هل تحتاج إلى وصول سريع إلى معلومات الجينات أو بنى البروتينات أو بيانات التعبير؟ توفر هذه المهارة وصولاً موحداً إلى أكثر من 20 قاعدة بيانات للمعلومات الحيوية من خلال واجهة واحدة. ابحث عن الجينات، واسترجع التسلسلات، وتوقع البنى، وحلل الارتباطات بالأمراض دون تبديل الأدوات.

يتطلب العثور على مجموعات بيانات التعبير الجيني ومعالجتها التنقل عبر هياكل قواعد بيانات معقدة وصيغ ملفات متعددة. توفر هذه المهارة أنماط أكواد جاهزة للاستخدام للبحث والتنزيل وتحليل بيانات المصفوفات الدقيقة وRNA-seq من GEO.

العمل مع بيانات الفترات الجينومية لمهام التعلم الآلي يتطلب أدوات متخصصة. يوفر Geniml طرقًا غير خاضعة للإشراف لتعلم التمثيلات المضمنة للمناطق الجينومية والخلايا المفردة وتسميات البيانات الوصفية لعمليات البحث عن التشابه والتجميع والتحليل اللاحق.

البحث واسترجاع معلومات الجينات من قاعدة بيانات NCBI Gene. الحصول على رموز الجينات، تسلسلات RefSeq، تعليقات GO، المواقع الكروموسومية، والارتباطات النمطية للبحث والتحليل.

تتطلب هندسة البروتينات نماذج ذكاء اصطناعي متخصصة لتحليل العلاقات بين التسلسل والوظيفة والهيكل. توفر ESM نماذج لغوية بروتينية متقدمة لتوليد تسلسلات جديدة، والتنبؤ بالبنى، وتصميم بروتينات وظيفية من خلال الذكاء الاصطناعي متعدد الوسائط.

يحتاج باحثو الجينوم إلى الوصول إلى تسلسلات الجينات والمتغيرات والبيانات المقارنة عبر الأنواع. تستعلم هذه المهارة عن واجهة برمجة التطبيقات REST لقاعدة بيانات Ensembl لاسترجاع معلومات الجينات وتسلسلات DNA والتنبؤات المتغيرة والجينات المتماثلة والميزات التنظيمية لأكثر من 250 نوعًا من الفقاريات.

يتطلب العثور على تسلسل النوكليوتيدات وتحميلها فهم بناء جملة API معقد وأنماط نقاط نهاية متعددة. توفر هذه المهارة وثائق شغة للاستعلام عن أرشيف النوكليوتيدات الأوروبي لاسترجاع تسلسلات الحمض النووي/الحمض النووي الريبي ومجموعات الجينوم وقراءات التسلسل الخام بواسطة رقم الوصول.

يقوم Denario بأتمتة خط البحث الكامل من تحليل البيانات إلى النشر. يستخدم وكلاء الذكاء الاصطناعي لتوليد الفرضيات، وتطوير المنهجيات، وتنفيذ التجارب، وإنتاج أوراق بحثية بصيغة المجلات العلمية.

يحتاج باحثو السرطان إلى وصول برمجي إلى أكبر قاعدة بيانات للطفرات الجسدية في العالم. تتيح هذه المهارة التنزيل المصادق عليه لبيانات علم الجينوم السرطاني من COSMIC بما في ذلك الطفرات والتعليقات الجينية والمتغيرات السريرية للبحث والأورام الدقيقة.

يتطلب العثور على التجارب السريرية للمرضى أو البحث أو تطوير الأدوية التنقل في سجل معقد. توفر هذه المهارة واجهة Python للاستعلام عن قاعدة البيانات الرسمية لـ ClinicalTrials.gov. البحث بالحالة أو الدواء أو الموقع أو الراعي للعثور على تجارب التوظيف واسترداد معلومات الدراسة التفصيلية وتصدير البيانات للتحليل.

