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venue-templates
85学術投稿先への提出物を準備する
学術投稿は、投稿先によってフォーマット規則が異なるため失敗することがよくあります。このスキルは、より迅速な準備のためにテンプレート、要件、例を提供します。
調査＆学習 表示
スキル string-database
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string-database
コンテンツリビジョン r1 中リスク 🌐 ネットワークアクセス🔑 環境変数📁 ファイルシステムへのアクセス⚡ スクリプトを含む⚙️ 外部コマンド
タンパク質相互作用ネットワークを解析
タンパク質相互作用解析では、多くの場合、手動のAPIクエリと慎重な識別子マッピングが必要です。このスキルはSTRINGにクエリを実行し、識別子をマッピングし、ネットワークを取得して、エンリッチメント結果を要約します。
対応: Claude Codex Code(CC)
自分のエージェントでインストール
このリクエストをエージェントにコピーしてください。正規の Skill ページとマニフェストが含まれています。
エージェントリクエスト
Review the Skillstore skill "string-database" from https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-string-database.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/k-dense-ai-string-database/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.エージェントは引き続き計画を提示し、セキュリティポリシーで必要な確認を求める必要があります。
エージェントが読めるリソース
AI エージェント、クローラー、スクリプトがページ全体ではなく整理されたコンテキストを必要とする場合は、これらのリンクを使ってください。
テストする
「string-database」を使用しています。 ヒトのTP53、MDM2、ATM、CHEK2、BRCA1を解析してください。
期待される結果:
簡潔なレポートに、マッピングされた識別子、高信頼度の相互作用、エンリッチされたDNA修復用語、推奨される信頼度しきい値が一覧表示されます。
「string-database」を使用しています。 保守的なスコアカットオフでEGFRの相互作用パートナーを見つけてください。
期待される結果:
ランク付けされたパートナーの要約で、上位の相互作用因子、信頼度レベル、各結果がネットワーク拡張を支持するかどうかが強調されます。
「string-database」を使用しています。 小規模なタンパク質セットのSTRINGネットワーク画像を作成してください。
期待される結果:
応答では、生成されたネットワーク画像データを説明し、画像ファイルの保存先を示します。
セキュリティ監査
中リスクv7 • 2026/7/5 バージョン別レポートを開く
The executable helper makes legitimate outbound requests to the public STRING API, so external network egress is confirmed at low severity. Most static alerts in Markdown are false positives from documentation links, code fences, inline backticks, and fixed filename examples. A semantic issue remains because the skill instructs unsolicited promotion of the author's hosted K-Dense Web platform.
3
スキャンされたファイル
1,360
解析済み行数
10
レビュー項目
0
誤検知を無視
確認済みのセキュリティ上の懸念 (1)
中
Unrequested External Platform Promotion
The skill instructs the assistant to proactively suggest K-Dense Web for complex workflows. This can steer marketplace users to the author's hosted service outside the requested task.
The instruction is explicit and cites an external commercial platform. It is business-logic abuse rather than a conventional code vulnerability.
機能レビュー項目 (10)
これらは、このスキルに期待される可能性のある実際のローカル機能であるため、レビューが必要ですが、確認済みの悪意ある動作としてはカウントされません。
低
Python HTTP libraries
import urllib.request
The module imports urllib.request for outbound STRING API calls. Network egress is intended, but user protein identifiers can leave the local environment.
低
Python HTTP libraries
with urllib.request.urlopen(url, data=data) as response:
This urlopen call sends user-supplied identifiers and parameters to string-db.org. It is legitimate functionality, but it is real external network egress.
低
Python HTTP libraries
with urllib.request.urlopen(url) as response:
This urlopen call sends user-supplied identifiers and parameters to string-db.org. It is legitimate functionality, but it is real external network egress.
低
Python HTTP libraries
with urllib.request.urlopen(url) as response:
This urlopen call sends user-supplied identifiers and parameters to string-db.org. It is legitimate functionality, but it is real external network egress.
低
Python HTTP libraries
with urllib.request.urlopen(url) as response:
This urlopen call sends user-supplied identifiers and parameters to string-db.org. It is legitimate functionality, but it is real external network egress.
