Traitez et analysez des données de séquençage ADN avec des outils pour lire les fichiers BAM, VCF et FASTQ. Extrayez les régions génomiques, calculez les statistiques de couverture et intégrez plusieurs types de fichiers pour une analyse complète des variants.

Travaillez avec les structures cristallines et les données de matériaux. Convertissez les formats de fichiers, calculez les diagrammes de phase, analysez la symétrie et accédez à la base de données Materials Project pour la recherche en science des matériaux computationnelle.

Automatisez les workflows de laboratoire en contrôlant les robots de manipulation de liquides, les lecteurs de plaques et les équipements de laboratoire via des commandes Python unifiées. Cette compétence permet des protocoles reproductibles sur les plateformes Hamilton, Tecan et Opentrons avec une simulation intégrée pour les tests.

Les chercheurs ont besoin d'un accès rapide aux propriétés moléculaires et aux structures chimiques. Cette compétence se connecte à la base de données de plus de 110 millions de composés de PubChem pour des requêtes chimio-informatiques instantanées.

Cette compétence fournit une intégration complète avec l'API protocols.io pour gérer les protocoles scientifiques. Utilisez-la pour rechercher des protocoles existants, créer de nouveaux protocoles, gérer des espaces de travail collaboratifs, traiter les discussions et organiser les flux de travail de documentation de laboratoire.

Transformez du contenu de recherche en posters de recherche professionnels en utilisant HTML et CSS avec des visuels générés par l’IA. Exportez en PDF pour l’impression ou convertissez en PowerPoint pour les présentations de conférence.

Cette compétence permet d'effectuer des recherches sur le web alimentées par l'IA pour trouver des informations actuelles, des recherches scientifiques récentes et des réponses fondées avec des citations de sources. Elle offre un accès à plusieurs modèles Perplexity via une seule clé API OpenRouter.

Accéder à la RCSB Protein Data Bank pour rechercher et télécharger des structures 3D de protéines et d'acides nucleiques. Cette compétence permet la recherche en biologie structurale, la découverte de médicaments et l'ingénierie des protéines en fournissant un accès programmatique à plus de 200 000 structures moléculaires déterminées expérimentalement et modélisées par ordinateur.

PathML rationalise les flux de travail en pathologie computationnelle en fournissant des outils unifiés pour charger divers formats de lames, prétraiter les images et entraîner des modèles ML. Les chercheurs peuvent analyser des images de lames entières, construire des graphes tissulaires et quantifier les données d'immunofluorescence multiplex dans un cadre unique.

L'écriture de protocoles d'automatisation de laboratoire nécessite des connaissances spécialisées des API robotiques et des procédures de manipulation de liquides. Cette compétence fournit des modèles prêts à l'emploi et des conseils complets pour créer des protocoles qui contrôlent les robots de manipulation de liquides Opentrons.

Les chercheurs passent des heures à parcourir des bases de données académiques pour trouver des articles pertinents et analyser les tendances de recherche. Cette compétence offre un accès direct à plus de 240 M de travaux scientifiques OpenAlex avec un filtrage puissant, l'analyse des citations et des capacités bibliométriques pour une découverte efficace de la littérature.

Analyser les signaux physiologiques y compris l'ECG, l'EEG, l'EDA et l'EMG pour la recherche et les applications cliniques. NeuroKit2 fournit un toolkit Python unifié pour traiter les données cardiovasculaires, neurales et du système nerveux autonome, avec des outils complets de visualisation et d'analyse.

L'apprentissage automatique moléculaire nécessite la conversion de structures chimiques en représentations numériques. Molfeat fournit plus de 100 featurizers pour transformer les chaînes SMILES en caractéristiques prêtes pour l'apprentissage automatique pour la modélisation QSAR et la découverte de médicaments.

Rechercher et récupérer des données métabolomiques de la base de données NIH Metabolomics Workbench contenant plus de 4 200 études. Accéder aux structures de métabolites, aux métadonnées des études, à la nomenclature RefMet et effectuer des recherches par spectrométrie de masse.

Les données de spectrométrie de masse contiennent des informations spectrales complexes qui nécessitent un traitement spécialisé. Matchms fournit des outils complets pour importer, filtrer et comparer les spectres de masse afin d'identifier les métabolites et analyser les composés.

La conduite manuelle de revues de la littérature gaspille des heures à chercher dans des bases de données et à formater les citations. Cette compétence automatise les revues systématiques de la littérature en cherchant sur PubMed, arXiv, bioRxiv et Semantic Scholar, en vérifiant toutes les citations et en générant des PDF professionnels.

Créer des rapports d'études de marché complets de 50+ pages avec formatage professionnel LaTeX. Générer des visuels stratégiques, effectuer des analyses multi-cadres et produire des livrables de qualité conseil pour les décisions d'affaires.

Gérez des carnets de laboratoire électroniques par programmation. Automatisez les téléversements de données, sauvegardez les carnets et intégrez des outils scientifiques comme Jupyter et REDCap pour les workflows de recherche.

Les chercheurs ont besoin d'un accès efficace aux données bioinformatiques KEGG pour l'analyse des voies et la cartographie des gènes. Cette compétence fournit des fonctions d'assistance Python pour toutes les opérations de l'API REST KEGG, notamment la récupération des voies, la cartographie gènes-voies, la recherche de composés et la conversion d'identifiants entre les bases de données.

Transformez les observations en hypothèses scientifiques structurées et testables. Ce guide vous accompagne dans la synthèse littéraire, le développement de mécanismes, la conception expérimentale et la formulation de prédictions en utilisant des cadres éprouvés de la méthode scientifique.