gget
Seguro 77Consultar bases de dados genômicos e analisar sequências
por davila7
Precisa de acesso rápido a informações de genes, estruturas proteicas ou dados de expressão? Esta habilidade oferece acesso unificado a mais de 20 bases de dados de bioinformática através de uma única interface. Pesquise genes, recupere sequências, preveja estruturas e analise associações de doenças sem trocar de ferramentas.
geo-database
Seguro 68Pesquisar e baixar dados de expressão gênica do NCBI GEO
por davila7
Encontrar e processar conjuntos de dados de expressão gênica requer navegar por estruturas de banco de dados e formatos de arquivo complexos. Esta skill fornece padrões de código prontos para usar para pesquisar, baixar e analisar dados de microarray e RNA-seq do GEO.
geniml
Seguro 71Analisar regiões genômicas com ML
por davila7
Trabalhar com dados de intervalos genômicos para tarefas de aprendizado de máquina requer ferramentas especializadas. O Geniml fornece métodos não supervisionados para aprender embeddings de regiões genômicas, células individuais e rótulos de metadados para buscas de similaridade, agrupamento e análise downstream.
gene-database
Baixo Risco 73Consultar banco de dados NCBI Gene
por davila7
Pesquise e recupere informações de genes do banco de dados NCBI Gene. Obtenha símbolos de genes, sequências RefSeq, anotações GO, localizações cromossômicas e associações de fenótipos para pesquisa e análise.
esm
Seguro 73Gerar e projetar proteínas com ESM
por davila7
A engenharia de proteínas requer modelos de IA especializados para analisar relações entre sequência-estrutura-função. O ESM fornece modelos de linguagem de proteínas de última geração para gerar novas sequências, prever estruturas e projetar proteínas funcionais através de IA multimodal.
ensembl-database
Seguro 77Consultar banco de dados genômico Ensembl para mais de 250 espécies
por davila7
Pesquisadores genômicos precisam de acesso a sequências de genes, variantes e dados comparativos entre espécies. Esta skill consulta a API REST do banco de dados Ensembl para recuperar informações de genes, sequências de DNA, previsões de variantes, ortólogos e características regulatórias para mais de 250 espécies de vertebrados.
ena-database
Seguro 69Pesquisar arquivo de nucleotídeos ENA
por davila7
Encontrar e baixar sequências de nucleotídeos requer compreensão de sintaxe complexa de API e múltiplos padrões de endpoints. Esta skill fornece documentação abrangente para consultar o European Nucleotide Archive para recuperar sequências de DNA/RNA, montagens de genoma e leituras de sequenciamento brutas por acesso.
denario
Seguro 73Automatize fluxos de trabalho de pesquisa científica
por davila7
Denario automatiza o pipeline completo de pesquisa, desde análise de dados até publicação. Utiliza agentes de IA para gerar hipóteses, desenvolver metodologias, executar experimentos e produzir artigos formatados para periódicos.
cosmic-database
Seguro 75Baixar Dados de Mutação Cançerosa do Banco de Dados COSMIC
por davila7
Pesquisadores de câncer precisam de acesso programático ao maior banco de dados de mutações somáticas do mundo. Esta habilidade permite downloads autenticados de dados de genômica do câncer COSMIC, incluindo mutações, anotações de genes e variantes clínicas para pesquisa e oncologia de precisão.
clinicaltrials-database
Baixo Risco 73Pesquisar ClinicalTrials.gov para Estudos de Pesquisa
por davila7
Encontrar ensaios clínicos para pacientes, pesquisa ou desenvolvimento de medicamentos requer navegar por um registro complexo. Esta skill fornece uma interface Python para consultar o banco de dados oficial do ClinicalTrials.gov. Pesquise por condição, droga, localização ou patrocinador para encontrar ensaios em recrutamento, recuperar informações detalhadas dos estudos e exportar dados para análise.
