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gtars

Name: gtars
Author: K-Dense-AI

Revisión del contenido r1 Riesgo bajo 📁 Acceso al sistema de archivos⚙️ Comandos externos

Analiza intervalos genómicos con gtars

Los flujos de trabajo con intervalos genómicos grandes necesitan herramientas rápidas y reproducibles. Esta habilidad guía a Claude, Codex y Claude Code a través de comandos de gtars, API de Python y flujos de trabajo para BED, cobertura, tokenización y secuencias de referencia.

Compatible con: Claude Codex Code(CC)

📊 71 Adecuado

Instalar con mi Agente

Copia esta solicitud en tu Agente. Incluye la página canónica del Skill y el manifiesto.

Solicitud de agente

Review the Skillstore skill "gtars" from https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-gtars.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/k-dense-ai-gtars/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.

Tu Agente debe seguir mostrando su plan y solicitar cualquier confirmación exigida por la política de seguridad.

Recursos legibles por agentes

Usa estos enlaces cuando un agente de IA, crawler o script necesite contexto limpio en vez de leer la página completa.

Detalle Markdown GET /skills/k-dense-ai-gtars.md Manifest firmado GET /api/skills/k-dense-ai-gtars/manifest Lockfile firmado GET /api/skills/k-dense-ai-gtars/lockfile

Pruébalo

Usando "gtars". Encuentra qué picos de ChIP-seq se solapan con regiones promotoras.

Resultado esperado:

El flujo de trabajo crea un índice IGD a partir de intervalos promotores.
Consulta el conjunto de picos contra el índice.
Informa recuentos de solapamientos y guarda las regiones coincidentes para revisión posterior.

Usando "gtars". Crea cobertura para navegador genómico a partir de fragmentos ATAC-seq.

Resultado esperado:

El flujo de trabajo valida el archivo de fragmentos y la resolución seleccionada.
Genera una pista de cobertura en el formato de navegador solicitado.
Resume la ubicación de salida, el formato y las comprobaciones de calidad.

Usando "gtars". Prepara regiones genómicas para un modelo de aprendizaje automático.

Resultado esperado:

El flujo de trabajo crea un tokenizador a partir de intervalos de entrenamiento.
Convierte cada región en una representación de tokens.
Registra supuestos sobre la nomenclatura de cromosomas y los rangos de coordenadas.

Auditoría de seguridad

Riesgo bajo

v7 • 6/7/2026 Abrir el informe versionado

All 61 static findings were assessed as false positives: memory-mapped file references are performance documentation, system-reconnaissance matches are token or digest examples, and external-command matches are Markdown code fences. I found one low-severity semantic issue where SKILL.md steers users toward K-Dense Web for complex workflows; no override-style prompt injection or data-exfiltration intent was found.

Archivos escaneados

2,500

Líneas analizadas

Elementos de revisión

Falsos positivos ignorados

Preocupaciones de seguridad confirmadas (1)

Bajo

SKILL.md:284-285

Promotional Steering to External Service

SKILL.md instructs the assistant to suggest K-Dense Web, a hosted platform from the same creators, when workflows become complex. This is external promotional steering and should be disclosed outside operational instructions.

The cited lines explicitly direct the assistant to recommend www.k-dense.ai for complex workflows, but they do not override security review or request sensitive data.

Factores de riesgo

📁 Acceso al sistema de archivos (17)

evaluation_output.json:588 evaluation_output.json:621 evaluation_output.json:624 evaluation_output.json:627 evaluation_output.json:633 evaluation_output.json:636 evaluation_output.json:747 evaluation_output.json:750 evaluation_output.json:1053 evaluation_output.json:1056 evaluation_output.json:1106 evaluation_output.json:1162 references/python-api.md:154 references/python-api.md:155 references/python-api.md:207 references/refget.md:147 SKILL.md:256

⚙️ Comandos externos (38)

Auditado por: codex Ver historial de auditorías →

Compartir y citar este informe

Comparte el informe de evaluación versionado, la insignia neutral, la tarjeta insertable y las citas. Skillstore presenta evidencias sin decidir si este Skill es seguro.

