196 habilidades
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gget

Seguro 77

Consultar bases de dados genômicos e analisar sequências

por davila7

Precisa de acesso rápido a informações de genes, estruturas proteicas ou dados de expressão? Esta habilidade oferece acesso unificado a mais de 20 bases de dados de bioinformática através de uma única interface. Pesquise genes, recupere sequências, preveja estruturas e analise associações de doenças sem trocar de ferramentas.

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geo-database

Seguro 68

Pesquisar e baixar dados de expressão gênica do NCBI GEO

por davila7

Encontrar e processar conjuntos de dados de expressão gênica requer navegar por estruturas de banco de dados e formatos de arquivo complexos. Esta skill fornece padrões de código prontos para usar para pesquisar, baixar e analisar dados de microarray e RNA-seq do GEO.

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geniml

Seguro 71

Analisar regiões genômicas com ML

por davila7

Trabalhar com dados de intervalos genômicos para tarefas de aprendizado de máquina requer ferramentas especializadas. O Geniml fornece métodos não supervisionados para aprender embeddings de regiões genômicas, células individuais e rótulos de metadados para buscas de similaridade, agrupamento e análise downstream.

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gene-database

Baixo Risco 73

Consultar banco de dados NCBI Gene

por davila7

Pesquise e recupere informações de genes do banco de dados NCBI Gene. Obtenha símbolos de genes, sequências RefSeq, anotações GO, localizações cromossômicas e associações de fenótipos para pesquisa e análise.

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esm

Seguro 73

Gerar e projetar proteínas com ESM

por davila7

A engenharia de proteínas requer modelos de IA especializados para analisar relações entre sequência-estrutura-função. O ESM fornece modelos de linguagem de proteínas de última geração para gerar novas sequências, prever estruturas e projetar proteínas funcionais através de IA multimodal.

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ensembl-database

Seguro 77

Consultar banco de dados genômico Ensembl para mais de 250 espécies

por davila7

Pesquisadores genômicos precisam de acesso a sequências de genes, variantes e dados comparativos entre espécies. Esta skill consulta a API REST do banco de dados Ensembl para recuperar informações de genes, sequências de DNA, previsões de variantes, ortólogos e características regulatórias para mais de 250 espécies de vertebrados.

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ena-database

Seguro 69

Pesquisar arquivo de nucleotídeos ENA

por davila7

Encontrar e baixar sequências de nucleotídeos requer compreensão de sintaxe complexa de API e múltiplos padrões de endpoints. Esta skill fornece documentação abrangente para consultar o European Nucleotide Archive para recuperar sequências de DNA/RNA, montagens de genoma e leituras de sequenciamento brutas por acesso.

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denario

Seguro 73

Automatize fluxos de trabalho de pesquisa científica

por davila7

Denario automatiza o pipeline completo de pesquisa, desde análise de dados até publicação. Utiliza agentes de IA para gerar hipóteses, desenvolver metodologias, executar experimentos e produzir artigos formatados para periódicos.

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cosmic-database

Seguro 75

Baixar Dados de Mutação Cançerosa do Banco de Dados COSMIC

por davila7

Pesquisadores de câncer precisam de acesso programático ao maior banco de dados de mutações somáticas do mundo. Esta habilidade permite downloads autenticados de dados de genômica do câncer COSMIC, incluindo mutações, anotações de genes e variantes clínicas para pesquisa e oncologia de precisão.

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🔬

clinicaltrials-database

Baixo Risco 73

Pesquisar ClinicalTrials.gov para Estudos de Pesquisa

por davila7

Encontrar ensaios clínicos para pacientes, pesquisa ou desenvolvimento de medicamentos requer navegar por um registro complexo. Esta skill fornece uma interface Python para consultar o banco de dados oficial do ClinicalTrials.gov. Pesquise por condição, droga, localização ou patrocinador para encontrar ensaios em recrutamento, recuperar informações detalhadas dos estudos e exportar dados para análise.