إدارة الاستشهادات يدويًا تستغرق وقتًا طويلاً وعرضة للأخطاء. تقوم هذه المهارة بأتمتة البحث في قواعد البيانات الأكاديمية، واستخراج البيانات الوصفية من DOIs وPMIDs، والتحقق من صحة الاستشهادات، وإنشاء إدخالات BibTeX جاهزة للنشر.

يتطلب العثور على بيانات اكتشاف الأدوية البحث في قواعد بيانات متعددة وفهم استعلامات API معقدة. توفر هذه المهارة وظائف جاهزة للاستخدام للاستعلام عن قاعدة بيانات ChEMBL التي تحتوي على أكثر من 2 مليون مركب نشط بيولوجياً و19 مليون قياس للنشاط البيولوجي ومعلومات الأدوية المعتمدة.

يحتاج الباحثون إلى وصول فعال إلى بيانات أحادية الخلية على نطاق السكان لدراسات الجينوم. توفر هذه المهارة وصولاً مدعوماً بالذكاء الاصطناعي إلى CZ CELLxGENE Census مع أنماط استعلام محسّنة وأدلة تكامل للتحليل اللاحق.

إيجاد معاملات حركية الإنزيم من الأدبيات يتطلب بحثاً مكثفاً. توفر هذه المهارة وصولاً مباشراً إلى قاعدة بيانات BRENDA من خلال واجهة بسيطة لاسترجاع قيم Km ومعادلات التفاعل وبيانات الإنزيم الخاصة بالكائن الحي للبحث الكيميائي الحيوي.

يحتاج الباحثون إلى استرجاع البيانات البيولوجية من قواعد بيانات متعددة. توفر هذه المهارة وصولاً موحداً إلى أكثر من 40 خدمة معلوماتية حيوية بما في ذلك UniProt و KEGG و ChEMBL و Reactome للحصول على تسلسلات البروتينات والمسارات والمركبات والتفاعلات.

يتطلب العثور على المطبوعات الأولية لعلوم الحياة التصفح اليدوي لموقع bioRxiv أو استخدام أدوات متعددة. توفر هذه المهارة واجهة Python موحدة للبحث بواسطة الكلمات المفتاحية والمؤلفين والفئات والنطاقات الزمنية، ثم تنزيل الأوراق البحثية والبيانات الوصفية بتنسيق JSON منظم.

تتطلب مهام أبحاث الطب الحيوي المعقدة معرفة متخصصة وخطوات تحليل متكررة. يقوم Biomni بأتمتة سير عمل البحث متعدد الخطوات عبر علم الجينوم واكتشاف الأدوية والطب الجينوم السريري باستخدام التفكير المدعوم بنماذج اللغة الكبيرة وقواعد البيانات الحيوية المتكاملة.

تتطلب الأبحاث الفلكية معالجة دقيقة للإحداثيات السماوية والوحدات الفيزيائية وتنسيقات البيانات المتخصصة. توفر هذه المهارة إرشادات خبيرة حول استخدام astropy لتحويلات الإحداثيات وعمليات ملفات FITS والحسابات الكونية وتحويلات المقاييس الزمنية.

توفر قاعدة بيانات AlphaFold أكثر من 200 مليون هيكل بروتيني متنبأ به بالذكاء الاصطناعي. تساعد هذه المهارة الباحثين على استرجاع ملفات الهياكل، وتحليل درجات الثقة، ودمج التنبؤات في خطوط العمل الحسابية لاكتشاف الأدوية وعلم الأحياء الهيكلي.

هل تصمم بروتينات لكن تفتقر إلى المختبر؟ أرسل التسلسلات مباشرة إلى المختبر السحابي الآلي من Adaptyv لاختبارات الارتباط، واختبارات التعبير، وقياسات الاستقرار الحراري، وتحليل نشاط الإنزيم. احصل على النتائج التجريبية في غضون 21 يومًا تقريبًا.