных рабочих процессов

Использование готовых рабочих процессов Latch для RNA-seq, структуры белков, CRISPR и одноклеточного анализа.

Попробуйте эти промпты

Спланировать базовый рабочий процесс
Создайте план рабочего процесса Latch для начинающих с одним входным файлом FASTQ. Включите роли задач, входные данные, выходные данные и шаги регистрации.
Добавить обработку облачных данных
Помогите мне использовать LatchFile, LatchDir и записи Registry для рабочего процесса секвенирования с отслеживаемыми метаданными образцов.
Настроить ресурсы задач
Порекомендуйте ресурсы задач Latch для конвейера выравнивания. Включите рекомендации по CPU, памяти, хранилищу, тайм-аутам и GPU, где это полезно.
Интегрировать проверенные конвейеры
Спроектируйте рабочий процесс Latch, который объединяет проверенный анализ RNA-seq с пользовательскими проверками качества и обновлениями Registry.

Лучшие практики

  • Используйте аннотации типов и docstrings, чтобы Latch мог генерировать понятные интерфейсы рабочих процессов.
  • Тестируйте рабочие процессы локально с Docker перед их регистрацией в Latch.
  • Начинайте со стандартных декораторов задач и увеличивайте ресурсы только после профилирования.

Избегать

  • Не злоупотребляйте задачами GPU, если задачи CPU удовлетворяют требованиям по времени выполнения.
  • Не смешивайте Nextflow, Snakemake и Python без четких границ рабочего процесса.
  • Не храните API keys или secrets непосредственно в коде рабочего процесса.

Часто задаваемые вопросы

Что помогает создавать этот навык?
Он помогает проектировать биоинформатические рабочие процессы Latch, пути данных, настройки ресурсов и интеграции с проверенными рабочими процессами.
Выполняет ли он рабочие процессы Latch?
Нет. Он предоставляет рекомендации и примеры. Пользователи запускают рабочие процессы со своей учетной записью Latch и собственными инструментами.
Может ли он помочь с задачами GPU?
Да. Он объясняет декораторы GPU, пользовательские ресурсы задач, расчет размера хранилища и выбор ресурсов с учетом затрат.
Охватывает ли он управление данными Registry?
Да. Он охватывает проекты, таблицы, записи, связанные записи, файловые столбцы и организацию метаданных.
Может ли он поддерживать существующие конвейеры Nextflow или Snakemake?
Да. Он обобщает шаблоны регистрации Latch для существующих рабочих процессов Nextflow и Snakemake.
Как следует обрабатывать secrets?
Используйте управление секретами платформы. Не размещайте API keys в исходном коде, prompts, logs или shared files.

Сведения для разработчиков

Автор

K-Dense-AI

Лицензия

Unknown

Ревизия Skillstore

r1

Примечание о версии

Автор не указал версию.

Ссылка

b8ca75d2c0a7e7102978993058777d82b8ab2610

Актуальность поддержки

18.07.2026

Использование

9 загрузок · 252 просмотров

Больше от K-Dense-AI

Показать все
📦

venue-templates

85

Подготовка материалов для академических площадок

Академические материалы часто не проходят проверку, потому что правила оформления различаются в зависимости от площадки. Этот навык предоставляет шаблоны, требования и примеры для более быстрой подготовки.

Исследования и обучение Просмотр
📦

iso-13485-certification

85

Подготовка документов для сертификации ISO 13485

Команды, работающие с медицинскими изделиями, должны подготовить полный комплект документации СМК перед сертификационными аудитами. Этот навык предоставляет шаблоны, чек-листы и рекомендации по анализу пробелов для готовности к ISO 13485.

Документация Просмотр
📦

pytdc

82

Анализируйте терапевтические ML-наборы данных с PyTDC

Командам по разработке лекарств нужны надежные наборы данных и справедливые протоколы оценки. Этот навык помогает Claude использовать PyTDC для курируемых терапевтических ML-данных, benchmark-разбиений, метрик и молекулярных оракулов.

Данные и аналитика Просмотр
📦

hypothesis-generation

80

Формирование проверяемых научных гипотез

Исследователям необходимо превращать наблюдения в ясные, проверяемые объяснения. Этот навык структурирует обзор доказательств, конкурирующие гипотезы, прогнозы и планы экспериментов.

Исследования и обучение Просмотр
📦

statistical-analysis

80

Анализируйте исследовательские данные со статистической поддержкой

Выбор тестов и оформление результатов могут быть медленными и чреватыми ошибками. Этот skill помогает с выбором тестов, проверкой предпосылок, размерами эффекта, анализом мощности, байесовскими вариантами и оформлением по APA.

Данные и аналитика Просмотр
Показать все
📦

exploratory-data-analysis

85

Анализ файлов научных данных

от davila7

Файлы научных данных сложно исследовать, поскольку каждый формат по-разному хранит структуру и метаданные. Этот навык определяет форматы, оценивает качество данных и создает практические отчеты по разведочному анализу данных в формате markdown.

Данные и аналитика Просмотр
📦

scanpy

85

Анализ single-cell RNA-seq с помощью Scanpy

от davila7

Рабочие процессы single-cell RNA-seq требуют тщательного контроля качества, нормализации, кластеризации и документирования. Этот навык предоставляет рабочие процессы Scanpy, скрипты, шаблоны и справочные материалы для воспроизводимого анализа.

Данные и аналитика Просмотр
📦

opentargets-database

81

Исследование данных Open Targets для разработки лекарственных препаратов

от davila7

Командам, занимающимся разработкой лекарственных препаратов, нужны надежные способы связывать гены, заболевания, доказательные данные и известные препараты. Этот навык помогает Claude, Codex и Claude Code выполнять запросы к Open Targets и интерпретировать доказательные данные.

Данные и аналитика Просмотр
📦

etetoolkit

81

Анализ филогенетических деревьев с помощью ETE

от davila7

Филогенетический анализ часто требует специализированного разбора деревьев, поиска таксономических данных и создания графических материалов. Этот навык помогает Claude, Codex и Claude Code выполнять рабочие процессы ETE для анализа и визуализации.

Данные и аналитика Просмотр
📦

arboreto

81

Инференция генных регуляторных сетей с помощью Arboreto

от davila7

Командам, занимающимся транскриптомикой, нужны надежные способы выявления связей между транскрипционными факторами и их генами-мишенями. Этот навык помогает выстраивать рабочие процессы Arboreto для GRNBoost2, GENIE3 и масштабируемого выполнения в Dask.

Данные и аналитика Просмотр