get-available-resources
Riesgo bajo 69Detectar recursos del sistema para computación científica
por K-Dense-AI
Las tareas de computación científica necesitan información de hardware para seleccionar estrategias computacionales óptimas. Esta habilidad detecta automáticamente núcleos de CPU, disponibilidad de GPU, memoria y espacio en disco, y luego genera recomendaciones para procesamiento paralelo y aceleración GPU.
geopandas
Seguro 71Trabajar con datos vectoriales geoespaciales
por K-Dense-AI
GeoPandas extiende pandas para operaciones geoespaciales. Permite leer shapefiles, GeoJSON y datos de PostGIS. Realiza uniones espaciales, análisis de buffers, transformaciones de coordenadas y crea mapas coropléticos con integración de matplotlib.
geo-database
Riesgo bajo 66Acceder a datos de expresión génica de NCBI GEO
por K-Dense-AI
Los investigadores necesitan acceso eficiente a conjuntos de datos de expresión génica para su análisis. Esta habilidad permite consultar, descargar y analizar datos de la base de datos GEO de NCBI que contiene millones de muestras genómicas.
geniml
Seguro 71Analizar intervalos genómicos con aprendizaje automático
por K-Dense-AI
Geniml transforma archivos BED en incrustaciones de aprendizaje automático para el análisis de regiones genómicas. Entrena modelos para encontrar patrones en la accesibilidad de cromatina, construye conjuntos de picos de consenso y analiza datos de ATAC-seq de célula única.
generate-image
Seguro 71Generar imágenes IA con FLUX y Gemini
por K-Dense-AI
Crea imágenes de alta calidad para presentaciones, documentos y publicaciones usando modelos de IA. Genera arte original o edita imágenes existentes con simples instrucciones de texto. Accede a los modelos FLUX y Gemini a través de la API de OpenRouter.
gene-database
Riesgo bajo 73Consultar la base de datos de genes del NCBI
por K-Dense-AI
Accede a datos completos de genes del NCBI, incluyendo secuencias, anotaciones e información funcional. Busca por símbolo de gen, ID o contexto biológico para obtener RefSeqs, Gene Ontology, ubicaciones cromosómicas y fenotipos para investigación bioinformática.
fluidsim
Seguro 70Ejecutar simulaciones CFD con FluidSim basado en Python
por K-Dense-AI
FluidSim trae dinámica de fluidos computacional de alto rendimiento a Python. Ejecuta simulaciones de Navier-Stokes, analiza turbulencia y visualiza resultados con simples comandos de Python. No se requiere configuración compleja de Fortran o C++.
flowio
Seguro 69Leer y escribir archivos FCS de citometría de flujo
por K-Dense-AI
Los datos de citometría de flujo requieren manejo especializado de archivos. FlowIO analiza archivos FCS, extrae datos de eventos como arrays de NumPy y permite la conversión a formatos CSV para flujos de análisis posteriores.
fda-database
Seguro 75Consultar bases de datos de medicamentos y dispositivos de la FDA
por K-Dense-AI
Accede a datos regulatorios completos de la FDA, incluyendo eventos adversos de medicamentos, retiros de dispositivos médicos e información de seguridad a través de la API oficial de openFDA. Construye flujos de trabajo de farmacovigilancia e investigación regulatoria con Python.
exploratory-data-analysis
Seguro 80Analizar archivos de datos científicos automáticamente
por K-Dense-AI
Los archivos de datos científicos vienen en cientos de formatos. Esta habilidad detecta automáticamente el tipo de archivo, extrae metadatos, evalúa la calidad de los datos y genera informes completos en markdown con recomendaciones de análisis específicas por formato.
etetoolkit
Seguro 75Analizar árboles filogenéticos con toolkit ETE
por K-Dense-AI
El toolkit ETE simplifica el análisis filogenético para la investigación en biología evolutiva. Procesa datos de árboles, detecta eventos evolutivos y crea visualizaciones listas para publicación.
esm
Seguro 71Generar y diseñar proteínas con ESM
por K-Dense-AI
La ingeniería de proteínas requiere analizar y diseñar secuencias de proteínas novedosas. ESM proporciona modelos de lenguaje de proteínas de última generación para generar secuencias, predecir estructuras y crear incrustaciones para análisis posteriores. Usa ESM3 para tareas generativas en secuencia, estructura y función, o ESM C para aprendizaje de representaciones eficiente.
ensembl-database
Seguro 75Consultar la base de datos genómica Ensembl
por K-Dense-AI
Consulta la API REST de la base de datos genómica Ensembl para datos genómicos de vertebrados. Busca genes, recupera secuencias, analiza variantes con VEP y realiza genómica comparativa en más de 250 especies.
ena-database
Riesgo bajo 66Consultar European Nucleotide Archive
por K-Dense-AI
Los investigadores necesitan acceso eficiente a datos genómicos para análisis. Esta habilidad proporciona acceso programático a ENA a través de APIs REST y FTP para recuperar secuencias de ADN/ARN, archivos FASTQ y ensamblajes de genomas por número de acceso.
drugbank-database
Seguro 77Acceder a la información de la base de datos de medicamentos DrugBank
por K-Dense-AI
DrugBank es una base de datos bioinformática integral que contiene información detallada sobre medicamentos. Esta habilidad permite el acceso programático a las propiedades de los medicamentos, interacciones, objetivos, vías y estructuras químicas para la investigación farmacológica y el descubrimiento de fármacos.
docx
Seguro 70Crear y editar documentos de Word
por K-Dense-AI
Esta habilidad proporciona un conjunto completo de herramientas para operaciones con documentos de Word. Crea nuevos documentos desde cero con JavaScript, edita documentos existentes con Python y gestiona cambios rastreados y comentarios con cumplimiento adecuado de OOXML.
diffdock
Seguro 79Predice poses de unión molecular con acoplamiento IA
por K-Dense-AI
DiffDock utiliza modelos de difusión avanzados para predecir cómo las pequeñas moléculas se unen a las proteínas en el espacio 3D. Los investigadores pueden acelerar el descubrimiento de fármacos generando poses de unión precisas con puntuaciones de confianza para el diseño basado en estructuras.
dnanexus-integration
Seguro 72Integrar flujos de trabajo de la plataforma genómica DNAnexus
por K-Dense-AI
DNAnexus proporciona análisis genómico basado en la nube pero requiere conocimiento específico de la plataforma. Esta skill ofrece documentación completa para construir aplicaciones, gestionar datos y ejecutar flujos de trabajo bioinformáticos.
denario
Riesgo bajo 70Automatiza flujos de trabajo de investigación científica
por K-Dense-AI
Transforma conjuntos de datos en investigación lista para publicación automatizando la generación de hipótesis, el desarrollo de metodologías, los experimentos computacionales y la redacción de artículos en LaTeX. La IA multiagente coordina agentes especializados para canalizaciones de investigación de extremo a extremo.
deeptools
Seguro 79Analizar datos NGS con deepTools
por K-Dense-AI
Procesar y visualizar datos de secuenciación de nueva generación. Convertir BAM a bigWig, generar gráficos de control de calidad y crear mapas de calor listos para publicación para experimentos ChIP-seq, RNA-seq y ATAC-seq.