Das ETE-Toolkit vereinfacht phylogenetische Analysen für die Evolutionsbiologie-Forschung. Verarbeiten Sie Baumdaten, erkennen Sie evolutionäre Ereignisse und erstellen Sie publikationsreife Visualisierungen.

Protein-Engineering erfordert die Analyse und das Design neuartiger Proteinsequenzen. ESM bietet hochmoderne Protein-Sprachmodelle für die Generierung von Sequenzen, Vorhersage von Strukturen und Erstellung von Embeddings für die nachgelagerte Analyse. Verwende ESM3 für generative Aufgaben über Sequenz, Struktur und Funktion, oder ESM C für effizientes Repräsentationslernen.

Fragen Sie die Ensembl-Genomdatenbank-REST-API für Wirbeltier-Genomdaten ab. Suchen Sie Gene ab, rufen Sie Sequenzen ab, analysieren Sie Varianten mit VEP und führen Sie vergleichende Genomik über 250+ Arten durch.

Forscher benötigen effizienten Zugang zu Genomdaten für Analysen. Dieser Skill bietet programmatischen Zugang zu ENA über REST-APIs und FTP für den Abruf von DNA/RNA-Sequenzen, FASTQ-Dateien und Genomassemblies nach Zugangsnummer.

DrugBank ist eine umfassende Bioinformatik-Datenbank mit detaillierten Arzneimittelinformationen. Diese Fähigkeit ermöglicht programmatischen Zugang zu Arzneimitteleigenschaften, Interaktionen, Zielen, Wegen und chemischen Strukturen für Pharmakologieforschung und Arzneimittelentdeckung.

Dieses Skill bietet ein komplettes Toolkit für Word-Dokumentoperationen. Erstellen Sie neue Dokumente von Grund auf mit JavaScript, bearbeiten Sie bestehende Dokumente mit Python, und verwalten Sie Änderungsverfolgungen und Kommentare mit korrekter OOXML-Konformität.

DNAnexus bietet cloudbasierte Genomik-Analysen, erfordert jedoch plattformspezifisches Wissen. Diese Skill bietet vollständige Dokumentation zum Erstellen von Apps, Verwalten von Daten und Ausführen von Bioinformatik-Workflows.

DiffDock verwendet fortschrittliche Diffusionsmodelle, um vorherzusagen, wie kleine Moleküle an Proteine im 3D-Raum binden. Forscher können die Arzneimittelentwicklung beschleunigen, indem sie genaue Bindungsposen mit Konfidenzwerten für das strukturbasierte Arzneimitteldesign generieren.

Transformieren Sie Datensätze in publikationsreife Forschung durch die Automatisierung von Hypothesengenerierung, Methodenentwicklung, Rechenexperimenten und LaTeX-Papiererstellung. Multi-Agent-KI koordiniert spezialisierte Agenten für End-to-End-Forschungspipelines.

Next-Generation-Sequencing-Daten verarbeiten und visualisieren. BAM in bigWig konvertieren, Qualitätskontrolldiagramme erstellen und publikationsreife Heatmaps für ChIP-seq-, RNA-seq- und ATAC-seq-Experimente generieren.

Molekulare Eigenschaften wie Löslichkeit, Toxizität und Bindungsaffinität mit DeepChem vorhersagen. Graphische neuronale Netze trainieren oder vortrainierte Modelle wie ChemBERTa für Arzneimittelforschung und Materialwissenschaften nutzen.

Verarbeiten Sie chemische Daten effizient mit einer pythonischen Schnittstelle zu RDKit. Datamol vereinfacht komplexe Cheminformatik-Operationen und bleibt dabei vollständig kompatibel mit dem RDKit-Ökosystem.

Greifen Sie auf globale statistische Daten von Data Commons zu, einschließlich Demografie, Wirtschaft, Gesundheit und Umweltindikatoren. Fragen Sie Bevölkerungszahlen, BIP, Arbeitslosenquoten und geografische Beziehungen mit Python-Client-Methoden ab.

Verarbeiten Sie Datensätze, die größer als der verfügbare RAM sind, mit paralleler Computing. Transformieren Sie Single-Machine-pandas- und NumPy-Workflows, um sie auf mehreren Kernen oder verteilten Clustern auszuführen, ohne Ihren Code umzuschreiben.

Krebsforscher benötigen umfassende Mutationsdaten für Studien. Diese Fähigkeit bietet programmatischen Zugriff auf die COSMIC-Datenbank mit Millionen von somatischen Mutationen, kuratierten Krebsgenlisten und Mutationssignaturen für die Präzisionsonkologie-Forschung.

Die metabolische Modellierung erfordert spezialisiertes Wissen über Constraint-basierte Rekonstruktions- und Analysemethoden. COBRApy bietet eine umfassende Python-Schnittstelle für Flussbilanzenanalyse, Gen-Knockout-Studien und Produktionsberechnungen für die Systembiologie-Forschung.

ClinVar enthält wichtige Variantenklassifikationen für die klinische Genetik, aber der Zugriff auf und die Interpretation dieser Daten erfordert spezialisiertes Wissen. Diese Fähigkeit bietet umfassende Anleitungen für die Abfrage von ClinVar über Webinterface, API oder FTP-Downloads mit detaillierten Interpretationsrichtlinien für klinische Signifikanzklassifikationen.

Greifen Sie auf ClinPGx zu, um Pharmakogenomik-Daten abzurufen, einschließlich Gen-Wirkstoff-Interaktionen, CPIC-Richtlinien und Allelfunktionsinformationen. Dieser Skill unterstützt präzise Medizin, indem er klinische Entscheidungsunterstützung für die genotypgeführte Medikamentendosierung bereitstellt.

Das Auffinden relevanter klinischer Studien erfordert die Suche in einer großen Registrierungsdatenbank. Diese Skill bietet eine Python-Schnittstelle zur Abfrage der ClinicalTrials.gov API v2, um Studien nach Erkrankung, Medikament, Standort oder Sponsor zu durchsuchen und detaillierte Studieninformationen abzurufen.

Klinische Dokumentation erfordert Präzision und regulatorische Compliance. Diese Skill bietet Vorlagen und Validierungstools für Fallberichte, Diagnoseberichte, klinische Prüfungsdokumentation und Patientennotizen gemäß HIPAA-, FDA- und ICH-GCP-Standards.