chembl-database
Fragen Sie die ChEMBL-Datenbank nach bioaktiven Molekülen und Arzneimittelentwicklungsdaten ab
Auch verfügbar von: davila7
Greifen Sie auf die ChEMBL-Datenbank zu, um Verbindungen nach Struktur und Eigenschaften zu durchsuchen. Rufen Sie Bioaktivitätsmessungen ab, finden Sie Inhibitoren und führen Sie Struktur-Aktivitäts-Beziehungsstudien für die Arzneimittelentwicklungsforschung durch.
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Einschalten und loslegen
Teste es
Verwendung von "chembl-database". Holen Sie sich Informationen über Aspirin von ChEMBL
Erwartetes Ergebnis:
- ChEMBL-ID: CHEMBL25
- Bevorzugter Name: ASPIRIN
- Molekulargewicht: 180,16 g/mol
- LogP: 1,19
- Arzneimitteltyp: Kleines Molekül
- Erste Zulassung: 1930
Verwendung von "chembl-database". Finden Sie Kinasen-Inhibitoren mit IC50 unter 100 nM
Erwartetes Ergebnis:
- 247 Kinasen-Inhibitoren mit IC50 < 100 nM abgerufen
- Top-Treffer umfassen zugelassene Arzneimittel wie Imatinib, Gefitinib und Erlotinib
- Ergebnisse nach Potenz sortiert (niedrigster IC50 zuerst)
Verwendung von "chembl-database". Finden Sie Verbindungen, die Koffein ähnlich sind
Erwartetes Ergebnis:
- 156 Verbindungen gefunden, die Koffein ähnlich sind (>80% Ähnlichkeit)
- Ähnlichste: Theobromin (96%), Theophyllin (94%)
- Enthält natürliche Xanthinderivate und synthetische Analoga
Sicherheitsaudit
SicherAll 198 static findings are FALSE POSITIVES. The analyzer misidentified markdown code formatting (backticks) as shell command execution, SMILES chemical notation as shell operators, and documentation URLs as network endpoints. This is a legitimate scientific database integration skill containing only documentation for the ChEMBL Web Resource Client library. The Python example file contains only wrapper functions that call the official chembl_webresource_client library. No executable malicious code or dangerous functionality exists.
Risikofaktoren
⚙️ Externe Befehle (155)
Qualitätsbewertung
Was du bauen kannst
Inhibitoren für Arzneimittelziele finden
Suchen Sie nach potenten Inhibitoren für spezifische Ziele wie EGFR oder Kinasen, indem Sie Bioaktivitätsmessungen abfragen.
Arzneimittel-Ziel-Interaktionen analysieren
Rufen Sie Arzneimittelmechanismen, Indikationen und Aktivitätsprofile ab, um Verbindungs-Ziel-Beziehungen zu verstehen.
Struktur-Aktivitäts-Beziehungsstudien
Finden Sie ähnliche Verbindungen und analysieren Sie molekulare Eigenschaften, um Struktur-Aktivitäts-Muster zu identifizieren.
Probiere diese Prompts
Holen Sie sich Informationen über Molekül CHEMBL25 (Aspirin) von ChEMBL
Finden Sie alle Moleküle mit einem Molekulargewicht unter 500, LogP unter 5 und höchstens 10 Wasserstoffbrückenakzeptoren
Finden Sie alle EGFR-Inhibitoren mit IC50-Werten unter 100 nM
Finden Sie Verbindungen, die Aspirin ähnlich sind (CC(=O)Oc1ccccc1C(=O)O) mit 85 Prozent Ähnlichkeit
Bewährte Verfahren
- Verwenden Sie Caching, um Rate Limits bei wiederholten Abfragen zu respektieren
- Wenden Sie Molekulargewicht- und LogP-Filter früh an, um Ergebnismengen zu reduzieren
- Prüfen Sie immer das data_validity_comment-Feld auf mögliche Probleme
Vermeiden
- Schnelle aufeinanderfolgende Anfragen ohne Respektierung von Rate Limits
- Ignorieren der pchembl_value-Normalisierung beim Vergleich von Aktivitäten
- Annehmen, dass alle Verbindungen in ChEMBL experimentell verifiziert sind
Häufig gestellte Fragen
Was ist ChEMBL?
Benötigt diese Skill API-Schlüssel?
Welche Aktivitätswerte sind verfügbar?
Kann ich nach chemischer Struktur suchen?
Wie werden Ergebnisse zurückgegeben?
Welche guten Eigenschaftsfilter gibt es für Arzneimittelähnlichkeit?
Entwicklerdetails
Autor
K-Dense-AILizenz
MIT
Repository
https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/chembl-databaseRef
main
Dateistruktur