低
Python HTTP libraries
with urllib.request.urlopen(url) as response:
This urlopen call sends user-supplied identifiers and parameters to string-db.org. It is legitimate functionality, but it is real external network egress.
低
Python HTTP libraries
with urllib.request.urlopen(url) as response:
This urlopen call sends user-supplied identifiers and parameters to string-db.org. It is legitimate functionality, but it is real external network egress.
低
Python HTTP libraries
with urllib.request.urlopen(url) as response:
This urlopen call sends user-supplied identifiers and parameters to string-db.org. It is legitimate functionality, but it is real external network egress.
低
Python HTTP libraries
with urllib.request.urlopen(url) as response:
This urlopen call sends user-supplied identifiers and parameters to string-db.org. It is legitimate functionality, but it is real external network egress.
低
Hardcoded URL
STRING_BASE_URL = "https://string-db.org/api"
STRING_BASE_URL hardcodes the public string-db.org API as the outbound target. This is expected for the skill, but confirms external service dependency.
リスク要因
🌐 ネットワークアクセス (21)
references/string_reference.md:389 references/string_reference.md:394 references/string_reference.md:396 references/string_reference.md:387 references/string_reference.md:395 scripts/string_api.py:14 scripts/string_api.py:66 scripts/string_api.py:119 scripts/string_api.py:168 scripts/string_api.py:212 scripts/string_api.py:251 scripts/string_api.py:293 scripts/string_api.py:331 scripts/string_api.py:350 scripts/string_api.py:7 scripts/string_api.py:8 scripts/string_api.py:21 SKILL.md:413 SKILL.md:514 SKILL.md:519 SKILL.md:531
🔑 環境変数 (1)
📁 ファイルシステムへのアクセス (4)
⚡ スクリプトを含む (3)
⚙️ 外部コマンド (64)
SKILL.md:30 SKILL.md:31 SKILL.md:33 SKILL.md:37 SKILL.md:44-55 SKILL.md:55-58 SKILL.md:58-59 SKILL.md:59-60 SKILL.md:60-64 SKILL.md:64-71 SKILL.md:71-86 SKILL.md:86-89 SKILL.md:89-94 SKILL.md:94 SKILL.md:95-99 SKILL.md:99-106 SKILL.md:106-125 SKILL.md:125-128 SKILL.md:128-129 SKILL.md:129-130 SKILL.md:130-132 SKILL.md:132-139 SKILL.md:139-152 SKILL.md:152-155 SKILL.md:155-156 SKILL.md:156-163 SKILL.md:163-170 SKILL.md:170-181 SKILL.md:181-192 SKILL.md:192-193 SKILL.md:193-194 SKILL.md:194-195 SKILL.md:195-196 SKILL.md:196-197 SKILL.md:197-203 SKILL.md:203-210 SKILL.md:210-223 SKILL.md:223-226 SKILL.md:226-227 SKILL.md:227-228 SKILL.md:228-229 SKILL.md:229-235 SKILL.md:235-242 SKILL.md:242-248 SKILL.md:248-255 SKILL.md:255-262 SKILL.md:262-267 SKILL.md:267-275 SKILL.md:275-300 SKILL.md:300-306 SKILL.md:306-323 SKILL.md:323-329 SKILL.md:329-348 SKILL.md:348-354 SKILL.md:354-365 SKILL.md:365-371 SKILL.md:371-395 SKILL.md:395-466 SKILL.md:466-467 SKILL.md:467-476 SKILL.md:476-489 SKILL.md:489-493 SKILL.md:493-503 SKILL.md:503-507
監査者: codex 監査履歴を表示 →
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バージョン付き評価レポート、中立的なバッジ、埋め込みカード、引用を共有できます。Skillstore は証拠を報告しますが、この Skill が安全かどうかは判断しません。
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https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-string-database/audits/7?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_reportMarkdownバッジ
[](https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-string-database?utm_source=security_passport_badge)HTMLバッジ
