スキル benchling-integration
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benchling-integration
安全 ⚡
スクリプトを含む🌐
ネットワークアクセス🔑
環境変数⚙️
外部コマンド📁
ファイルシステムへのアクセス
Benchling R&Dプラットフォームとの連携
こちらからも入手できます: davila7
Benchling R&Dプラットフォームとの連携により、 laboratory workflowsの自動化と生物学的データ管理を実現します。Python SDKまたはREST APIを通じて、DNA配列、タンパク質データ、インベントリ、および電子ラボノートにアクセスできます。
対応: Claude Codex Code(CC)
1
スキルZIPをダウンロード
2
Claudeでアップロード
設定 → 機能 → スキル → スキルをアップロードへ移動
3
オンにして利用開始
テストする
「benchling-integration」を使用しています。 環境変数を使用してBenchling認証をセットアップする方法を教えてください。
期待される結果:
- os.environを使用して環境変数から認証情報を取得し、セキュアな認証を行います。
- 推奨されるアプローチ: APIキーをBENCHLING_API_KEYに、テナントURLをBENCHLING_TENANT_URLに保存します。
- 例: api_key = os.environ.get('BENCHLING_API_KEY')
- これにより、認証情報がソースコードから除外され、セキュリティで保護されたデプロイ Practicesがサポートされます。
「benchling-integration」を使用しています。 DNA配列を作成してBenchlingレジストリに登録する方法を示してください
期待される結果:
- 作成時に登録するには、entity_registry_idパラメータとともにDnaSequenceCreateを使用します。
- 例: 自動レジストリID生成にはnaming_strategy='NEW_IDS'を設定します。
- entry_idとentity_idを使用してbenchling.entry_links.create()でノートブックエントリにリンクします。
- SDKはジェネレータベースの反転により自動的にページネーションを処理します。
セキュリティ監査
安全v4 • 1/17/2026
This is a documentation-only skill containing reference materials for the Benchling R&D platform API. Static analysis flagged 476 patterns in markdown files, but ALL findings are FALSE POSITIVES. The scanner detected markdown code formatting (backticks), example URLs, and placeholder credentials in documentation examples - not actual executable code with security implications.
6
スキャンされたファイル
5,064
解析された行数
5
検出結果
4
総監査数
リスク要因
⚡ スクリプトを含む (3)
🌐 ネットワークアクセス (43)
evaluation_output.json:30 references/api_endpoints.md:818 references/api_endpoints.md:863 references/api_endpoints.md:7 references/api_endpoints.md:25 references/api_endpoints.md:32 references/api_endpoints.md:80 references/api_endpoints.md:792 references/api_endpoints.md:819 references/api_endpoints.md:857 references/api_endpoints.md:881 references/api_endpoints.md:882 references/api_endpoints.md:883 references/authentication.md:29 references/authentication.md:37 references/authentication.md:87 references/authentication.md:98 references/authentication.md:113 references/authentication.md:148 references/authentication.md:156 references/authentication.md:292 references/authentication.md:298 references/authentication.md:312 references/authentication.md:332 references/authentication.md:336 references/authentication.md:369 references/authentication.md:377 references/authentication.md:378 references/authentication.md:379 references/sdk_reference.md:30 references/sdk_reference.md:572 references/sdk_reference.md:579 references/sdk_reference.md:771 references/sdk_reference.md:772 references/sdk_reference.md:773 references/sdk_reference.md:774 skill-report.json:6 SKILL.md:48 SKILL.md:62 SKILL.md:336 SKILL.md:474 SKILL.md:475 SKILL.md:476
🔑 環境変数 (46)
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⚙️ 外部コマンド (336)
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📁 ファイルシステムへのアクセス (1)
監査者: claude 監査履歴を表示 →
品質スコア
45
アーキテクチャ
100
保守性
87
コンテンツ
20
コミュニティ
100
セキュリティ
91
仕様準拠
作れるもの
配列登録の自動化
FASTAファイルからDNAおよびタンパク質配列をBulkでインポートし、適切な命名とカスタムフィールドとともにBenchlingレジストリに直接登録します。
インベントリ追跡
サンプルのロケーションを監視し、コンテナ転送を追跡し、フリーザー場所とストレージユニット全体のインベントリ変更を監査します。
研究分析
コンプライアンスレポート用および外部BIツールとの連携用に、Data Warehouseから実験データをエクスポートします。
これらのプロンプトを試す
基本接続
APIキーを使用してBenchlingで認証し、自分のテナントへの接続を作成する方法を示してください。
配列操作
新しいDNA配列を作成し、レジストリに登録し、ノートブックエントリにリンクする方法を教えてください。
インベントリ管理
コンテナ間のロケーションを転送し、移動履歴を追跡するワークフローを作成してください。
自動化スクリプト
特定のスキーマを持つすべての配列を見つけ、その名前、ベース、作成日をCSVにエクスポートするスクリプトを作成してください。
ベストプラクティス
- API認証情報は環境変数またはシークレットマネージャーに保存し、スクリプトにハードコードすることは避けてください
- すべてのAPI接続にHTTPSを使用してください - Benchlingはセキュアな通信を要求します
- レート制限と一時的な障害に対するリトライロジックを含む適切なエラー処理を実装してください
回避
- APIキーや認証情報をバージョン管理システムにコミットしないでください
- レート制限を確認せずにリクエストを行ったり、バックオフ戦略を実装したりすることは避けてください
- テナントURLをハードコードせず、構成ファイルまたは環境変数を代わりに使用してください
よくある質問
BenchlingのAPI認証情報はどのように取得できますか？
Benchlingにログインし、プロフィール設定に移動して、APIキーを生成します。一度だけ表示されるため、安全に保管してください。
どのようなPythonバージョンが必要ですか？
Benchling SDKにはPython 3.7以降が必要です。python --versionでバージョンを確認してください。
このスキルはオフラインで使用できますか？
いいえ、このスキルを使用するにはBenchling APIと通信するためのアクティブなインターネット接続が必要です。
レート制限はどのように処理すればよいですか？
SDKは指数バックオフで429エラーに対して自動的にリトライします。必要に応じてRetryStrategyでmax_retriesを構成してください。
どのような認証方法がサポートされていますか？
スクリプト用のAPI Key認証と、マルチユーザーアプリケーション用のOAuth 2.0 Client Credentialsです。
このスキルはSDKを含んでいますか？
いいえ、pipまたはpoetryを使用してbenchling-sdkパッケージを別途インストールする必要があります。