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📚

citation-management

Seguro 79

Gerenciar citações acadêmicas com BibTeX

por davila7

Gerenciar citações manualmente é demorado e propenso a erros. Esta habilidade automatiza a busca em bases de dados acadêmicos, extração de metadados de DOIs e PMIDs, validação de citações e geração de entradas BibTeX prontas para publicação.

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🧪

chembl-database

Baixo Risco 74

Consultar banco de dados de moléculas bioativas ChEMBL

por davila7

Encontrar dados de descoberta de medicamentos requer pesquisar múltiplos bancos de dados e compreender consultas complexas de API. Esta skill fornece funções prontas para uso para consultar o banco de dados ChEMBL com mais de 2 milhões de compostos bioativos, 19 milhões de medições de bioatividade e informações sobre medicamentos aprovados.

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cellxgene-census

Seguro 69

Consulte mais de 61 milhões de conjuntos de dados genômicos unicelulares

por davila7

Pesquisadores precisam de acesso eficiente a dados unicelulares em escala populacional para estudos genômicos. Esta skill fornece acesso com inteligência artificial ao CZ CELLxGENE Census com padrões de consulta otimizados e guias de integração para análise downstream.

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brenda-database

Baixo Risco 73

Consultar banco de dados de enzimas BRENDA para dados cinéticos

por davila7

Encontrar parâmetros cinéticos de enzimas na literatura requer extensa busca. Esta skill fornece acesso direto ao banco de dados BRENDA através de uma interface simples para recuperar valores Km, equações de reação e dados de enzimas específicos de organismos para pesquisa bioquímica.

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bioservices

Baixo Risco 76

Acessar bancos de dados de bioinformática

por davila7

Pesquisadores precisam recuperar dados biológicos de múltiplos bancos de dados. Esta skill fornece acesso unificado a mais de 40 serviços de bioinformática incluindo UniProt, KEGG, ChEMBL e Reactome para sequências de proteínas, vias metabólicas, compostos e interações.

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biorxiv-database

Baixo Risco 74

Buscar preprints no bioRxiv

por davila7

Encontrar preprints de ciências da vida requer navegar manualmente no bioRxiv ou usar múltiplas ferramentas. Esta skill fornece uma interface Python unificada para buscar por palavras-chave, autores, categorias e intervalos de datas, e então baixar artigos e metadados em formato JSON estruturado.

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biomni

Risco Médio 69

Executar pesquisa biomédica autônoma com IA

por davila7

Tarefas complexas de pesquisa biomédica exigem conhecimento especializado e etapas repetitivas de análise. O Biomni automatiza fluxos de trabalho de pesquisa em várias etapas em genômica, descoberta de fármacos e genômica clínica usando raciocínio baseado em LLMs e bases de dados biomédicas integradas.

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astropy

Seguro 73

Trabalhar com dados e cálculos astronômicos

por davila7

A pesquisa astronômica requer manipulação precisa de coordenadas celestes, unidades físicas e formatos de dados especializados. Esta skill fornece orientação especializada sobre o uso do astropy para transformações de coordenadas, operações com arquivos FITS, cálculos cosmológicos e conversões de escalas de tempo.

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alphafold-database

Seguro 70

Acesse estruturas de proteínas AlphaFold por ID UniProt

por davila7

O AlphaFold DB fornece mais de 200 milhões de estruturas de proteínas previstas por IA. Esta skill ajuda pesquisadores a recuperar arquivos de estrutura, analisar pontuações de confiança e integrar previsões em pipelines computacionais para descoberta de medicamentos e biologia estrutural.

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adaptyv

Seguro 71

Valide designs de proteínas com experimentos em laboratório em nuvem

por davila7

Projeta proteínas mas não tem acesso a laboratório experimental? Submeta sequências diretamente ao laboratório automatizado em nuvem da Adaptyv para ensaios de ligação, testes de expressão, medições de termoestabilidade e análise de atividade enzimática. Receba resultados experimentais em aproximadamente 21 dias.

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