スキル gwas-database

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gwas-database

Name: gwas-database
Author: K-Dense-AI

コンテンツリビジョン r1 中リスク 🌐 ネットワークアクセス📁 ファイルシステムへのアクセス⚙️ 外部コマンド

GWAS Catalog の関連を検索

遺伝的関連の検索では、多くの識別子やエンドポイントが必要になることがよくあります。このスキルは、Claude、Codex、Claude Code が GWAS Catalog のルックアップを行い、明確な研究成果を出せるようにガイドします。

対応: Claude Codex Code(CC)

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エージェントリクエスト

Review the Skillstore skill "gwas-database" from https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-gwas-database.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/k-dense-ai-gwas-database/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.

エージェントは引き続き計画を提示し、セキュリティポリシーで必要な確認を求める必要があります。

エージェントが読めるリソース

AI エージェント、クローラー、スクリプトがページ全体ではなく整理されたコンテキストを必要とする場合は、これらのリンクを使ってください。

Markdown詳細 GET /skills/k-dense-ai-gwas-database.md 署名済み manifest GET /api/skills/k-dense-ai-gwas-database/manifest 署名済み lockfile GET /api/skills/k-dense-ai-gwas-database/lockfile

テストする

「gwas-database」を使用しています。 rs7903146 association lookup

期待される結果:

形質、最も強いアレル、p 値、マッピングされた遺伝子、PMID、GWAS Catalog 研究アクセッションを含む簡潔な関連要約。

「gwas-database」を使用しています。 Parkinson disease trait review

期待される結果:

主要なバリアント、報告された形質、出版物メタデータ、祖先集団に関する記録、解釈上の注意点を一覧化したグループ別エビデンス要約。

「gwas-database」を使用しています。 Summary statistics access plan

期待される結果:

ソースエンドポイント、ファイルサイズに関する懸念、整合性チェック、ライセンスの注記、再現性フィールドを含む文書化されたアクセス計画。

セキュリティ監査

中リスク

v7 • 2026/7/5 バージョン別レポートを開く

Most static findings are false positives from Markdown backticks and intended examples accessing public NHGRI-EBI GWAS endpoints. Confirmed risks are limited to FTP or plain HTTP summary-statistics downloads and local file writing without integrity or path safeguards. No prompt injection or malicious exfiltration language was found.

スキャンされたファイル

1,402

解析済み行数

レビュー項目

誤検知を無視

確認済みのセキュリティ上の懸念 (1)

中

SKILL.md:404-407 references/api_reference.md:758-774

Unverified Summary Statistics Download

The skill includes workflows that fetch summary statistics over FTP or plain HTTP and save them locally without checksum or signature validation.

The cited examples use wget over FTP or requests against an http://ftp.ebi.ac.uk URL, then write downloaded bytes locally. The endpoint is legitimate, but the workflow lacks integrity verification.

機能レビュー項目 (7)

これらは、このスキルに期待される可能性のある実際のローカル機能であるため、レビューが必要ですが、確認済みの悪意ある動作としてはカウントされません。

中

references/api_reference.md:772

Python file write/append

with open(output_path, 'wb') as f:

The example writes streamed network content to a local path derived from parameters. Normal GCST IDs are structured, but the workflow lacks path validation, overwrite protection, and checksum checks.

中

SKILL.md:258

FTP protocol

# ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/gwas/summary_statistics/GCSTXXXXXX/

The skill recommends ftp:// access for GWAS summary statistics. FTP lacks transport security and integrity protection, so downloaded research data could be tampered with in transit.

中

SKILL.md:407

FTP protocol

wget ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/gwas/summary_statistics/GCSTXXXXXX/harmonised/GCSTXXXXXX-harm

The skill recommends ftp:// access for GWAS summary statistics. FTP lacks transport security and integrity protection, so downloaded research data could be tampered with in transit.

低

references/api_reference.md:769

Python HTTP libraries

response = requests.get(harmonised_url, stream=True)

This request streams a summary-statistics download built from a plain HTTP FTP mirror URL. The source is legitimate, but the example lacks secure transport and integrity validation.

