pylabrobot
Controla robots de laboratorio con PyLabRobot
También disponible en: davila7
Automatiza flujos de trabajo de laboratorio controlando robots de manejo de líquidos, lectores de placas y equipos de laboratorio mediante comandos unificados en Python. Esta habilidad permite protocolos reproducibles en las plataformas Hamilton, Tecan y Opentrons, con simulación integrada para pruebas.
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Pruébalo
Usando "pylabrobot". Set up a PyLabRobot liquid handler to aspirate 50 microliters from well A1 and dispense to well B1
Resultado esperado:
- Initialized STAR backend and STARLetDeck
- Tip rack assigned to deck position 1
- 96-well plate assigned to deck position 10
- Picked up tips from tip_rack[A1]
- Aspirated 50 µL from plate[A1] at 50 µL/s flow rate
- Dispensed 50 µL to plate[B1]
- Tips dropped at waste location
Usando "pylabrobot". Create a deck with a tip rack, source plate, and destination plate for a plate replication workflow
Resultado esperado:
- TIP_CAR_480_A00 defined as tip_rack at deck position 1
- Cos_96_DW_1mL defined as source plate at deck position 10
- Cos_96_DW_1mL defined as dest plate at deck position 15
- Resources assigned to deck with correct rails coordinates
- Deck layout saved to JSON for reproducibility
Auditoría de seguridad
SeguroDocumentation-only skill containing markdown files for PyLabRobot, an open-source laboratory automation framework. All 467 static findings are false positives triggered by Python code examples embedded in markdown documentation. No executable code exists in this skill. The patterns detected (hash references, equipment setup commands, IP addresses, code fences) are all legitimate documentation content for lab automation software.
Factores de riesgo
⚙️ Comandos externos (3)
🌐 Acceso a red (2)
⚡ Contiene scripts (2)
📁 Acceso al sistema de archivos (1)
🔑 Variables de entorno (1)
Puntuación de calidad
Lo que puedes crear
Automatizar tareas de pipeteo
Programa protocolos complejos de transferencia de líquidos para preparación de muestras, diluciones seriadas y replicación de placas con seguimiento automático de puntas.
Integración multivendedor
Crea protocolos unificados que funcionen en robots Hamilton, Tecan y Opentrons sin reescribir código para cada plataforma.
Simulación de protocolos
Prueba y valida protocolos de laboratorio en modo de simulación antes de ejecutar experimentos costosos en hardware físico.
Prueba estos prompts
Use PyLabRobot to set up a liquid handler with a STAR backend and transfer 100 microliters from source plate well A1 to destination plate well A2.
Create a deck layout in PyLabRobot with a tip rack at position 1, a source plate at position 5, and a destination plate at position 10.
Configure a BMG CLARIOstar plate reader with PyLabRobot, set temperature to 37 degrees, and read absorbance at 450nm wavelength.
Write a complete liquid handling protocol using ChatterboxBackend for simulation, then show how to visualize the deck state and verify the workflow.
Mejores prácticas
- Comienza con la simulación ChatterboxBackend para validar protocolos antes de ejecutar en hardware costoso
- Habilita el seguimiento de puntas y de volumen para una gestión precisa del estado durante los experimentos
- Guarda los diseños de deck en archivos JSON para la reproducibilidad en múltiples ejecuciones de protocolos
Evitar
- Ejecutar protocolos en hardware físico sin probar primero en modo de simulación
- No establecer temperaturas temprano al usar agitadores con calefacción o incubadoras
- Codificar posiciones de recursos en duro en lugar de usar nombres descriptivos para una mejor documentación
Preguntas frecuentes
¿Qué manipuladores de líquidos admite PyLabRobot?
¿Necesito hardware físico para probar protocolos?
¿Cómo se compara PyLabRobot con las API de los proveedores?
¿Puedo guardar y cargar configuraciones de deck?
¿Qué lectores de placas son compatibles?
¿Esta habilidad funciona en Windows y Mac?
Detalles del desarrollador
Autor
K-Dense-AILicencia
MIT license
Repositorio
https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/pylabrobotRef.
main
Estructura de archivos