A análise de genômica de célula única requer modelos probabilísticos especializados para redução de dimensionalidade, correção de lote e integração entre diversas modalidades. scvi-tools fornece modelos generativos profundos construídos em PyTorch para análise abrangente de dados de célula única.

A pesquisa biológica requer ferramentas especializadas para análise de sequências de DNA, árvores filogenéticas e métricas de diversidade. Esta skill fornece orientação para usar scikit-bio para processar sequências, calcular diversidade alfa e beta, e realizar testes estatísticos em dados de microbioma.

Cientistas gastam horas formatando figuras para submissão a periódicos. Esta skill fornece estilos pré-configurados do matplotlib, paletas amigáveis para daltônicos e ferramentas de exportação automatizadas para criar figuras profissionais em minutos ao invés de horas.

Construa apresentações científicas profissionais para conferências, seminários e defesas de tese. Gere slides com IA com formatação consistente, use templates LaTeX Beamer e siga princípios de design baseados em pesquisa.

Afirmações científicas frequentemente passam despercebidas apesar de conterem falhas metodológicas, vieses e conclusões exageradas. Esta habilidade fornece estruturas sistemáticas para avaliar a qualidade da pesquisa usando metodologias estabelecidas como GRADE e Cochrane ROB, permitindo uma avaliação precisa de evidências.

Cientistas precisam de novas direções de pesquisa, mas frequentemente ficam presos a padrões de pensamento estabelecidos. Esta habilidade atua como um parceiro colaborativo de ideação para gerar hipóteses, explorar conexões interdisciplinares inesperadas e desenvolver metodologias inovadoras por meio de técnicas estruturadas de brainstorming.

Encontrar pesquisas atuais e artigos acadêmicos leva tempo significativo. Esta habilidade usa modelos Perplexity Sonar através do OpenRouter para pesquisar literatura acadêmica, estudos recentes e documentação técnica com citações automáticas.

Escrever subsídios de pesquisa competitivos para agências federais é complexo e demorado. Esta habilidade fornece orientação específica da agência, modelos e melhores práticas para propostas da NSF, NIH, DOE e DARPA.

A pesquisa de vias biológicas requer a busca em múltiplas bases de dados e a realização de análise estatística. Esta skill fornece acesso direto à API REST da base de dados Reactome para análise de enriquecimento de vias, mapeamento gene-via e consultas de interações moleculares.

O RDKit é uma poderosa biblioteca de código aberto para quimiinformática na análise molecular. Esta skill oferece orientação abrangente para calcular propriedades moleculares, realizar pesquisas de similaridade, filtrar compostos por subestrutura e visualizar estruturas químicas.

O desenvolvimento de computação quântica requer compreensão de design complexo de circuitos, transpilação e otimização específica de hardware. Esta skill fornece orientação abrangente para construir circuitos quânticos, executar algoritmos como VQE e QAOA em simuladores ou hardware real, e visualizar resultados.

Trabalhar com conjuntos de dados de descoberta de medicamentos requer navegar por fontes dispersas e formatos inconsistentes. O PyTDC oferece mais de 50 conjuntos de dados terapêuticos curados com APIs padronizadas, divisões significativas e protocolos de avaliação de benchmark.

Engenheiros e pesquisadores precisam encontrar compromissos ótimos entre objetivos conflitantes como custo, peso e desempenho. Esta skill fornece acesso a NSGA-II, NSGA-III e outros algoritmos evolutivos através do pymoo para descobrir soluções Pareto-ótimas para problemas complexos de design.

O desenvolvimento de modelos de machine learning para a área da saúde exige a compreensão de formatos complexos de dados clínicos, sistemas de codificação médica e arquiteturas de modelos especializadas. Esta skill oferece orientação abrangente sobre o uso do PyHealth para construir, treinar e avaliar modelos de predição clínica para tarefas de predição de mortalidade, recomendação de medicamentos e codificação médica.

Identificar genes diferencialmente expressos a partir de dados de contagem de RNA-seq de bulk com rigor estatístico. O PyDESeq2 fornece fluxos de trabalho completos do DESeq2, incluindo normalização, estimação de dispersão, teste de Wald, correção de FDR e visualizações prontas para publicação.

Encontrar pesquisas biomédicas relevantes é demorado. Esta habilidade fornece técnicas de pesquisa avançadas, orientação sobre termos MeSH e documentação da API E-utilities para localizar rapidamente artigos, ensaios clínicos e revisões sistemáticas no banco de dados do PubMed com milhões de citações.

Encontrar informações químicas requer navegar por múltiplas bases de dados e consultas complexas de API. Esta habilidade oferece acesso unificado à base de dados PubChem com pesquisa simples por nome, estrutura ou identificador, além de recuperação de propriedades e pesquisas de similaridade para fluxos de trabalho de quimioinformática.

Cientistas passam horas buscando e documentando protocolos de laboratório manualmente. Esta skill oferece integração completa com a API v3 do protocols.io, permitindo acesso programático para buscar, criar, gerenciar e publicar protocolos científicos com recursos de colaboração em equipe.

A revisão por pares de manuscritos científicos requer metodologia consistente entre disciplinas. Esta skill fornece estruturas estruturadas para avaliar metodologia, estatística, reprodutibilidade, ética e padrões de relato para avaliação abrangente de manuscritos e propostas de financiamento.

Encontrar estruturas biológicas 3D requer navegar por múltiplos bancos de dados e formatos de arquivo. Esta habilidade fornece acesso unificado ao repositório RCSB PDB para pesquisar, baixar e analisar mais de 200.000 estruturas moleculares determinadas experimentalmente e computacionalmente.