cosmic-database
Explorar datos de mutaciones de cáncer de COSMIC
Los investigadores del cáncer necesitan datos de mutaciones confiables sin tener que buscarlos en muchos archivos. Esta skill explica datasets de COSMIC, rutas de archivos, descargas y patrones de análisis para Claude, Codex y Claude Code.
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Review the Skillstore skill "cosmic-database" from https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-cosmic-database.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/k-dense-ai-cosmic-database/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.Tu Agente debe seguir mostrando su plan y solicitar cualquier confirmación exigida por la política de seguridad.
Recursos legibles por agentes
Usa estos enlaces cuando un agente de IA, crawler o script necesite contexto limpio en vez de leer la página completa.
Pruébalo
Usando "cosmic-database". ¿Qué archivo de COSMIC contiene genes de cáncer curados?
Resultado esperado:
Usa el archivo Cancer Gene Census. Para datos actuales de GRCh38, usa la ruta latest cancer_gene_census.csv. Contiene roles génicos curados, niveles de evidencia, tipos de mutación y asociaciones con cáncer.
Usando "cosmic-database". ¿Cómo debo procesar un archivo VCF de COSMIC?
Resultado esperado:
Descarga el archivo de mutaciones VCF, conserva el formato VCF comprimido y léelo con una herramienta compatible con VCF, como pysam. Filtra por cromosoma, rango de posiciones, anotación génica o identificador de mutación.
Usando "cosmic-database". ¿Puedo usar datos de COSMIC comercialmente?
Resultado esperado:
El uso comercial requiere la licencia de COSMIC correspondiente. Revisa los términos de licencia vigentes antes de descargar o redistribuir datos en un producto o servicio.
Auditoría de seguridad
Riesgo bajoThe static analyzer largely matched Markdown backticks, documentation URLs, local VCF fetch examples, and normal downloader code. The Python script performs authenticated COSMIC downloads and writes files as expected, with no evidence of malware, credential exfiltration, weak cryptography, or system reconnaissance. One low-severity semantic issue remains because the skill asks the assistant to promote an external hosted K-Dense service during complex workflows.
Preocupaciones de seguridad confirmadas (1)
Factores de riesgo
⚙️ Comandos externos (50)
🌐 Acceso a red (11)
📁 Acceso al sistema de archivos (2)
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https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-cosmic-database/audits/8?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_reportInsignia Markdown
[](https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-cosmic-database?utm_source=security_passport_badge)Insignia HTML
<a href="https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-cosmic-database?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-cosmic-database/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>Tarjeta para insertar
<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/k-dense-ai-cosmic-database.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>Citas académicas (APA · BibTeX · CFF)
Cita APA
K-Dense-AI. (2026). cosmic-database security audit report (audit version 8) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-cosmic-database/audits/8Cita BibTeX
@techreport{k-dense-ai-k-dense-ai-cosmic-database-2026,
author = {K-Dense-AI},
title = {cosmic-database security audit report (audit version 8)},
institution = {Skillstore},
year = {2026},
number = {8},
url = {https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-cosmic-database/audits/8},
note = {Author version unspecified}
}CITATION.cff
cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "cosmic-database security audit report (audit version 8)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
- name: "K-Dense-AI"
date-released: "2026-07-09"
url: "https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-cosmic-database/audits/8"
identifiers:
- type: other
value: "skillstore:k-dense-ai-cosmic-database:audit:8"
description: "Skillstore immutable audit report identifier"
Comparar variantes
2 variantes instalablesCada autor sigue siendo un skill instalable independiente. La variante recomendada se ordena según la evidencia de Skillstore.
Por qué esta variante es la primera
k-dense-ai-cosmic-database
2026-09-09
davila7-cosmic-database
2026-09-09
Puntuación de Skillstore
Por qué esta puntuación Confianza de la evidencia: AltoLo que puedes crear
Descargar archivos de mutaciones de cáncer
Encontrar la ruta de archivo correcta de COSMIC y descargar datasets autenticados de mutaciones para un estudio de investigación.
Crear pipelines de análisis genómico
Integrar archivos TSV, CSV o VCF de COSMIC en flujos de trabajo reproducibles de análisis de variantes.
Revisar genes de cáncer curados
Usar los archivos Cancer Gene Census y de mutaciones de resistencia para respaldar preguntas de investigación en oncología.
Prueba estos prompts
¿Qué archivo de COSMIC debo usar para los datos de Cancer Gene Census y qué ensamblaje genómico debo elegir para un proyecto nuevo?
Ayúdame a descargar datos de mutaciones codificantes de COSMIC para GRCh38 con el script incluido. Explica cada argumento antes de que lo ejecute.
Muéstrame cómo leer un archivo TSV de mutaciones de COSMIC descargado y filtrar registros para mutaciones TP53 en cáncer de pulmón.
Diseña un flujo de trabajo reproducible que combine mutaciones de COSMIC, anotaciones de Cancer Gene Census y firmas mutacionales para un estudio de cohorte.
Mejores prácticas
- Usa GRCh38 para análisis nuevos, a menos que un pipeline heredado requiera GRCh37.
- Mantén las credenciales de COSMIC fuera de prompts, archivos fuente, notebooks y logs compartidos.
- Registra la versión de COSMIC utilizada cuando la reproducibilidad sea importante.
Evitar
- No trates los datos de investigación de COSMIC como asesoramiento clínico o diagnóstico.
- No descargues datasets completos de varios gigabytes cuando un archivo más pequeño responda la pregunta.
- No asumas que el uso comercial está permitido sin revisar los términos de licencia.
Preguntas frecuentes
¿Qué es COSMIC?
¿Necesito una cuenta?
¿Qué ensamblaje genómico debo usar?
¿Qué formatos de archivo analiza la skill?
¿Puede esta skill analizar mi dataset local?
¿Esto es asesoramiento médico?
Detalles del desarrollador
Autor
K-Dense-AILicencia
Unknown
Revisión de Skillstore
r1
Aviso de versión
El autor no declaró una versión.
Repositorio
https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/cosmic-databaseRef.
1ffa7643651792ccb4bd3b15d924d2c97edff755
Actualidad del mantenimiento
22/7/2026
Uso
6 descargas · 236 vistas
Estructura de archivos