citation-management
Seguro 79Gerenciar citações acadêmicas com BibTeX
por davila7
Gerenciar citações manualmente é demorado e propenso a erros. Esta habilidade automatiza a busca em bases de dados acadêmicos, extração de metadados de DOIs e PMIDs, validação de citações e geração de entradas BibTeX prontas para publicação.
chembl-database
Baixo Risco 74Consultar banco de dados de moléculas bioativas ChEMBL
por davila7
Encontrar dados de descoberta de medicamentos requer pesquisar múltiplos bancos de dados e compreender consultas complexas de API. Esta skill fornece funções prontas para uso para consultar o banco de dados ChEMBL com mais de 2 milhões de compostos bioativos, 19 milhões de medições de bioatividade e informações sobre medicamentos aprovados.
cellxgene-census
Seguro 69Consulte mais de 61 milhões de conjuntos de dados genômicos unicelulares
por davila7
Pesquisadores precisam de acesso eficiente a dados unicelulares em escala populacional para estudos genômicos. Esta skill fornece acesso com inteligência artificial ao CZ CELLxGENE Census com padrões de consulta otimizados e guias de integração para análise downstream.
brenda-database
Baixo Risco 73Consultar banco de dados de enzimas BRENDA para dados cinéticos
por davila7
Encontrar parâmetros cinéticos de enzimas na literatura requer extensa busca. Esta skill fornece acesso direto ao banco de dados BRENDA através de uma interface simples para recuperar valores Km, equações de reação e dados de enzimas específicos de organismos para pesquisa bioquímica.
bioservices
Baixo Risco 76Acessar bancos de dados de bioinformática
por davila7
Pesquisadores precisam recuperar dados biológicos de múltiplos bancos de dados. Esta skill fornece acesso unificado a mais de 40 serviços de bioinformática incluindo UniProt, KEGG, ChEMBL e Reactome para sequências de proteínas, vias metabólicas, compostos e interações.
biorxiv-database
Baixo Risco 74Buscar preprints no bioRxiv
por davila7
Encontrar preprints de ciências da vida requer navegar manualmente no bioRxiv ou usar múltiplas ferramentas. Esta skill fornece uma interface Python unificada para buscar por palavras-chave, autores, categorias e intervalos de datas, e então baixar artigos e metadados em formato JSON estruturado.
biomni
Risco Médio 69Executar pesquisa biomédica autônoma com IA
por davila7
Tarefas complexas de pesquisa biomédica exigem conhecimento especializado e etapas repetitivas de análise. O Biomni automatiza fluxos de trabalho de pesquisa em várias etapas em genômica, descoberta de fármacos e genômica clínica usando raciocínio baseado em LLMs e bases de dados biomédicas integradas.
astropy
Seguro 73Trabalhar com dados e cálculos astronômicos
por davila7
A pesquisa astronômica requer manipulação precisa de coordenadas celestes, unidades físicas e formatos de dados especializados. Esta skill fornece orientação especializada sobre o uso do astropy para transformações de coordenadas, operações com arquivos FITS, cálculos cosmológicos e conversões de escalas de tempo.
alphafold-database
Seguro 70Acesse estruturas de proteínas AlphaFold por ID UniProt
por davila7
O AlphaFold DB fornece mais de 200 milhões de estruturas de proteínas previstas por IA. Esta skill ajuda pesquisadores a recuperar arquivos de estrutura, analisar pontuações de confiança e integrar previsões em pipelines computacionais para descoberta de medicamentos e biologia estrutural.
adaptyv
Seguro 71Valide designs de proteínas com experimentos em laboratório em nuvem
por davila7
Projeta proteínas mas não tem acesso a laboratório experimental? Submeta sequências diretamente ao laboratório automatizado em nuvem da Adaptyv para ensaios de ligação, testes de expressão, medições de termoestabilidade e análise de atividade enzimática. Receba resultados experimentais em aproximadamente 21 dias.