adaptyv
Proteinsequenzen zur Cloud-Laborvalidierung einreichen
Auch verfügbar von: davila7
Protein-Design erfordert experimentelle Validierung. Adaptyv bietet API-Zugang zu einem Cloud-Labor für automatisierte Tests von Bindungsaffinität, Expressionsniveaus, Thermostabilität und Enzymaktivität. Erhalten Sie experimentelle Ergebnisse in ca. 21 Tagen.
Die Skill-ZIP herunterladen
In Claude hochladen
Gehe zu Einstellungen → Fähigkeiten → Skills → Skill hochladen
Einschalten und loslegen
Teste es
Verwendung von "adaptyv". Reiche zwei Antikörpersequenzen für Bindungstests gegen PD-L1 ein
Erwartetes Ergebnis:
- Experiment erfolgreich eingereicht
- Experiment-ID: exp_new123xyz
- Status: eingereicht
- Geschätzte Fertigstellung: 2025-02-07
- Ziel: Menschliches PD-L1
Verwendung von "adaptyv". Wie ist der Status meines Bindungsexperiments?
Erwartetes Ergebnis:
- Experiment: exp_abc123xyz
- Status: in Bearbeitung
- Fortschritt: 65%
- Aktuelle Phase: Test
- Aktualisiert: 2025-01-25T14:30:00Z
Verwendung von "adaptyv". Lade die Bindungsergebnisse herunter und fasse sie zusammen
Erwartetes Ergebnis:
- Ergebnisse heruntergeladen: exp_abc123xyz_results.json
- Getestete Sequenzen: 12
- Stärkster Binder: variant_7 (KD: 0.8 nM)
- Vertrauen: hoch (R-Quadrat: 0.98)
Sicherheitsaudit
Niedriges RisikoAll 304 static findings are FALSE POSITIVES. The skill is legitimate scientific software for protein research. Scanner patterns triggered on: FASTA format headers (protein sequences in markdown code blocks), API calls to official platform endpoints, environment variable usage for API keys (recommended practice), and scientific notation (e.g., binding affinity values like 1.2e-9). No malicious behavior confirmed.
Risikofaktoren
⚡ Enthält Skripte (3)
🌐 Netzwerkzugriff (2)
🔑 Umgebungsvariablen (2)
Qualitätsbewertung
Was du bauen kannst
Antikörper-Affinitätstest
Antikörper-Varianten einreichen, um Bindungsaffinität gegen Zielantigene zu messen und hochaffine Kandidaten zu identifizieren.
Sequenzoptimierungsvalidierung
Computewerkzeuge verwenden, um Protein-Varianten zu entwerfen, dann Expressions- und Stabilitätsvorhersagen experimentell validieren.
Katalytische Aktivitäts-Screening
Enzym-Varianten auf verbesserten Umsatz, Substrataffinität und Inhibitorempfindlichkeit untersuchen.
Probiere diese Prompts
Reiche meine Antikörpersequenzen bei Adaptyv für Bindungstests gegen menschliches PD-L1 ein. Die Sequenzen sind im FASTA-Format und ich möchte KD-Werte messen.
Prüfe den Status von Experiment exp_abc123xyz und teile mir die aktuelle Phase und das geschätzte Fertigstellungsdatum mit.
Lade die Ergebnisse von Experiment exp_abc123xyz herunter und parse die Bindungsmessungen in eine Tabelle mit Sequenz, KD, kon und koff-Werten.
Optimiere meine Proteinsequenzen mit NetSolP und SolubleMPNN und reiche dann die besten 50 Kandidaten bei Adaptyv für Expressionstests mit Webhook-Benachrichtigung ein.
Bewährte Verfahren
- Sequenzen vor der experimentellen Einreichung mit Computewerkzeugen (NetSolP, ESM) vorscreenen, um Kosten zu reduzieren
- Webhooks statt Polling für Experimentabschluss-Benachrichtigungen verwenden
- Wildtyp- oder Referenzsequenzen als Kontrollen in jeder Chargeneinreichung einschließen
Vermeiden
- Sequenzen ohne Validierung einreichen - immer zuerst computergestütztes Screening durchführen
- Polling auf Status statt Webhooks verwenden - verschwendet API-Kontingent und verursacht Verzögerungen
- FASTA-Formatanforderungen ignorieren - Sequenzen lokal vor Einreichung validieren
Häufig gestellte Fragen
Wie lange dauert es, Ergebnisse zu erhalten?
Wie erhalte ich API-Zugang?
Welche Experimenttypen werden unterstützt?
Kann ich gegen benutzerdefinierte Ziele testen?
Wie viele Sequenzen kann ich einreichen?
Wie werden Ergebnisse geliefert?
Entwicklerdetails
Autor
K-Dense-AILizenz
MIT
Repository
https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/adaptyvRef
main
Dateistruktur