Histolab automatiza la detección de tejidos y extracción de mosaicos de imágenes de portaobjetos completos de gigapíxeles. Procesa archivos WSI para extraer mosaicos informativos para pipelines de aprendizaje profundo e investigación médica.

Accede a datos exhaustivos de estudios de asociación del genoma completo del Catálogo GWAS de NHGRI-EBI. Busca variantes por ID rs, rasgo o gen para recuperar valores p, tamaños de efecto y estadísticas resumidas para investigación genética.

Procesar y analizar datos de intervalos genómicos para investigación bioinformática. Gtars proporciona herramientas de alto rendimiento para detección de superposiciones, análisis de cobertura y tokenización ML de secuencias genómicas.

gget ofrece acceso unificado a más de 20 bases de datos genómicas mediante una CLI sencilla o una interfaz en Python. Consulta información de genes, recupera secuencias, realiza búsquedas BLAST y ejecuta análisis de enriquecimiento sin gestionar múltiples conexiones API.

Las tareas de computación científica necesitan información de hardware para seleccionar estrategias computacionales óptimas. Esta habilidad detecta automáticamente núcleos de CPU, disponibilidad de GPU, memoria y espacio en disco, y luego genera recomendaciones para procesamiento paralelo y aceleración GPU.

GeoPandas extiende pandas para operaciones geoespaciales. Permite leer shapefiles, GeoJSON y datos de PostGIS. Realiza uniones espaciales, análisis de buffers, transformaciones de coordenadas y crea mapas coropléticos con integración de matplotlib.

Los datos de citometría de flujo requieren manejo especializado de archivos. FlowIO analiza archivos FCS, extrae datos de eventos como arrays de NumPy y permite la conversión a formatos CSV para flujos de análisis posteriores.

Accede a datos regulatorios completos de la FDA, incluyendo eventos adversos de medicamentos, retiros de dispositivos médicos e información de seguridad a través de la API oficial de openFDA. Construye flujos de trabajo de farmacovigilancia e investigación regulatoria con Python.

Los archivos de datos científicos vienen en cientos de formatos. Esta habilidad detecta automáticamente el tipo de archivo, extrae metadatos, evalúa la calidad de los datos y genera informes completos en markdown con recomendaciones de análisis específicas por formato.

DrugBank es una base de datos bioinformática integral que contiene información detallada sobre medicamentos. Esta habilidad permite el acceso programático a las propiedades de los medicamentos, interacciones, objetivos, vías y estructuras químicas para la investigación farmacológica y el descubrimiento de fármacos.

Procesar y visualizar datos de secuenciación de nueva generación. Convertir BAM a bigWig, generar gráficos de control de calidad y crear mapas de calor listos para publicación para experimentos ChIP-seq, RNA-seq y ATAC-seq.

Predice propiedades moleculares como solubilidad, toxicidad y afinidad de unión utilizando DeepChem. Entrena redes neuronales gráficas o usa modelos preentrenados como ChemBERTa para aplicaciones de descubrimiento de fármacos y ciencia de materiales.

Accede a datos estadísticos globales de Data Commons, incluyendo demografía, economía, salud e indicadores ambientales. Consulta cifras de población, PIB, tasas de desempleo y relaciones geográficas usando métodos del cliente Python.

Procesa conjuntos de datos más grandes que la RAM disponible usando computación paralela. Transforma flujos de trabajo de pandas y NumPy de una sola máquina para ejecutarse en múltiples núcleos o clusters distribuidos sin reescribir tu código.

El modelado metabólico requiere conocimientos especializados de métodos de reconstrucción basada en restricciones y análisis. COBRApy proporciona una interfaz Python completa para análisis de balance de flujos, estudios de knockouts de genes y cálculos de envolventes de producción para investigación en biología de sistemas.

Encontrar ensayos clínicos relevantes requiere buscar en una gran base de datos de registros. Esta habilidad proporciona una interfaz Python para consultar la API v2 de ClinicalTrials.gov para buscar ensayos por condición, droga, ubicación o patrocinador y recuperar información detallada del estudio.

La documentación clínica requiere precisión y cumplimiento normativo. Esta skill proporciona plantillas y herramientas de validación para informes de casos, informes diagnósticos, documentación de ensayos clínicos y notas de pacientes siguiendo los estándares HIPAA, FDA e ICH-GCP.

Accede a la base de datos ChEMBL para buscar compuestos por estructura y propiedades. Recupera medidas de bioactividad, encuentra inhibidores y realiza estudios de relación estructura-actividad para investigación en descubrimiento de fármacos.

Accede a datos cinéticos enzimáticos completos de la base de datos de enzimas más grande del mundo. Encuentra valores de Km, ecuaciones de reacción, parámetros específicos de organismos y datos de especificidad de sustrato para investigación bioquímica e ingeniería metabólica.

Consultar más de 40 bases de datos biológicas incluyendo UniProt, KEGG y ChEMBL con una API consistente de Python. Simplifica el análisis entre bases de datos y la conversión de identificadores para investigación bioinformática.