技能 biomni
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biomni

低风险 ⚙️ 外部命令🔑 环境变量📁 文件系统访问🌐 网络访问

Automatize pesquisas biomédicas com agentes de IA

也可从以下获取: davila7

O biomni transforma pesquisas biomédicas complexas executando autonomamente tarefas de análise de múltiplas etapas. Pesquisadores podem se concentrar em questões científicas enquanto a IA processa dados, revisão de literatura e análise computacional em genômica, descoberta de medicamentos e domínios clínicos.

支持: Claude Codex Code(CC)
🥉 75 青铜
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开启并开始使用

测试它

正在使用“biomni”。 Desenhar uma tela CRISPR para reguladores de autofagia

预期结果:

  • Gerada biblioteca sgRNA com 76.230 guias visando 19.057 genes
  • Desenhados 4 sgRNAs por gene com escores on-target acima de 0.7
  • Incluídos controles positivos: ATG5, BECN1, ULK1, mTOR
  • Priorizados 347 genes candidatos baseados em análise de via
  • Fornecido código Python para pipeline de análise de tela

正在使用“biomni”。 Analisar RNA-seq de célula única de amostras de tumor

预期结果:

  • Identificadas 12 populações celulares distintas por agrupamento
  • Anotados principais tipos de células imunes: células T, células B, macrófagos
  • Encontrados 3 novos agrupamentos celulares com marcadores desconhecidos
  • Expressão diferencial revelou 234 genes superexpressos em região de tumor

安全审计

低风险
v4 • 1/17/2026

The static analysis flagged 415 patterns, but 95% are FALSE POSITIVES from markdown documentation. The backtick patterns are markdown code delimiters, not shell execution. The API key patterns show example environment variable names in documentation, not actual secrets. The skill is a legitimate Stanford SNAP lab biomedical research framework. The code execution + network + credential combination is the intended design for an AI agent that generates bioinformatics analysis code. Proper security warnings are documented recommending sandboxed execution.

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分析行数
4
发现项
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审计总数
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质量评分

68
架构
100
可维护性
87
内容
21
社区
90
安全
91
规范符合性

你能构建什么

Desenhar telas CRISPR de todo o genoma

Automatizar desenho de biblioteca sgRNA, priorização de genes e análise de efeito de knockout para estudos de genômica funcional

Processar dados de sequenciamento de célula única

Realizar controle de qualidade, agrupamento, anotação de tipo celular e análise de expressão diferencial

Predizer propriedades ADMET de compostos

Avaliar absorção, distribuição, metabolismo, excreção e toxicidade para candidatos a medicamentos

试试这些提示

Desenho de Tela CRISPR
Desenhar uma tela de knockout CRISPR para identificar genes que regulam autofagia em células HEK293. Incluir desenho de biblioteca sgRNA, controles positivo/negativo e priorização de genes baseada em relevância de via.
Análise de Célula Única
Analisar este conjunto de dados de RNA-seq de célula única: realizar QC, identificar populações celulares por agrupamento, anotar tipos celulares usando genes marcadores, e conduzir expressão diferencial. Arquivo: path/to/data.h5ad
Interpretação GWAS
Interpretar resultados GWAS para Diabetes Tipo 2: identificar variantes significativas de todo o genoma, mapear para genes causais, realizar enriquecimento de via e prever consequências funcionais
Predição ADMET de Medicamentos
Prever propriedades ADMET para estes compostos: [SMILES strings]. Focar em permeabilidade Caco-2, ligação a proteínas plasmáticas, interações CYP450, clearance e toxicidade hERG

最佳实践

  • Especifique contexto biológico incluindo organismo, tipo celular e condições experimentais
  • Forneça caminhos de arquivos para seus conjuntos de dados ao analisá-los
  • Defina restrições computacionais para análises complexas
  • Salve histórico de conversação para reprodutibilidade

避免

  • Executar sem revisar código gerado em ambientes de produção
  • Compartilhar chaves de API ou credenciais em ambientes compartilhados
  • Processar dados clínicos sensíveis sem autorização adequada
  • Ignorar configurações de timeout para análises de longa duração

常见问题

O biomni é seguro para usar?
Sim, biomni é do SNAP lab de Stanford. Execute em ambientes isolados, pois executa código gerado com privilégios de sistema.
Quais provedores de LLM o biomni suporta?
Anthropic Claude (recomendado), OpenAI GPT, Google Gemini, Groq, Azure OpenAI e AWS Bedrock.
Quanto dados o biomni baixa?
Aproximadamente 11GB de bases de dados biomédicas incluindo anotações de genes, estruturas de proteínas e conjuntos de dados clínicos.
O biomni pode analisar meus dados experimentais?
Sim, forneça caminhos de arquivos para seus conjuntos de dados em consultas de linguagem natural. Suporta formatos comuns como FASTA, BAM, VCF e HDF5.
Em quais domínios o biomni atua?
Genômica, proteômica, descoberta de medicamentos, genômica clínica, biologia molecular e integração multiômica.
Como devo citar o biomni?
Referencie o preprint: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.05.30.656746v1 e repositório GitHub.