스킬 biomni
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biomni

낮은 위험 ⚙️ 외부 명령어🔑 환경 변수📁 파일 시스템 액세스🌐 네트워크 접근

AI 에이전트로 생물의학 연구 자동화하기

또한 다음에서 사용할 수 있습니다: davila7

Biomni는 다단계 분석 작업을 자율적으로 수행하여 복잡한 생물의학 연구를 혁신합니다. 연구자들은 과학적 질문에 집중할 수 있으며, AI가 유전학, 약물 발견, 임상 영역 전반에 걸쳐 데이터 처리, 문헌 검토, 계산 분석을 담당합니다.

지원: Claude Codex Code(CC)
🥉 75 브론즈
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토글을 켜고 사용 시작

테스트해 보기

"biomni" 사용 중입니다. 자가포식 조절자를 위한 CRISPR 스크리닝 설계

예상 결과:

  • 19,057개 유전자를 대상으로 76,230개 가이드로 구성된 sgRNA 라이브러리 생성
  • 온타겟 점수가 0.7 이상인 유전자당 4개의 sgRNA 설계
  • 양성 대조군 포함: ATG5, BECN1, ULK1, mTOR
  • 경로 분석 기반으로 347개 후보 유전자 우선순위화
  • 스크리닝 분석 파이프라인을 위한 Python 코드 제공

"biomni" 사용 중입니다. 종양 샘플에서 단일세포 RNA-seq 분석

예상 결과:

  • 클러스터링을 통해 12개의 독특한 세포 모집단 식별
  • 주요 면역 세포 유형 주석: T 세포, B 세포, 대식세포
  • 알려지지 않은 마커를 가진 3개의 새로운 세포 클러스터 발견
  • 종양 영역에서 234개의 상향 조절 유전자를 차등 발현으로 발견

보안 감사

낮은 위험
v4 • 1/17/2026

The static analysis flagged 415 patterns, but 95% are FALSE POSITIVES from markdown documentation. The backtick patterns are markdown code delimiters, not shell execution. The API key patterns show example environment variable names in documentation, not actual secrets. The skill is a legitimate Stanford SNAP lab biomedical research framework. The code execution + network + credential combination is the intended design for an AI agent that generates bioinformatics analysis code. Proper security warnings are documented recommending sandboxed execution.

7
스캔된 파일
3,120
분석된 줄 수
4
발견 사항
4
총 감사 수
감사자: claude 감사 이력 보기 →

품질 점수

68
아키텍처
100
유지보수성
87
콘텐츠
21
커뮤니티
90
보안
91
사양 준수

만들 수 있는 것

게놈 전체 CRISPR 스크리닝 설계

기능 유전체学研究을 위한 sgRNA 라이브러리 설계, 유전자 우선순위화, 녹아웃 효과 분석 자동화

단일세포 시퀀스 데이터 처리

품질 관리, 클러스터링, 세포 유형 주석, 차등 발현 분석 수행

화합물 ADMET 특성 예측

약물 후보의 흡수, 분포, 대사, 배출, 독성 평가

이 프롬프트를 사용해 보세요

CRISPR 스크리닝 설계
HEK293 세포에서 자가포식을 조절하는 유전자를 식별하기 위한 CRISPR 녹아웃 스크리닝을 설계하세요. sgRNA 라이브러리 설계, 양성/음성 대조군, 경로 관련성 기반 유전자 우선순위화를 포함하세요.
단일세포 분석
이 단일세포 RNA-seq 데이터셋을 분석하세요: 품질 관리 수행, 클러스터링을 통해 세포 모집단 식별, 마커 유전자를 사용하여 세포 유형 주석, 차등 발현 분석 수행. 파일: path/to/data.h5ad
GWAS 해석
제2형 당뇨병에 대한 GWAS 결과를 해석하세요: 게놈 전체적으로 유의한 변이를 식별하고, 원인 유전자에 매핑하며, 경로 농축 수행하고, 기능적 결과 예측
약물 ADMET 예측
다음 화합물의 ADMET 특성을 예측하세요: [SMILES 문자열]. Caco-2 투과성, 혈장 단백 결합, CYP450 상호작용, 청소율, hERG 독성에 중점을 두세요.

모범 사례

  • 생물학적 맥락을 포함하여 종양, 세포 유형, 실험 조건 명시
  • 데이터셋 분석 시 파일 경로 제공
  • 복잡한 분석을 위한 계산 제약 설정
  • 재현성을 위해 대화 기록 저장

피하기

  • 생성된 코드를 프로덕션 환경에서 검토 없이 실행
  • 공유 환경에서 API 키 또는 자격 증명 공유
  • 적절한 승인 없이 민감한 임상 데이터 처리
  • 장기 실행 분석에 대한 타임아웃 설정 무시

자주 묻는 질문

biomni를 안전하게 사용할 수 있나요?
네, biomni는 Stanford의 SNAP 랩에서 개발했습니다. 생성된 코드를 시스템 권한으로 실행하므로 격리된 환경에서 실행하세요.
biomni는 어떤 LLM 제공업체를 지원하나요?
Anthropic Claude(권장), OpenAI GPT, Google Gemini, Groq, Azure OpenAI, AWS Bedrock.
biomni는 얼마나 많은 데이터를 다운로드하나요?
유전자 주석, 단백질 구조, 임상 데이터셋을 포함한 생물의학 데이터베이스 약 11GB.
biomni가 내 실험 데이터를 분석할 수 있나요?
네, 자연어 쿼리에서 데이터셋에 대한 파일 경로를 제공하세요. FASTA, BAM, VCF, HDF5와 같은 일반적인 형식을 지원합니다.
biomni는 어떤 영역을 다루나요?
유전체학, 단백질체학, 약물 발견, 임상 유전체학, 분자 생물학, 다중 오믹스 통합.
biomni를 인용하려면 어떻게 해야 하나요?
프리프린트 참고: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.05.30.656746v1 및 GitHub 리포지토리를 참조하세요.

개발자 세부 정보

작성자

K-Dense-AI

라이선스

Apache-2.0 license

참조

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