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biogeobears

Name: biogeobears
Author: brunoasm

Inhaltsrevision r2 Sicher 📁 Dateisystemzugriff⚙️ Externe Befehle🌐 Netzwerkzugriff

BioGeoBEARS-Biogeografieanalysen ausführen

Phylogenetische Biogeografie-Workflows können schwer zu formatieren und zu reproduzieren sein. Diese Skill validiert Eingaben, bereitet BioGeoBEARS-Skripte vor und unterstützt den Modellvergleich in R.

Unterstützt: Claude Codex Code(CC)

🥇 83 Gold

Mit meinem Agent installieren

Kopieren Sie diese Anfrage in Ihren Agent. Sie enthält die maßgebliche Skill-Seite und das Manifest.

Agent-Anfrage

Review the Skillstore skill "biogeobears" from https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/brunoasm-biogeobears/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.

Ihr Agent sollte weiterhin seinen Plan anzeigen und alle von der Sicherheitsrichtlinie verlangten Bestätigungen anfordern.

Agent-lesbare Ressourcen

Verwenden Sie diese Links, wenn ein KI-Agent, Crawler oder Skript sauberen Kontext benötigt, statt die vollständige Seite zu lesen.

Markdown-Detailseite GET /skills/brunoasm-biogeobears.md Signiertes manifest GET /api/skills/brunoasm-biogeobears/manifest Signiertes lockfile GET /api/skills/brunoasm-biogeobears/lockfile

Testen

„biogeobears“ wird verwendet. Ein Forscher stellt einen rooted tree und eine species-by-region-Verbreitungstabelle bereit.

Erwartetes Ergebnis:

Die Skill validiert Artnamen und Geografie-Kodierung.
Sie bereitet einen Projektordner mit Eingaben, einer RMarkdown-Analyse, Ergebnispfaden und einem README vor.
Sie erklärt, wie die Analyse ausgeführt und der HTML-Bericht geprüft wird.

„biogeobears“ wird verwendet. Ein Benutzer fragt, welches Modell die Verbreitung von Inselvögeln am besten erklärt.

Erwartetes Ergebnis:

Die Skill empfiehlt, DEC, DIVALIKE, BAYAREALIKE und +J-Varianten zu vergleichen.
Sie bereitet Modellvergleichstabellen mit AIC, AICc und likelihood ratio tests vor.
Sie beschreibt, wie Schätzungen zu dispersal, extinction und founder events interpretiert werden.

Sicherheitsaudit

Sicher

v8 • 23.7.2026 Versionsbericht öffnen

All 110 static findings were adjudicated as false positives. Most detections are Markdown or RMarkdown backticks and intentional relative paths within the generated analysis directory. The explicit file write uses a user-selected output path, with no hidden network access, reconnaissance, or untrusted command evaluation.

Gescannte Dateien

1,868

Analysierte Zeilen

Prüfelemente

Falschmeldungen ignoriert

Risikofaktoren

📁 Dateisystemzugriff (12)

README.md:222 scripts/validate_geography_file.py:180 SKILL.md:181 SKILL.md:182 SKILL.md:185 SKILL.md:187 SKILL.md:199 SKILL.md:200 SKILL.md:203 SKILL.md:204 SKILL.md:243 SKILL.md:332

⚙️ Externe Befehle (50)

🌐 Netzwerkzugriff (1)

SKILL.md:557

Das letzte abgeschlossene statische und semantische Audit erkannte keine bestätigten Sicherheitsbefunde. Dies beweist nicht, dass der Skill keine Nebenwirkungen hat.

Geprüft von: codex Audit-Verlauf anzeigen →

Diesen Bericht teilen & zitieren

Teile den versionierten Bewertungsbericht, das neutrale Badge, die Einbettungskarte und Zitate. Skillstore berichtet Nachweise, ohne zu entscheiden, ob dieser Skill sicher ist.

Versionsbericht öffnen

Berichtslink kopieren

https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears/audits/8?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report

Markdown-Badge

[![Skillstore security assessment](https://skillstore.io/badges/skills/brunoasm-biogeobears/security.svg)](https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears?utm_source=security_passport_badge)

HTML-Badge

<a href="https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/brunoasm-biogeobears/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>

Einbettungskarte

<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/brunoasm-biogeobears.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>

Wissenschaftliche Zitate (APA · BibTeX · CFF)

APA-Zitat

brunoasm. (2026). biogeobears security audit report (audit version 8) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears/audits/8

BibTeX-Zitat

@techreport{brunoasm-brunoasm-biogeobears-2026,
  author = {brunoasm},
  title = {biogeobears security audit report (audit version 8)},
  institution = {Skillstore},
  year = {2026},
  number = {8},
  url = {https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears/audits/8},
  note = {Author version unspecified}
}

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "biogeobears security audit report (audit version 8)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
  - name: "brunoasm"
date-released: "2026-07-23"
url: "https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears/audits/8"
identifiers:
  - type: other
    value: "skillstore:brunoasm-biogeobears:audit:8"
    description: "Skillstore immutable audit report identifier"

Skillstore-Score

Warum dieser Score Evidenzvertrauen: Hoch

Architektur

Wartbarkeit

Inhalt

Gemeinschaft

Spezifikationskonformität

Was Sie erstellen können

Eine Ancestral-Range-Studie vorbereiten

Validierte Eingaben, Skripte und Dokumentation für eine phylogenetische Biogeografieanalyse einrichten.

Reproduzierbare BioGeoBEARS-Workflows lehren

Eine klare Ordnerstruktur und geführte Analyseschritte für Studierende erstellen, die historische Biogeografie lernen.

Daten vor dem Modell-Fitting prüfen

Abweichungen zwischen Baum und Geografie finden, bevor lange BioGeoBEARS-Optimierungsjobs ausgeführt werden.

Diese Prompts ausprobieren

Eine einfache Analyse starten

Hilf mir, eine BioGeoBEARS-Analyse vorzubereiten. Meine Baumdatei ist [tree path], meine Verbreitungsdatei ist [data path], und ich habe [number] Gebiete.

Geografiedaten validieren

Validiere meine Geografiedatei gegen diesen phylogenetischen Baum. Formatiere sie bei Bedarf für BioGeoBEARS um und erkläre alle Abweichungen bei Arten.

Modelle und Parameter auswählen

Empfiehl BioGeoBEARS-Modelle und die maximale Verbreitungsgebietsgröße für [taxon group] über [area list]. Erkläre die Abwägungen, bevor Skripte generiert werden.

Einen Publikations-Workflow erstellen

Erstelle einen reproduzierbaren BioGeoBEARS-Workflow mit Validierung, Modellvergleich, ancestral range plots, README-Hinweisen und Interpretationshilfe für eine Publikation.

Bewährte Praktiken

Baum- und Geografiedateien validieren, bevor das finale Analyseskript generiert wird.
Ursprüngliche Eingabedateien getrennt von umformatierten BioGeoBEARS-Eingaben aufbewahren.
Modellunsicherheit berichten, wenn AIC-Gewichte über Modelle hinweg ähnlich sind.

Vermeiden

Nicht alle Modelle ausführen, bevor Artnamen und tree rooting geprüft wurden.
Die maximale Verbreitungsgebietsgröße nicht nur deshalb wählen, weil sie rechnerisch praktisch ist.
Das beste AIC-Modell nicht ohne fachliche Prüfung als biologisch korrekt behandeln.