gene-database
Consultar Banco de Dados de Genes NCBI
Auch verfügbar von: davila7
Acessar dados abrangentes de genes do NCBI, incluindo sequências, anotações e informações funcionais. Pesquisar por símbolo de gene, ID ou contexto biológico para recuperar RefSeqs, Gene Ontology, localizações cromossômicas e fenótipos para pesquisa em bioinformática.
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Einschalten und loslegen
Teste es
Verwendung von "gene-database". Find information about BRCA1 in human
Erwartetes Ergebnis:
- Gene ID: 672
- Symbol: BRCA1
- Description: BRCA1 DNA repair associated
- Organism: Homo sapiens
- Chromosome: 17
- Location: 17q21.31
Verwendung von "gene-database". Find genes associated with diabetes in human
Erwartetes Ergebnis:
- Gene ID list with symbol, description, and chromosome for diabetes-associated genes
- Search query: diabetes[disease] AND human[organism]
Verwendung von "gene-database". Get batch gene data for TP53, EGFR, KRAS
Erwartetes Ergebnis:
- Batch results with gene ID, symbol, description, organism, chromosome, and map location for each gene
Sicherheitsaudit
Niedriges RisikoThis is a legitimate bioinformatics tool for querying NCBI Gene database. All 374 static findings are false positives: markdown backticks in documentation are code formatting (not shell execution), API keys are user-provided CLI arguments (not hardcoded secrets), hardcoded URLs are official NCBI API endpoints, and the network+credential+file pattern is standard API client behavior. No data exfiltration or malicious patterns detected.
Risikofaktoren
🌐 Netzwerkzugriff (4)
⚙️ Externe Befehle (3)
🔑 Umgebungsvariablen (3)
📁 Dateisystemzugriff (1)
Qualitätsbewertung
Was du bauen kannst
Fluxos de trabalho de anotação de genes
Recuperar dados abrangentes de genes, incluindo sequências, termos GO e fenótipos para análise funcional.
Coleta de dados de genes em lote
Processar listas de genes de forma eficiente com limitação de taxa para estudos genômicos em larga escala.
Consulta de informações de genes
Pesquisar símbolos de genes e recuperar informações detalhadas para fins educacionais.
Probiere diese Prompts
Encontrar informações sobre o gene {gene_symbol} em {organismo}, incluindo sua localização cromossômica e função.Recuperar números de acesso RefSeq e dados de sequência de基因 para {gene_id} em formato JSON.Buscar informações de基因 para os seguintes genes de {organismo}: {gene_list}. Retornar os resultados como JSON.Encontrar genes associados com {biological_process} em {organismo} usando termos de Gene Ontology.Bewährte Verfahren
- Inclua o organismo em sua consulta para evitar resultados ambíguos de símbolos de genes que existem em múltiplas espécies
- Use IDs de Gene em vez de símbolos quando precisão é necessária, pois símbolos de genes podem mudar ao longo do tempo
- Inclua sua chave de API NCBI para processamento em lote mais rápido (até 10 requisições por segundo)
Vermeiden
- Não faça requisições individuais em um loop sem limitação de taxa, pois isso acionará os limites de taxa do NCBI
- Não confie apenas em símbolos de genes para armazenamento permanente, pois a nomenclatura oficial pode mudar
- Não assuma que todos os símbolos de genes são únicos dentro de um organismo sem verificar
Häufig gestellte Fragen
Como obter uma chave de API do NCBI?
Quais formatos de genes são suportados?
Posso recuperar sequências de proteínas?
Quantos genes posso consultar de uma vez?
Quais formatos de saída estão disponíveis?
Esta habilidade armazena algum dado?
Entwicklerdetails
Autor
K-Dense-AILizenz
MIT
Repository
https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/gene-databaseRef
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Dateistruktur