metabolomics-workbench-database
Consultar Banco de Dados Metabolomics Workbench
Também disponível em: davila7
Pesquisar e recuperar dados metabolômicos do banco de dados NIH Metabolomics Workbench contendo mais de 4.200 estudos. Acessar estruturas de metábólitos, metadados de estudos, nomenclatura RefMet e realizar pesquisas de espectrometria de massa.
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Testar
A utilizar "metabolomics-workbench-database". Find all studies containing tyrosine
Resultado esperado:
- Encontrados 47 estudos contendo tirosina:
- ST000001 - Análise metabolômica abrangente do metabolismo de aminoácidos
- ST000015 - Vias metabólicas da tirosina em tecido hepático
- ST000042 - Perfilagem de aminoácidos séricos em distúrbios metabólicos
- Resumo do estudo: O Metabolomics Workbench contém 47 estudos medindo tirosina em vários tecidos, espécies e estados de doença.
A utilizar "metabolomics-workbench-database". Search for compounds with m/z 180.06 using M+H adduct
Resultado esperado:
- Principais correspondências para m/z 180,06 (M+H, tolerância de 0,5 Da):
- Registro 11: Glicose (C6H12O6) - massa exata 179,058
- Registro 156: Frutose (C6H12O6) - massa exata 179,058
- Registro 203: Manose (C6H12O6) - massa exata 179,058
- Nota: Essas monossacarídeas compartilham a mesma fórmula molecular
Auditoria de Segurança
SeguroAll 344 static findings are FALSE POSITIVES. The analyzer misidentified markdown documentation code blocks as shell commands, mass spectrometry ion adduct notation (M+H, M-H) as weak cryptographic algorithms, and legitimate database API calls as suspicious network activity. This is a documentation-only skill for the NIH Metabolomics Workbench - a legitimate scientific research database. No executable code exists.
Fatores de risco
🌐 Acesso à rede (2)
⚙️ Comandos externos (2)
📁 Acesso ao sistema de arquivos (1)
Pontuação de qualidade
O Que Você Pode Construir
Encontrar estudos para um metabólito
Pesquisar todos os estudos metabolômicos que contêm medições de um metabólito específico como glicose ou citrato.
Identificar compostos a partir de dados de MS
Inserir valores de m/z de espectrometria de massa para identificar candidatos potenciais de metabólitos que correspondem aos seus dados.
Filtrar estudos por doença
Encontrar estudos metabolômicos de sangue humano para doenças específicas como diabetes ou câncer usando plataformas analíticas específicas.
Tente Estes Prompts
Encontrar todos os estudos no Metabolomics Workbench que contêm medições de [metabolite_name]. Retornar IDs de estudos e breves descrições.
Pesquisar no Metabolomics Workbench compostos correspondentes a m/z [value] com aduto [M+H] e tolerância de 0,5 Da. Listar as principais correspondências.
Usar RefMet para padronizar o nome do metabólito [common_name]. Retornar o nome padronizado e a hierarquia de classificação.
Encontrar estudos metabolômicos de sangue humano sobre [disease_name] usando o método analítico [LCMS ou GCMS ou NMR].
Melhores Práticas
- Use RefMet para padronizar nomes de metabólitos antes de pesquisar estudos para resultados consistentes
- Defina a tolerância de massa apropriada com base na resolução do seu instrumento (0,5 Da para MS de baixa resolução, 0,01 Da para MS de alta resolução)
- Armazene em cache os dados do banco de dados RefMet localmente ao fazer muitas consultas para reduzir chamadas de API
Evitar
- Pesquisar metabólitos sem usar padronização RefMet pode fazer você perder estudos relevantes
- Usar tolerância de massa excessiva retorna muitos falsos positivos
- Fazer solicitações sequenciais rápidas sem atrasos pode acionar limitação de taxa