低

references/api_reference.md:761

Hardcoded URL

ftp_base = "http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/gwas/summary_statistics"

This URL points to a plain HTTP or FTP bulk-download path for public summary statistics. The domain is legitimate, but the transport is not integrity protected.

低

SKILL.md:235

Hardcoded URL

1. **FTP download**: http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/gwas/summary_statistics/

This URL points to a plain HTTP or FTP bulk-download path for public summary statistics. The domain is legitimate, but the transport is not integrity protected.

低

SKILL.md:602

Hardcoded URL

- **FTP site**: http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/gwas/

This URL points to a plain HTTP or FTP bulk-download path for public summary statistics. The domain is legitimate, but the transport is not integrity protected.

リスク要因

🌐 ネットワークアクセス (93)

📁 ファイルシステムへのアクセス (1)

references/api_reference.md:772

⚙️ 外部コマンド (71)

SKILL.md:42 SKILL.md:43 SKILL.md:52-54 SKILL.md:54-58 SKILL.md:58-62 SKILL.md:62-66 SKILL.md:66-69 SKILL.md:69-73 SKILL.md:73-75 SKILL.md:75-79 SKILL.md:79-83 SKILL.md:83-91 SKILL.md:91-92 SKILL.md:92-100 SKILL.md:100-101 SKILL.md:101-108 SKILL.md:108-110 SKILL.md:110-111 SKILL.md:111-118 SKILL.md:118-120 SKILL.md:120-121 SKILL.md:121-126 SKILL.md:126-128 SKILL.md:128-129 SKILL.md:129-134 SKILL.md:134-139 SKILL.md:139-156 SKILL.md:156-159 SKILL.md:159-181 SKILL.md:181-184 SKILL.md:184-208 SKILL.md:208-211 SKILL.md:211-228 SKILL.md:228-246 SKILL.md:246-259 SKILL.md:259-281 SKILL.md:281-291 SKILL.md:291-302 SKILL.md:302-304 SKILL.md:304-325 SKILL.md:325-327 SKILL.md:327-330 SKILL.md:330-332 SKILL.md:332-347 SKILL.md:347-350 SKILL.md:350-405 SKILL.md:405-408 SKILL.md:408-411 SKILL.md:411-414 SKILL.md:414-424 SKILL.md:424-425 SKILL.md:425-426 SKILL.md:426-427 SKILL.md:427-428 SKILL.md:428-429 SKILL.md:429-430 SKILL.md:430-431 SKILL.md:431-432 SKILL.md:432-433 SKILL.md:433-436 SKILL.md:436-437 SKILL.md:437-438 SKILL.md:438-439 SKILL.md:439-440 SKILL.md:440-441 SKILL.md:441-442 SKILL.md:442-446 SKILL.md:446-447 SKILL.md:447-448 SKILL.md:448-483 SKILL.md:483-541

監査者: codex 監査履歴を表示 →

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Markdownバッジ

[![Skillstore security assessment](https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-gwas-database/security.svg)](https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-gwas-database?utm_source=security_passport_badge)

HTMLバッジ

<a href="https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-gwas-database?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-gwas-database/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>

埋め込みカード

<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/k-dense-ai-gwas-database.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>

学術引用 (APA · BibTeX · CFF)

APA形式の引用

K-Dense-AI. (2026). gwas-database security audit report (audit version 7) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-gwas-database/audits/7

BibTeX形式の引用

@techreport{k-dense-ai-k-dense-ai-gwas-database-2026,
  author = {K-Dense-AI},
  title = {gwas-database security audit report (audit version 7)},
  institution = {Skillstore},
  year = {2026},
  number = {7},
  url = {https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-gwas-database/audits/7},
  note = {Author version unspecified}
}

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "gwas-database security audit report (audit version 7)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
  - name: "K-Dense-AI"
date-released: "2026-07-05"
url: "https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-gwas-database/audits/7"
identifiers:
  - type: other
    value: "skillstore:k-dense-ai-gwas-database:audit:7"
    description: "Skillstore immutable audit report identifier"

