Запуск биогеографических анализов BioGeoBEARS
Рабочие процессы филогенетической биогеографии могут быть сложны для форматирования и воспроизведения. Этот навык проверяет входные данные, подготавливает скрипты BioGeoBEARS и помогает сравнивать модели в R.
Скопируйте этот запрос в своего Агента. Он содержит каноническую страницу Skill и манифест.
Review the Skillstore skill "biogeobears" from https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/brunoasm-biogeobears/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.Ваш Агент по-прежнему должен показать план и запросить все подтверждения, требуемые политикой безопасности.
Используйте эти ссылки, когда AI-агенту, crawler или script нужен чистый контекст вместо полной страницы.
Использование «biogeobears». Исследователь предоставляет укорененное дерево и таблицу распространения видов по регионам.
Ожидаемый результат:
Использование «biogeobears». Пользователь спрашивает, какая модель лучше всего объясняет распространение островных птиц.
Ожидаемый результат:
All 110 static findings were adjudicated as false positives. Most detections are Markdown or RMarkdown backticks and intentional relative paths within the generated analysis directory. The explicit file write uses a user-selected output path, with no hidden network access, reconnaissance, or untrusted command evaluation.
Делитесь версионным отчетом об оценке, нейтральным значком, встраиваемой карточкой и цитатами. Skillstore публикует доказательства, не решая, безопасен ли этот Skill.
https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears/audits/8?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report[](https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears?utm_source=security_passport_badge)<a href="https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/brunoasm-biogeobears/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a><iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/brunoasm-biogeobears.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>brunoasm. (2026). biogeobears security audit report (audit version 8) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears/audits/8@techreport{brunoasm-brunoasm-biogeobears-2026,
author = {brunoasm},
title = {biogeobears security audit report (audit version 8)},
institution = {Skillstore},
year = {2026},
number = {8},
url = {https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears/audits/8},
note = {Author version unspecified}
}cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "biogeobears security audit report (audit version 8)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
- name: "brunoasm"
date-released: "2026-07-23"
url: "https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears/audits/8"
identifiers:
- type: other
value: "skillstore:brunoasm-biogeobears:audit:8"
description: "Skillstore immutable audit report identifier"
Настроить проверенные входные данные, скрипты и документацию для филогенетического биогеографического анализа.
Создать понятную структуру папок и пошаговые этапы анализа для студентов, изучающих историческую биогеографию.
Найти несоответствия между деревом и географией перед запуском длительных задач оптимизации BioGeoBEARS.
Помогите мне подготовить анализ BioGeoBEARS. Мой файл дерева: [tree path], мой файл распространения: [data path], и у меня [number] областей.
Проверьте мой файл географии по этому филогенетическому дереву. При необходимости преобразуйте его для BioGeoBEARS и объясните любые несоответствия видов.
Порекомендуйте модели BioGeoBEARS и максимальный размер ареала для [taxon group] по [area list]. Объясните компромиссы перед генерацией скриптов.
Создайте воспроизводимый рабочий процесс BioGeoBEARS с проверкой, сравнением моделей, графиками предковых ареалов, заметками README и рекомендациями по интерпретации для публикации.
Автор
brunoasmЛицензия
MIT
Ревизия Skillstore
r2
Примечание о версии
Автор не указал версию.
Ссылка
a39a91716eadede5f4cdefd78178fed4e837a128
Актуальность поддержки
25.07.2026
Использование
18 загрузок · 271 просмотров
Структура файлов
Тщательно обдумывайте перед ответом
Быстрое согласие может скрывать слабые предположения и недостающий контекст. Этот навык проводит Claude, Codex и Claude Code через структурированный анализ перед рекомендацией дальнейшего пути.
Создание рабочих процессов филогеномики BUSCO
Филогеномика на основе сборок геномов требует множества инструментов, скриптов планировщика и проверок качества. Этот skill помогает с извлечением ортологов с помощью BUSCO или compleasm, выравниванием, триммингом, построением деревьев и описанием методов.
Извлечение структурированных данных из PDF
Коллекции научных PDF сложно преобразовать в наборы данных, готовые к анализу. Этот навык помогает организовать метаданные, выполнить извлечение по схеме, валидацию и экспорт.
Анализ филогенетических деревьев с помощью ETE
от davila7
Филогенетический анализ часто требует специализированного разбора деревьев, поиска таксономических данных и создания графических материалов. Этот навык помогает Claude, Codex и Claude Code выполнять рабочие процессы ETE для анализа и визуализации.
Анализ биологических данных с помощью scikit-bio
от davila7
Работа в биоинформатике часто требует корректных рабочих процессов для последовательностей, деревьев, разнообразия и ординации. Этот навык помогает Claude, Codex и Claude Code работать с API scikit-bio.
Research Supply-Chain Investment Bottlenecks
от muxuuu
Broad investment themes often hide the scarce components that control growth. This skill maps value chains, grades evidence, and ranks research priorities with clear risks.
Подготовка материалов для академических площадок
от K-Dense-AI
Академические материалы часто не проходят проверку, потому что правила оформления различаются в зависимости от площадки. Этот навык предоставляет шаблоны, требования и примеры для более быстрой подготовки.
Создавайте рисунки для Nature, готовые к публикации
от Yuan1z0825
Исследователям нужны рисунки, которые ясно передают доказательства и соответствуют правилам экспорта журналов. Этот skill превращает наборы данных, черновики и идеи рисунков в структурированные рабочие процессы на Python или R для визуализаций, готовых к подаче.
Запуск рабочих процессов молекулярного докинга DiffDock
от davila7
Настройка молекулярного докинга часто завершается неудачей, поскольку сложно согласовать входные данные, параметры и оценки уверенности. Этот навык помогает выполнять рабочие процессы DiffDock от подготовки до анализа результатов.