pylabrobot
Contrôler les robots de laboratoire avec PyLabRobot
Également disponible depuis: davila7
Automatisez les workflows de laboratoire en contrôlant les robots de manipulation de liquides, les lecteurs de plaques et les équipements de laboratoire via des commandes Python unifiées. Cette compétence permet des protocoles reproductibles sur les plateformes Hamilton, Tecan et Opentrons avec une simulation intégrée pour les tests.
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Activez et commencez à utiliser
Tester
Utilisation de "pylabrobot". Set up a PyLabRobot liquid handler to aspirate 50 microliters from well A1 and dispense to well B1
Résultat attendu:
- Initialized STAR backend and STARLetDeck
- Tip rack assigned to deck position 1
- 96-well plate assigned to deck position 10
- Picked up tips from tip_rack[A1]
- Aspirated 50 µL from plate[A1] at 50 µL/s flow rate
- Dispensed 50 µL to plate[B1]
- Tips dropped at waste location
Utilisation de "pylabrobot". Create a deck with a tip rack, source plate, and destination plate for a plate replication workflow
Résultat attendu:
- TIP_CAR_480_A00 defined as tip_rack at deck position 1
- Cos_96_DW_1mL defined as source plate at deck position 10
- Cos_96_DW_1mL defined as dest plate at deck position 15
- Resources assigned to deck with correct rails coordinates
- Deck layout saved to JSON for reproducibility
Audit de sécurité
SûrDocumentation-only skill containing markdown files for PyLabRobot, an open-source laboratory automation framework. All 467 static findings are false positives triggered by Python code examples embedded in markdown documentation. No executable code exists in this skill. The patterns detected (hash references, equipment setup commands, IP addresses, code fences) are all legitimate documentation content for lab automation software.
Facteurs de risque
⚙️ Commandes externes (3)
🌐 Accès réseau (2)
⚡ Contient des scripts (2)
📁 Accès au système de fichiers (1)
🔑 Variables d’environnement (1)
Score de qualité
Ce que vous pouvez construire
Automatiser les tâches de pipetage
Programmez des protocoles complexes de transfert de liquides pour la préparation d'échantillons, les dilutions en série et la réplication de plaques avec suivi automatique des pointes.
Intégration multi-fournisseurs
Créez des protocoles unifiés qui fonctionnent sur les robots Hamilton, Tecan et Opentrons sans réécrire le code pour chaque plateforme.
Simulation de protocoles
Testez et validez les protocoles de laboratoire en mode simulation avant d'exécuter des expériences coûteuses sur du matériel physique.
Essayez ces prompts
Utilisez PyLabRobot pour configurer un manipulateur de liquides avec un backend STAR et transférer 100 microlitres du puits A1 de la plaque source vers le puits A2 de la plaque de destination.
Créez une disposition de pont dans PyLabRobot avec un rack de pointes en position 1, une plaque source en position 5 et une plaque de destination en position 10.
Configurez un lecteur de plaques BMG CLARIOstar avec PyLabRobot, réglez la température à 37 degrés et lisez l'absorbance à une longueur d'onde de 450nm.
Écrivez un protocole complet de manipulation de liquides utilisant ChatterboxBackend pour la simulation, puis montrez comment visualiser l'état du pont et vérifier le workflow.
Bonnes pratiques
- Commencez avec la simulation ChatterboxBackend pour valider les protocoles avant de les exécuter sur du matériel coûteux
- Activez le suivi des pointes et le suivi du volume pour une gestion précise de l'état pendant les expériences
- Enregistrez les dispositions du pont dans des fichiers JSON pour la reproductibilité entre plusieurs exécutions de protocoles
Éviter
- Exécuter des protocoles sur du matériel physique sans les avoir d'abord testés en mode simulation
- Ne pas réglé les températures tôt lors de l'utilisation de shaker chauffants ou d'incubateurs
- Hardcoder les positions des ressources au lieu d'utiliser des noms descriptifs pour une meilleure documentation