バリアントを比較

インストール可能なバリアント 2 件

各作者のスキルは個別のインストール項目として維持されます。推奨バリアントは Skillstore の証拠で順位付けされます。

このバリアントが首位の理由

Skillstore スコアが最高

作者 / ソース Skillstore スコア証拠の信頼度 Skillstore 利用状況更新済み

davila7 推奨

davila7-gwas-database

Skillstore スコア 74

証拠の信頼度高

Skillstore 利用状況 13

更新済み

2026-09-09

K-Dense-AI 現在

k-dense-ai-gwas-database

Skillstore スコア 50

証拠の信頼度高

Skillstore 利用状況 19

更新済み

2026-09-09

Skillstore スコア

このスコアの理由証拠の信頼度: 高

アーキテクチャ

保守性

コンテンツ

コミュニティ

仕様準拠

作成できるもの

バリアントエビデンスレビュー

SNP を検索し、GWAS Catalog レコードから形質、p 値、遺伝子、出版物メタデータを要約します。

形質関連検索

疾患または表現型についてゲノムワイド有意なバリアントを見つけ、構造化されたエビデンス要約を作成します。

Summary Statistics 計画

完全な summary statistics がある研究を特定し、下流解析のための安全で文書化されたデータアクセスを計画します。

これらのプロンプトを試す

バリアントを調べる

GWAS Catalog スキルを使用して、rs7903146 の既知の関連を要約してください。形質、p 値、マッピングされた遺伝子、研究アクセッションを含めてください。

形質を検索する

GWAS Catalog で type 2 diabetes のゲノムワイド有意な関連を見つけてください。結果をバリアント別にグループ化し、研究メタデータを報告してください。

遺伝子エビデンスを比較する

APOE について、Alzheimer disease に関連する近傍の GWAS Catalog バリアントを特定してください。利用可能な場合は効果の方向を含め、祖先集団の文脈を記録してください。

再現可能なレビューを構築する

body mass index に関する再現可能な GWAS Catalog 検索計画を作成してください。REST エンドポイント、ページネーション戦略、フィルター、引用フィールドを含めてください。

ベストプラクティス

GWAS Catalog のアクセス日を記録し、研究アクセッションまたは PubMed ID を引用します。
広範な API 検索では、ページネーション、遅延、キャッシュを使用します。
関連を解釈する前に、祖先集団、サンプルサイズ、ゲノムビルド、研究デザインを確認します。

回避

GWAS の関連を臨床的推奨として扱わないでください。
変換手順を文書化せずに、ゲノムビルドや座標系を混在させないでください。
ライセンス、サイズ、整合性を確認せずに bulk summary statistics をダウンロードしないでください。

よくある質問

このスキルには API キーが必要ですか?

いいえ。参照されている GWAS Catalog API はオープンアクセスですが、ユーザーはサービス制限を尊重する必要があります。

rs ID で検索できますか?

はい。特定の rs 識別子に関するバリアント詳細と関連のガイダンスが含まれています。

個人の疾患リスクを解釈できますか?

いいえ。研究目的のルックアップを支援します。臨床的解釈には、資格のある専門家によるレビューと適切な同意が必要です。

summary statistics は対象に含まれますか?

はい。大規模ファイルに関する注意点を含め、API と一括アクセスのパターンを説明します。

どのソースを使用しますか?

NHGRI-EBI GWAS Catalog、Summary Statistics API、公式ドキュメントに重点を置いています。

結果は時間とともに変わることがありますか?

はい。GWAS Catalog は更新されるため、レポートにはアクセス日と識別子を含める必要があります。

開発者情報

作成者

K-Dense-AI

ライセンス

不明

Skillstore リビジョン

バージョンに関する注意

作者はバージョンを宣言していません。

リポジトリ

https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/gwas-database

参照

a25199bc7d6b82598536822d1738eb5d5f54025b

メンテナンスの新しさ

2026/7/24

利用状況

9 ダウンロード · 192 閲覧

ファイル構成

📁 references/

📄 api_reference.md

📄 SKILL.md