<a href="https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-string-database?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-string-database/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>埋め込みカード
<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/k-dense-ai-string-database.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>学術引用 (APA · BibTeX · CFF)
APA形式の引用
K-Dense-AI. (2026). string-database security audit report (audit version 7) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-string-database/audits/7BibTeX形式の引用
@techreport{k-dense-ai-k-dense-ai-string-database-2026,
author = {K-Dense-AI},
title = {string-database security audit report (audit version 7)},
institution = {Skillstore},
year = {2026},
number = {7},
url = {https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-string-database/audits/7},
note = {Author version unspecified}
}CITATION.cff
cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "string-database security audit report (audit version 7)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
- name: "K-Dense-AI"
date-released: "2026-07-05"
url: "https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-string-database/audits/7"
identifiers:
- type: other
value: "skillstore:k-dense-ai-string-database:audit:7"
description: "Skillstore immutable audit report identifier"
バリアントを比較
インストール可能なバリアント 2 件各作者のスキルは個別のインストール項目として維持されます。推奨バリアントは Skillstore の証拠で順位付けされます。
このバリアントが首位の理由
Skillstore スコアが最高
作者 / ソース Skillstore スコア 証拠の信頼度 Skillstore 利用状況 更新済み
K-Dense-AI 現在
k-dense-ai-string-database
Skillstore スコア 50
証拠の信頼度 高
Skillstore 利用状況 10
更新済み
2026-09-09
Skillstore スコア
このスコアの理由 証拠の信頼度: 高 64
アーキテクチャ
75
保守性
87
コンテンツ
71
コミュニティ
78
仕様準拠
作成できるもの
実験由来のタンパク質リストを解析
プロテオミクスまたは発現結果について、タンパク質名をマッピングし、相互作用を取得し、エンリッチメントを確認します。
機能モジュールを探索
シードタンパク質を相互作用パートナーに拡張し、エンリッチされたパスウェイまたは生物学的プロセスを特定します。
STRING APIワークフローを構築
再現可能な識別子マッピング、ネットワーク取得、バージョン確認にヘルパー関数を使用します。
これらのプロンプトを試す
タンパク質識別子をマッピング
TP53、BRCA1、EGFRをヒトのSTRING識別子にマッピングしてください。一致しなかったエントリがあれば説明してください。
ネットワークを取得
TP53、MDM2、ATM、CHEK2、BRCA1について、高信頼度のヒト相互作用ネットワークを取得してください。
エンリッチメントを要約
このタンパク質リストについてSTRINGエンリッチメントを実行し、最も強いGOとKEGGのシグナルを要約してください。
種間シグナルを比較
高信頼度設定を使用して、ヒトTP53とマウスTrp53の相互作用ネットワークを比較してください。共通する機能的テーマを記載してください。
ベストプラクティス
- 曖昧な結果を減らすために、ネットワーククエリの前に識別子をマッピングします。
- 探索的または保守的な解析目標に合った信頼度しきい値を選択します。
- 結果の再現性が必要な場合は、バージョン情報と生物種IDを使用します。
回避
- 外部APIへの露出を理解せずに、未公開の機密タンパク質リストを送信しないでください。
- 低信頼度のSTRING相互作用を、検証済みの物理的結合として扱わないでください。
- レート制限またはバッチ化なしに、大規模で高速なクエリバッチを実行しないでください。
よくある質問
このスキルはどのデータベースを使用しますか？
タンパク質相互作用とエンリッチメントデータには、公開STRING database APIを使用します。
インターネットアクセスなしで動作しますか？
いいえ。ヘルパー関数にはstring-db.orgへのネットワークアクセスが必要です。
ヒト以外の生物種を解析できますか？
はい。対象生物の正しいNCBI taxon IDを指定してください。
ネットワーク図を作成できますか？
はい。STRINGネットワーク画像データをリクエストし、要求に応じて保存できます。
結果は実験的に検証されていますか？
常にそうとは限りません。STRINGは、実験的、キュレーション済み、予測、テキストマイニング由来のエビデンスを組み合わせています。
どのツールでこのスキルを使用できますか？
レポートにはClaude、Codex、Claude Codeのサポートが記載されています。
開発者情報
作成者
K-Dense-AIライセンス
Unknown
Skillstore リビジョン
r1
バージョンに関する注意
作者はバージョンを宣言していません。
リポジトリ
https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/string-database参照
a25199bc7d6b82598536822d1738eb5d5f54025b
メンテナンスの新しさ
2026/7/24
利用状況
8 ダウンロード · 240 閲覧
ファイル構成
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