adaptyv
Soumettre des séquences protéiques pour validation en laboratoire cloud
Également disponible depuis: davila7
La conception de protéines nécessite une validation expérimentale. Adaptyv fournit un accès API à un laboratoire cloud pour des tests automatisés de l'affinité de liaison, des niveaux d'expression, de la thermostabilité et de l'activité enzymatique. Obtenez des résultats expérimentaux en environ 21 jours.
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Activez et commencez à utiliser
Tester
Utilisation de "adaptyv". Soumettre deux séquences d'anticorps pour des tests de liaison contre la PD-L1
Résultat attendu:
- Expérience soumise avec succès
- ID d'expérience : exp_new123xyz
- Statut : soumis
- Complétion estimée : 2025-02-07
- Cible : PD-L1 humaine
Utilisation de "adaptyv". Quel est le statut de mon expérience de liaison ?
Résultat attendu:
- Expérience : exp_abc123xyz
- Statut : en cours de traitement
- Progression : 65%
- Étape actuelle : test
- Mis à jour : 2025-01-25T14:30:00Z
Utilisation de "adaptyv". Télécharger et résumer les résultats de liaison
Résultat attendu:
- Résultats téléchargés : exp_abc123xyz_results.json
- Séquences testées : 12
- Meilleur lieur : variant_7 (KD : 0,8 nM)
- Confiance : élevée (R-squared : 0,98)
Audit de sécurité
Risque faibleAll 304 static findings are FALSE POSITIVES. The skill is legitimate scientific software for protein research. Scanner patterns triggered on: FASTA format headers (protein sequences in markdown code blocks), API calls to official platform endpoints, environment variable usage for API keys (recommended practice), and scientific notation (e.g., binding affinity values like 1.2e-9). No malicious behavior confirmed.
Facteurs de risque
⚡ Contient des scripts (3)
🌐 Accès réseau (2)
🔑 Variables d’environnement (2)
Score de qualité
Ce que vous pouvez construire
Test d'affinité des anticorps
Soumettre des variants d'anticorps pour mesurer l'affinité de liaison contre les antigènes cibles et identifier les candidats à haute affinité.
Validation de l'optimisation de séquences
Utiliser des outils computationnels pour concevoir des variants de protéines, puis valider expérimentalement les prédictions d'expression et de stabilité.
Dépistage de l'activité catalytique
Dépister des variants d'enzyme pour améliorer le turnover, l'affinité au substrat et la sensibilité aux inhibiteurs.
Essayez ces prompts
Soumettre mes séquences d'anticorps à Adaptyv pour des tests de liaison contre la PD-L1 humaine. Les séquences sont au format FASTA et je souhaite mesurer les valeurs KD.
Vérifier le statut de l'expérience exp_abc123xyz et me dire l'étape actuelle et la date de complétion estimée.
Télécharger les résultats de l'expérience exp_abc123xyz et analyser les mesures de liaison dans un tableau montrant la séquence, KD, kon et les valeurs koff.
Optimiser mes séquences protéiques avec NetSolP et SolubleMPNN, puis soumettre les 50 meilleurs candidats à Adaptyv pour des tests d'expression avec notification webhook.
Bonnes pratiques
- Pré-screening des séquences avec des outils computationnels (NetSolP, ESM) avant la soumission expérimentale pour réduire les coûts
- Utiliser des webhooks plutôt que le polling pour les notifications de complétion d'expériences
- Inclure des séquences de type sauvage ou de référence comme contrôles dans chaque soumission en lot
Éviter
- Soumettre des séquences sans validation - toujours exécuter un dépistage computationnel d'abord
- Faire du polling pour le statut au lieu d'utiliser des webhooks - gaspille le quota API et ajoute des délais
- Ignorer les exigences du format FASTA - valider les séquences localement avant la soumission