etetoolkit
Seguro 77Analisar árvores filogenéticas com toolkit ETE
por K-Dense-AI
O toolkit ETE simplifica a análise filogenética para pesquisas em biologia evolutiva. Processe dados de árvores, detecte eventos evolutivos e crie visualizações prontas para publicação.
ensembl-database
Seguro 76Consultar Banco de Dados Genômico Ensembl
por K-Dense-AI
Consulte a API REST do banco de dados genômico Ensembl para dados genômicos de vertebrados. Procure genes, recupere sequências, analise variantes com VEP e realize genômica comparativa em mais de 250 espécies.
dnanexus-integration
Seguro 73Integrar fluxos de trabalho da plataforma de genômica DNAnexus
por K-Dense-AI
A DNAnexus oferece análise de genômica baseada em nuvem, mas requer conhecimento específico da plataforma. Esta skill oferece documentação completa para construir aplicativos, gerenciar dados e executar fluxos de trabalho de bioinformática.
diffdock
Seguro 79Prever poses de ligação molecular com docking de IA
por K-Dense-AI
O DiffDock utiliza modelos de difusão avançados para prever como pequenas moléculas se ligam a proteínas no espaço 3D. Os investigadores podem acelerar a descoberta de medicamentos gerando poses de ligação precisas com pontuações de confiança para design de medicamentos baseado em estruturas.
denario
Baixo Risco 70Automatizar fluxos de trabalho de pesquisa científica
por K-Dense-AI
Transforme conjuntos de dados em pesquisa pronta para publicação, automatizando a geração de hipóteses, desenvolvimento de metodologia, experimentos computacionais e escrita de artigos em LaTeX. IA multiagente coordena agentes especializados para pipelines de pesquisa de ponta a ponta.
datamol
Seguro 70Analisar estruturas moleculares com Datamol
por K-Dense-AI
Processe dados químicos de forma eficiente com uma interface Pythonic para RDKit. Datamol simplifica operações complexas de quimioinformática, mantendo total compatibilidade com o ecossistema RDKit.
cosmic-database
Seguro 75Acessar o banco de dados de mutações de câncer COSMIC
por K-Dense-AI
Pesquisadores de câncer precisam de dados abrangentes de mutações para estudos. Esta habilidade fornece acesso programático ao banco de dados COSMIC contendo milhões de mutações somáticas, listas de genes de câncer curadas e assinaturas mutacionais para pesquisa em oncologia de precisão.
clinvar-database
Baixo Risco 69Consultar Banco de Dados de Variantes Genéticas ClinVar
por K-Dense-AI
O ClinVar contém classificações críticas de variantes para genética clínica, mas acessar e interpretar esses dados requer conhecimento especializado. Esta habilidade fornece orientação abrangente para consultar o ClinVar através de interface web, API ou downloads FTP, com diretrizes detalhadas de interpretação para classificações de significância clínica.
clinpgx-database
Seguro 73Consultar banco de dados farmacogenômico ClinPGx
por K-Dense-AI
Acessar o ClinPGx para recuperar dados de farmacogenômica, incluindo interações gene-droga, diretrizes CPIC e informações sobre função alélica. Esta skill apoia a medicina de precisão oferecendo suporte à decisão clínica para dosagem de medicamentos baseada em genótipo.
clinical-decision-support
Seguro 79Gerar Documentos de Suporte à Decisão Clínica
por K-Dense-AI
Pesquisadores clínicos precisam de documentos baseados em evidências para desenvolvimento de medicamentos e submissões regulatórias. Esta habilidade cria documentos de suporte à decisão clínica prontos para publicação com estratificação por biomarcadores e classificação de evidências GRADE.
citation-management
Baixo Risco 77Gerir citações académicas e bibliografias
por K-Dense-AI
Esta skill ajuda investigadores a encontrar artigos, extrair metadados e gerar entradas BibTeX corretamente formatadas. Valida citações existentes e assegura a precisão das referências para escrita científica e publicação.
cirq
Seguro 71Trabalhe com o framework de computação quântica Cirq do Google
por K-Dense-AI
Projete e simule circuitos quânticos usando o framework Cirq do Google. Esta skill fornece documentação abrangente para construção de circuitos quânticos, modelagem de ruído, integração de hardware e execução de experimentos em computadores quânticos e simuladores.
biorxiv-database
Seguro 76Pesquisar preprints do bioRxiv por palavras-chave, autores e datas
por K-Dense-AI
Pesquisadores perdem horas pesquisando manualmente o bioRxiv por preprints relevantes. Esta skill automatiza a descoberta de literatura com filtragem precisa por palavras-chave, autores, intervalos de datas e categorias científicas.
biopython
Seguro 71Analisar sequências biológicas com Biopython
por K-Dense-AI
Processe sequências de DNA, RNA e proteínas de forma eficiente usando Biopython. Acesse bancos de dados NCBI programaticamente, realize alinhamentos de sequências e automatize pipelines de bioinformática complexos para aplicações de pesquisa.
biomni
Baixo Risco 75Automatize pesquisas biomédicas com agentes de IA
por K-Dense-AI
O biomni transforma pesquisas biomédicas complexas executando autonomamente tarefas de análise de múltiplas etapas. Pesquisadores podem se concentrar em questões científicas enquanto a IA processa dados, revisão de literatura e análise computacional em genômica, descoberta de medicamentos e domínios clínicos.
astropy
Seguro 71Analisar Dados Astronômicos com a Biblioteca Python Astropy
por K-Dense-AI
Trabalhar com dados astronômicos exige lidar com sistemas de coordenadas complexos, formatos de arquivo e cálculos. Esta skill fornece orientação para usar o Astropy para processar coordenadas celestes, arquivos FITS e computações cosmológicas.
alphafold-database
Seguro 69Acessar estruturas proteicas do AlphaFold por ID UniProt
por K-Dense-AI
Pesquisadores precisam de acesso eficiente a previsões computacionais de estruturas proteicas para descoberta de drogas e estudos de biologia estrutural. Esta skill oferece acesso direto ao AlphaFold DB com mais de 200M de estruturas proteicas previstas por IA, permitindo recuperação por ID UniProt, download de arquivos de coordenadas e análise de métricas de confiança.
adaptyv
Baixo Risco 69Submeter sequências de proteínas para validação em laboratório em nuvem
por K-Dense-AI
O design de proteínas requer validação experimental. A Adaptyv oferece acesso a uma API para um laboratório em nuvem para testes automatizados de afinidade de ligação, níveis de expressão, estabilidade térmica e atividade enzimática. Obtenha resultados experimentais em aproximadamente 21 dias.
research-merge
Baixo Risco 70Mesclar Ramificações de Pesquisa Automaticamente
por jrc1883
Ramificações de pesquisa se acumulam e se tornam difíceis de gerenciar. Esta habilidade detecta, mescla e organiza automaticamente descobertas de pesquisa das sessões do Claude Code Web em issues acionáveis do GitHub.
context7
Seguro 71Get Current Library Documentation via Context7 API
por intellectronica
Developers often struggle with outdated or incomplete documentation when working with software libraries. The Context7 skill connects to the Context7 API to retrieve up-to-date documentation, code examples, and API references for any supported library or framework.