技能 string-database
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5900만 개의 단백질과 200억 개의 상호작용을 포함하는 STRING 데이터베이스에서 단백질 간 상호작용 네트워크에 접근하세요. 기능 강화 분석을 수행하고, 상호작용 파트너를 발견하며, 시스템 생물학 연구를 위한 네트워크 시각화를 생성할 수 있습니다.
支援: Claude Codex Code(CC)
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下載技能 ZIP
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在 Claude 中上傳
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開啟並開始使用
測試它
正在使用「string-database」。 Get interaction partners for TP53
預期結果:
- Top TP53 interactors: MDM2 (score 999), MDM4 (score 995), ATM (score 957)
- MDM2 is the strongest interactor with experimental evidence
正在使用「string-database」。 Enrich BRCA1 gene list
預期結果:
- DNA repair (GO:0006281) FDR: 1.2e-15
- Cell cycle (GO:0007049) FDR: 3.4e-12
- Homologous recombination (GO:0000724) FDR: 8.9e-10
正在使用「string-database」。 Create network image
預期結果:
- Generated network image showing TP53, ATM, CHEK2, BRCA1 connections
- Edges colored by evidence type, thickness by confidence score
安全審計
安全v5 • 1/17/2026
All static findings are false positives. External command detections are markdown code fences, network access is to legitimate STRING database API, filesystem operations save visualization images, and heuristic alerts are standard API client patterns. No malicious intent detected.
4
已掃描檔案
1,630
分析行數
2
發現項
5
審計總數
風險因素
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📁 檔案系統存取 (1)
審計者: claude 查看審計歷史 →
品質評分
64
架構
90
可維護性
85
內容
30
社群
100
安全
78
規範符合性
你能建構什麼
단백질 상호작용 분석
프로테오믹스 또는 RNA-seq 실험에서 얻은 유전자 목록에 대한 단백질 네트워크 분석
경로 강화 분석
단백질 세트에서 강화된 GO 용어 및 KEGG 경로 식별
상호작용 파트너 발견
관심 단백질과 상호작용하는 단백질을 찾고 시각화
試試這些提示
기본 네트워크 조회
Use string-database to get the interaction network for TP53 and MDM2 at high confidence (score 700)
기능 강화 분석
Perform GO and KEGG enrichment analysis on these proteins: TP53, BRCA1, ATM, CHEK2, MDM2
네트워크 시각화
Create a confidence-colored network image for these cancer genes and save as png
PPI 강화 분석
Check if these proteins form a significantly connected module: BRCA1, BRCA2, PALB2, RAD51, ATM
最佳實務
- 더 빠른 조회를 위해 먼저 유전자 이름을 STRING ID로 매핑
- 분석 목표에 적합한 신뢰도 점수 임계값 사용
- 속도 제한을 준수하기 위해 API 호출 사이에 1초 대기
避免
- 출판용 그림에 낮은 신뢰도 임계값을 사용하지 마세요
- 대량의 단백질 목록에 대해 종 매개변수를 생략하지 마세요
- API 응답을 파싱할 때 오류 확인을 건너뛰지 마세요
常見問題
어떤 신뢰도 점수를 사용해야 하나요?
탐색적 분석에는 400을 사용하고, 출판용 고신뢰도 상호작용에는 700을 사용하세요.
어떤 종이 지원되나요?
인간(9606), 마우스(10090), 효모(4932), 대장균을 포함하여 5000개 이상의 종이 지원됩니다.
몇 개의 단백질을 조회할 수 있나요?
API는 목록을 효율적으로 처리하지만, 수천 개의 단백질의 경우 웹 인터페이스를 사용하세요.
어떤 출력 형식을 사용할 수 있나요?
데이터의 경우 TSV, JSON, XML, PSI-MI, 네트워크 이미지의 경우 PNG 및 SVG를 지원합니다.
API 키가 필요한가요?
기본 조회에는 키가 필요하지 않습니다. 대량 분석 기능을 사용하려면 등록이 필요합니다.
출판물에서 STRING을 어떻게 인용하나요?
string-db.org/about에서 최신 Szklarczyk et al. 출판물을 인용하세요