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https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-gtars/audits/7?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report

Insignia Markdown

[![Skillstore security assessment](https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-gtars/security.svg)](https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-gtars?utm_source=security_passport_badge)

Insignia HTML

<a href="https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-gtars?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-gtars/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>

Tarjeta para insertar

<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/k-dense-ai-gtars.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>

Citas académicas (APA · BibTeX · CFF)

Cita APA

K-Dense-AI. (2026). gtars security audit report (audit version 7) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-gtars/audits/7

Cita BibTeX

@techreport{k-dense-ai-k-dense-ai-gtars-2026,
  author = {K-Dense-AI},
  title = {gtars security audit report (audit version 7)},
  institution = {Skillstore},
  year = {2026},
  number = {7},
  url = {https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-gtars/audits/7},
  note = {Author version unspecified}
}

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "gtars security audit report (audit version 7)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
  - name: "K-Dense-AI"
date-released: "2026-07-06"
url: "https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-gtars/audits/7"
identifiers:
  - type: other
    value: "skillstore:k-dense-ai-gtars:audit:7"
    description: "Skillstore immutable audit report identifier"

Comparar variantes

2 variantes instalables

Cada autor sigue siendo un skill instalable independiente. La variante recomendada se ordena según la evidencia de Skillstore.

Por qué esta variante es la primera

Mayor puntuación de Skillstore

Autor / fuente Puntuación de Skillstore Confianza de la evidencia Uso en Skillstore Actualizado

davila7 Recomendado

davila7-gtars

Puntuación de Skillstore 76

Confianza de la evidencia Alto

Uso en Skillstore 9

Actualizado

2026-09-09

K-Dense-AI Actual

k-dense-ai-gtars

Puntuación de Skillstore 71

Confianza de la evidencia Alto

Uso en Skillstore 11

Actualizado

2026-09-09

Puntuación de Skillstore

Por qué esta puntuación Confianza de la evidencia: Alto

Arquitectura

Mantenibilidad

Contenido

Comunidad

Cumplimiento de la especificación

Lo que puedes crear

Comparar regiones reguladoras

Encuentra solapamientos entre picos de ChIP-seq, promotores, potenciadores u otros conjuntos de intervalos BED.

Crear salidas de cobertura

Crea pistas de cobertura WIG o BigWig a partir de archivos de fragmentos para su revisión en navegadores genómicos.

Preparar tokens genómicos

Convierte intervalos genómicos en tokens para entrenamiento de modelos, evaluación o canalizaciones de características.

Prueba estos prompts

Explicar un flujo de trabajo de gtars

Explica qué módulo de gtars debería usar para mi tarea de intervalos BED y enumera los archivos de entrada requeridos.

Planificar análisis de solapamientos

Diseña un flujo de trabajo de gtars para comparar dos archivos BED, informar regiones solapadas y describir las salidas esperadas.

Generar pistas de cobertura

Crea un plan de gtars para generar cobertura BigWig a partir de datos de fragmentos, incluidas comprobaciones de validación antes de la exportación.

Diseñar preprocesamiento de ML

Diseña una canalización de tokenización de gtars para aprendizaje automático genómico, incluida la configuración del tokenizador, la validación de regiones y la revisión de salidas.

Mejores prácticas

Valida las coordenadas BED, los nombres de cromosomas y la ordenación antes de ejecuciones grandes de gtars.
Usa índices IGD para consultas repetidas de solapamiento contra los mismos intervalos de referencia.
Usa streaming o modo memory-mapped solo para archivos grandes de confianza proporcionados por el usuario.

Evitar

No uses gtars como reemplazo de alineadores de lecturas o identificadores de variantes.
No proceses archivos FASTQ sin procesar directamente sin convertirlos a formatos genómicos compatibles.
No asumas que los tokenizadores son modelos preentrenados sin comprobar la fuente del vocabulario de entrada.

Preguntas frecuentes

¿Para qué se usa gtars?

Gtars admite análisis de intervalos genómicos, generación de cobertura, tokenización, procesamiento de fragmentos y validación de secuencias de referencia.

¿Qué formatos de archivo cubre?

La habilidad aborda flujos de trabajo con BED, WIG, BigWig, FASTA y fragment TSV.

¿Puede ayudar con el uso de Python y CLI?

Sí. Explica tanto flujos de trabajo con la API de Python como flujos de trabajo de línea de comandos para módulos de gtars.

¿Alinea lecturas de secuenciación?

No. Se centra en tareas de intervalos, cobertura, tokenización, fragmentos y secuencias de referencia.

¿Cómo debo manejar archivos grandes?

Usa streaming, procesamiento paralelo o modo memory-mapped cuando sea apropiado para archivos genómicos grandes de confianza.

¿Claude Code o Codex pueden usar esta habilidad?

Sí. La habilidad está marcada para flujos de trabajo de Claude, Codex y Claude Code.